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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-4 17:32:34 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-4 11:35
多谢sob老师,是不是可以这样理解:
1.有些文献中分析homo和lumo图判断反应活性时,说成是分子轨道布居 ...


分析HOMO、LUMO,常用的就是看轨道等值面图,或者做轨道成分分析
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131
《亲电取代反应中活性位点预测方法的比较》
http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract28694.shtml

轨道的布居,就相当于做轨道成份分析,然后把结果再乘上轨道占据数。但是结论和轨道成分分析是一样的。所以直接就说做轨道成分分析就好了,不要说轨道布居,更不能说布居。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-9-6 10:39:22 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师你好,请问算单电子转移机理,比如A与•B反应,生成A+•和B-  ,对于算这样的反应,基组要加弥散吗?看了你以前写的博文,说在不知道该不该加弥散的情况下一律不要加,但是这个反应中有阴离子生成,是不是应该加上。问得很基础,希望老师见谅

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发表于 Post on 2016-9-6 12:12:22 | 只看该作者 Only view this author
chengxing545946 发表于 2016-9-6 10:39
Sob老师你好,请问算单电子转移机理,比如A与•B反应,生成A+•和B-  ,对于算这样的反应,基组 ...

阴离子要加弥散(至少在负电荷集中的地方加弥散)
P.S. 除非要研究气相过程,这种电荷分离的反应的溶剂化很难算准

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-7 05:39:03 | 只看该作者 Only view this author
chengxing545946 发表于 2016-9-6 10:39
Sob老师你好,请问算单电子转移机理,比如A与•B反应,生成A+•和B-  ,对于算这样的反应,基组 ...


优化、找过渡态、走IRC可以不加,算能量时加上(至少给带负电荷的位点的原子加上)
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发表于 Post on 2016-9-7 17:05:25 | 只看该作者 Only view this author

计算pi-pi堆积时的弱相互作用范德华力以及电荷转移的常用的且精确度高的方法是什么?

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发表于 Post on 2016-9-7 17:26:05 | 只看该作者 Only view this author
弱相互作用PWPB95-D3
CTE wB97XD

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-7 23:44:04 | 只看该作者 Only view this author
zhangyina 发表于 2016-9-7 17:05
计算pi-pi堆积时的弱相互作用范德华力以及电荷转移的常用的且精确度高的方法是什么?

乱谈激发态的计算方法
http://sobereva.com/265
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214
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发表于 Post on 2016-9-8 16:44:26 | 只看该作者 Only view this author

ADF计算离子状态

ADF计算团簇离子状态时,如何设置团簇为离子状态啊????急急急

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发表于 Post on 2016-9-8 22:16:18 | 只看该作者 Only view this author
设置CHARGE不是0不就是离子状态

另外打好几个问号感叹号“急急急”的一般全是一搜就能搜到的问题,除了反映出不甚礼貌之外、表现出来的是一般都不急,不然早就克服懒惰自己查去了。

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发表于 Post on 2016-9-9 09:23:52 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-9-8 22:16
设置CHARGE不是0不就是离子状态

另外打好几个问号感叹号“急急急”的一般全是一搜就能搜到的问题,除了 ...

奥,谢谢您,我刚注册的,不是很懂这里边的礼貌性以及习惯性,做得不对的还请谅解!

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发表于 Post on 2016-9-9 11:29:54 | 只看该作者 Only view this author
老师,我的体系会先形成一个大小在0.8-2.5kcal/mol的反应物的复合物,利用KiSThelP计算,如果按照单分子反应处理则log_10(k)-(1/T)的线性关系比较好,但如果按照双分子反应处理则线性关系不太好,是一条曲线(尤其是在温度较低的情况下)。请问这种的该如何处理呢?能不能把曲线数据先导出来,利用其它软件进行线性矫正呢?这样做不知道合适不?请老师指点一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-9 12:18:39 | 只看该作者 Only view this author
librakitty 发表于 2016-9-9 11:29
老师,我的体系会先形成一个大小在0.8-2.5kcal/mol的反应物的复合物,利用KiSThelP计算,如果按照单分子反 ...

三参数拟合还有个温度系数项
如果三参数拟合得好用三参数也行
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发表于 Post on 2016-9-9 13:20:38 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好。我想问一下关于基组的问题,在计算如In,Sn, Sb等元素时,aug-cc-pVTZ和aug-cc-pVTZ-pp有什么区别么?pp是什么意思呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-10 01:52:14 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2016-9-9 13:20
sob老师,您好。我想问一下关于基组的问题,在计算如In,Sn, Sb等元素时,aug-cc-pVTZ和aug-cc-pVTZ-pp有 ...


对这些元素aug-cc-pVTZ根本没有定义。-PP是赝势版本,不带-PP是全电子版本(只对前四周期才有定义)。
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发表于 Post on 2016-9-10 10:57:10 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian中分子构型描述如乙烯 c c1 1.3  h1 1.0 2 12.0  求解释

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