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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-28 21:04:10 | 只看该作者 Only view this author
Daniel_Arndt 发表于 2016-10-28 20:19
请问一下sob社长,在做IRC时出现“Convergence criterion not met.”的错误,是否可以直接应用你的博文《解 ...


多贴些信息。如果是重校正步不收敛,IRC里写LQA
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-10-28 21:23:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-10-28 14:47
参考
电子的定域性与相关穴
http://sobereva.com/94

拜谢sob老师提供的链接,谢谢。
淡泊以明志,宁静以致远。

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发表于 Post on 2016-10-28 22:49:25 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,在多原子分子体系中,有没有的办法给出分子中原子的原子轨道对某一个化学键的贡献。

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-29 06:46:42 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2016-10-28 22:49
请问老师,在多原子分子体系中,有没有的办法给出分子中原子的原子轨道对某一个化学键的贡献。

谢谢!

做NBO分析,考察对应那个键的NBO当中相应NAO系数
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发表于 Post on 2016-10-29 08:30:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-10-29 06:46
做NBO分析,考察对应那个键的NBO当中相应NAO系数

谢谢老师。

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发表于 Post on 2016-10-29 09:19:22 | 只看该作者 Only view this author
老师。你好。我在opt=ts的时候出现了这样的错误,应该如何改正呢?

QQ截图20161029091917.png (15.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 48)

QQ截图20161029091917.png

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发表于 Post on 2016-10-29 11:06:29 | 只看该作者 Only view this author
linux下 打开gaussview时,出现warning :Failed to locate Gaussian scratch directory. 求教sobereva老师

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发表于 Post on 2016-10-29 11:10:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-10-28 21:04
多贴些信息。如果是重校正步不收敛,IRC里写LQA

是这样的,没有加LQA时IRC的出错信息为
“ CORRECTOR INTEGRATION CONVERGENCE:
   Recorrection delta-x convergence threshold:    0.010000
   Delta-x Convergence NOT Met
Maximum number of corrector steps exceded.
Error termination via Lnk1e in /home/user/g09/l123.exe”,加了LQA后IRC的出错信息为
“ >>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(UM062X) =  -505.780867464     A.U. after  129 cycles
            NFock=128  Conv=0.92D-04     -V/T= 2.0089
<Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.6727 S= 0.4606
<L.S>= 0.000000000000E+00
KE= 5.013374186221D+02 PE=-2.712868303542D+03 EE= 9.342898398688D+02
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     0.6727,   after     0.0114
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home/user/g09/l502.exe”。
我想了解一下,你的博文《解决SCF不收敛问题的方法》中的解决方法是否适用于这种情况。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-29 15:40:20 | 只看该作者 Only view this author
Daniel_Arndt 发表于 2016-10-29 11:10
是这样的,没有加LQA时IRC的出错信息为
“ CORRECTOR INTEGRATION CONVERGENCE:
   Recorrection delta ...

适用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-29 15:41:19 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-10-29 09:19
老师。你好。我在opt=ts的时候出现了这样的错误,应该如何改正呢?

信息量不足不好说
如果对优化过程做了约束,尝试不同约束方式
如果没用约束,用opt=cartesian
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Aristotler 发表于 2016-10-29 11:06
linux下 打开gaussview时,出现warning :Failed to locate Gaussian scratch directory. 求教sobereva老师

确认GAUSS_SCRDIR环境变量设好了,并且那个路径确实存在
如果你不打算直接通过gview调用Gaussian做计算,不用管这个提示。
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发表于 Post on 2016-10-30 20:09:32 | 只看该作者 Only view this author
请教老师赝势基组。1、对于Hg Au Pt W等DFT计算结构时候用什么赝势基组好点,在能量计算的时候用什么基组好点(体系205-300个电子)。2、对于Pb Ag Sn I等DFT计算结构时候用什么赝势基组好点,在能量计算的时候用什么基组好点(体系205-300个电子)。3、对于Cu As Se  Br等DFT计算结构时候用什么赝势基组好点,在能量计算的时候用什么基组好点(体系205-300个电子)。
问题比较无聊,还是很期待老师的答案,有了老师的推荐,心里比较有底气

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-31 08:02:43 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-10-30 20:09
请教老师赝势基组。1、对于Hg Au Pt W等DFT计算结构时候用什么赝势基组好点,在能量计算的时候用什么基组好 ...

对于DFT来说
最便宜:都用lanl2DZ
中等:主族用Lanl08,过渡金属用lanl2TZ
理想:主族用lanl08(d),过渡金属用lanl2TZ(f)。或者都用SDD
单点要比优化高一档。

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发表于 Post on 2016-10-31 10:33:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-10-28 16:50
尝试int=ultrafine。如果无效把具体输入输出文件压缩后上传

感谢sob老师的回复。我自己测试了一下,发现不是输入文件的问题。bomd分子动力学模拟在我的centOS系统的g09下运行是没有问题的,但是放在学校的超算系统上面运行就会出现这个问题。Allocation failure for numerical quadrature. 这是怎么回事?难道是gaussian版本的问题?还是学校超算系统的问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-31 11:39:36 | 只看该作者 Only view this author
Eric 发表于 2016-10-31 10:33
感谢sob老师的回复。我自己测试了一下,发现不是输入文件的问题。bomd分子动力学模拟在我的centOS系统的g ...

应该是版本问题
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