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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-2-9 15:23:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 believeht 于 2017-2-9 16:33 编辑

Sob老师,可以通过分析ESP和ALIE的极小点分布来共同预测分子表面哪个部位最容易夺取另一分子的质子吗?

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发表于 Post on 2017-2-9 15:46:29 | 只看该作者 Only view this author

高斯拷基组计算出错

计算OSCN这种分子,想用TZP基组计算,从EMSL上拷基组(直接复制粘贴的),linux系统下高斯计算出错,输入输出文件如附件,请问应该如何解决,谢谢!PS:哪里可以找到各个原子的TZ2P+基组定义。

OSCNnbo.gjf (5.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)
OSCNnbo.log (7.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)


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发表于 Post on 2017-2-9 17:13:13 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2017-2-9 17:32:14 | 只看该作者 Only view this author
看论坛中Gaussian FAQ对segmentation violation和几种L502 错误的解释。

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发表于 Post on 2017-2-9 17:32:14 | 只看该作者 Only view this author
看论坛中Gaussian FAQ对segmentation violation和几种L502 错误的解释。

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发表于 Post on 2017-2-9 17:40:19 | 只看该作者 Only view this author
你这个不要用赝势把。。。。怎么来了pseudo=read

OSCNnbo.gjf

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发表于 Post on 2017-2-9 17:41:50 | 只看该作者 Only view this author
关键词加nosymmetry

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发表于 Post on 2017-2-9 18:44:58 | 只看该作者 Only view this author

好的  谢谢

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发表于 Post on 2017-2-9 18:45:10 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-2-9 17:32
看论坛中Gaussian FAQ对segmentation violation和几种L502 错误的解释。

好的   非常感谢

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发表于 Post on 2017-2-9 19:54:15 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-2-9 17:40
你这个不要用赝势把。。。。怎么来了pseudo=read

谢谢,我试过可以了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-9 21:56:15 | 只看该作者 Only view this author
believeht 发表于 2017-2-9 15:23
Sob老师,可以通过分析ESP和ALIE的极小点分布来共同预测分子表面哪个部位最容易夺取另一分子的质子吗?

原理上可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-9 22:03:01 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2017-2-9 08:34
请问老师,计算氮原子掺杂石墨烯的形成能时,(1)文献中有用化学势计算的,有用能量计算的,用哪个更好? ...

建议你在第一性原理板块单独发帖提问,应该有比我更熟悉此问题的人回答你
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-2-9 22:08:55 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2017-2-8 21:02
老师,错误结果我粘贴上了,请再看一下。顺便问一下,linux窗口的执行结果是通过符号>>的方式追加到文件 ...


我这里计算无任何问题。
如果你的输入文件是在windows下编辑的,如果用老版本linux运行,要用dos2unix转化一下,否则一些换行符无法被识别。或者用cat命令在linux下面显示文件内容,看是否格式还都对。

不明白你的意思,就直接从输出文件末尾里面拷一段粘贴到帖子里就完了。
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发表于 Post on 2017-2-9 22:27:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-2-9 22:03
建议你在第一性原理板块单独发帖提问,应该有比我更熟悉此问题的人回答你

谢谢老师。

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发表于 Post on 2017-2-9 22:32:42 | 只看该作者 Only view this author

Thanks

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