计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2041#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-1 22:53:53 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-1 20:14
谢谢老师,文件给错了,但是MP2的得到的那种结构用b3lyp就是优化不出来,而在其他异构体转化成b3lyp的那种 ...


本来MP2得到的结构的可靠性就<=B3LYP
你可以多用几种泛函,BP86、M06-2X等,或者更好的双杂化,如果结果都差不多,但都和MP2不符,说明MP2的不靠谱。

另外优化时候也尝试把步长上限改小点,如果那个极小点的势阱很浅,可能优化过程中一下子跑到其它极小点去。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

2042#
发表于 Post on 2016-9-2 08:43:46 | 只看该作者 Only view this author
太谢谢老师了!

25

帖子

0

威望

1367

eV
积分
1392

Level 4 (黑子)

2043#
发表于 Post on 2016-9-2 09:31:25 | 只看该作者 Only view this author
看了您的帖子“使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用”,有一个问题请教:您在文中比较的是同一个分子表面的静电势与平均离子化能。若两个不同分子(含有的元素部分不同)用相同水平基组优化后,可以通过比较分子表面静电势与平均离子化能中的最大、最小点 ,来预测它们哪个更容易发生反应吗?

32

帖子

0

威望

624

eV
积分
656

Level 4 (黑子)

2044#
发表于 Post on 2016-9-2 09:33:54 | 只看该作者 Only view this author
比如对于一个水分子,它的  1、电子密度,电荷分布,布居分析,ESP的区别是?   2、 做SP计算能有电子密度吧?gaussian怎么图形显示出来  

15

帖子

0

威望

65

eV
积分
80

Level 2 能力者

2045#
发表于 Post on 2016-9-2 16:16:13 | 只看该作者 Only view this author

赝势基组

请问铅原子用什么赝势基组?

管理员注:回复在2047L

1295

帖子

0

威望

6289

eV
积分
7584

Level 6 (一方通行)

2046#
发表于 Post on 2016-9-2 16:31:16 | 只看该作者 Only view this author
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2047#
发表于 Post on 2016-9-2 18:15:30 | 只看该作者 Only view this author
def2系列或LanL08(d)

评分 Rate

参与人数
Participants 2
eV +2 收起 理由
Reason
黯殇666 + 1 谢谢
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2048#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-2 20:15:33 | 只看该作者 Only view this author
非柳暗花明 发表于 2016-9-2 09:33
比如对于一个水分子,它的  1、电子密度,电荷分布,布居分析,ESP的区别是?   2、 做SP计算能有电子密度 ...

看此文6、8节
量子化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298

ESP看
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=219

用multiwfn绘制电子密度图,曲线图、平面图、等值面图的绘制看手册4.3、4.4、4.5节
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2049#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-2 20:23:54 | 只看该作者 Only view this author
believeht 发表于 2016-9-2 09:31
看了您的帖子“使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用”,有一个问题请教: ...

原理上可以

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
believeht + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

559

帖子

0

威望

6214

eV
积分
6773

Level 6 (一方通行)

2050#
发表于 Post on 2016-9-3 14:45:07 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,布局分析与前线轨道分析两者有何区别?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2051#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-3 18:10:04 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-3 14:45
请问老师,布局分析与前线轨道分析两者有何区别?


是布居分析不是布局分析
没有相关性
布居分析考察的是各个基函数、原子轨道、原子、片段带的电子数,计算布居数时要考虑所有占据轨道。这对于了解体系电子结构很有帮助。前线轨道只分析最高的几个和最低的几个分子轨道的分布而已,一般用来根据前线轨道理论讨论化学反应问题。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

559

帖子

0

威望

6214

eV
积分
6773

Level 6 (一方通行)

2052#
发表于 Post on 2016-9-4 00:12:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-3 18:10
是布居分析不是布局分析
没有相关性
布居分析考察的是各个基函数、原子轨道、原子、片段带的电子数, ...

谢谢老师,请问老师一般文献做的homo,lumo前线分子轨道图是用的mulliken布居吗?还是有其他布居方法?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2053#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-4 06:15:01 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-4 00:12
谢谢老师,请问老师一般文献做的homo,lumo前线分子轨道图是用的mulliken布居吗?还是有其他布居方法?


这根布居完全一丝关系都没有
绘制轨道图看
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

想了解布居分析的基本知识,看
原子电荷计算方法的对比http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml
幻灯片:Multiwfn与波函数分析简介
http://sobereva.com/239
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

559

帖子

0

威望

6214

eV
积分
6773

Level 6 (一方通行)

2054#
发表于 Post on 2016-9-4 11:35:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-4 06:15
这根布居完全一丝关系都没有
绘制轨道图看
使用Multiwfn观看分子轨道

多谢sob老师,是不是可以这样理解:
1.有些文献中分析homo和lumo图判断反应活性时,说成是分子轨道布居分析是不对的?应该说成前线轨道分析或直接说HOMO-LUMO分析?
2.还有这种HOMO、LUMO图判断反应性是不是不如fukui函数图好?

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2055#
发表于 Post on 2016-9-4 12:59:24 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-4 11:35
多谢sob老师,是不是可以这样理解:
1.有些文献中分析homo和lumo图判断反应活性时,说成是分子轨道布居 ...

(1) 分析HOMO LUMO(等值面图)和分析布居是两个不同的东西,都存在,都是对轨道这个三维函数的分析,做的是什么就写什么
(2)是

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 07:57 , Processed in 0.227345 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list