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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-2-28 21:51:49 | 只看该作者 Only view this author
文献放错图了。

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发表于 Post on 2017-2-28 21:58:22 | 只看该作者 Only view this author

重水做溶剂,Gaussian关键字如何写

计算分子NMR时,用重水做溶剂,请教Gaussian关键字如何写呢?(scrf=(solvent=heavy water/deuteroxide)都会报错 )

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发表于 Post on 2017-2-28 22:52:19 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,如果一个反应是A=A2-+2H+(2个氢离子),那么用高斯计算反应式的吉布斯自由能时,这个氢离子是按照0算吗?

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发表于 Post on 2017-3-1 00:00:12 | 只看该作者 Only view this author
用水就行 pcm区别不了重水和水

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发表于 Post on 2017-3-1 02:48:03 | 只看该作者 Only view this author
请问计算Electron collision time所需的两个材料常数A/B(如金的是1.2×10e7 和1.23×10e11,现在需要其他材料的)在哪里可以查到?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 06:01:33 | 只看该作者 Only view this author
423444 发表于 2017-2-28 21:47
请教各位大神们,看一篇文献计算的HOMO 和 LOMO 分布图完全一致,感觉奇怪,重复了一下,发现我计算的HOMO  ...

不要把LUMO打成LOMO
本来就该不一样,甭管文献
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 06:02:27 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2017-2-28 21:42
老师您好,问您几个问题:
1.Zero-point correction=   xxxx  这个数值对于算G有什么用处呢?
2.我想用m0 ...


1 G里已经体现了ZPE,看一下内容了解热力学量是怎么算的
两篇热力学数据计算的入门介绍文章
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=123

2 直接写M06/def2TZVP,其它什么都不需要写
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 06:03:37 | 只看该作者 Only view this author
janeli1995 发表于 2017-3-1 02:48
请问计算Electron collision time所需的两个材料常数A/B(如金的是1.2×10e7 和1.23×10e11,现在需要其他 ...

不清楚,没听说过这个
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 06:04:01 | 只看该作者 Only view this author
jhlwc545454 发表于 2017-2-28 22:52
sob老师您好,如果一个反应是A=A2-+2H+(2个氢离子),那么用高斯计算反应式的吉布斯自由能时,这个氢离子 ...


质子的自由能并不为零,你对质子做个freq就看出来了,其平动对热力学量有贡献
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 06:10:37 | 只看该作者 Only view this author
lp2014 发表于 2017-2-28 21:58
计算分子NMR时,用重水做溶剂,请教Gaussian关键字如何写呢?(scrf=(solvent=heavy water/deuteroxide)都 ...

不要随意写溶剂名、自行发挥,哪些可以直接写看手册里scrf关键词里的列表
隐式溶剂模型区分不了轻水重水,实际上做这个区分也毫无意义
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发表于 Post on 2017-3-1 08:44:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 erya123 于 2017-3-1 08:46 编辑

老师,linux下运行完成后,cat 命令查看log文件可以显示;为什么cat命令查看chk文件刚开始显示方块字符。后来显示的字符如第二幅图所示:
第一幅:是输入文件的截图。

猎豹截图20170301084029.png (13.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

猎豹截图20170301084029.png

猎豹截图20170301082423.png (21.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

猎豹截图20170301082423.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 09:22:57 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-3-1 08:44
老师,linux下运行完成后,cat 命令查看log文件可以显示;为什么cat命令查看chk文件刚开始显示方块字符。后 ...

chk是二进制文件,不是人类可读的
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发表于 Post on 2017-3-1 11:04:08 | 只看该作者 Only view this author

高斯优化激发态

需要优化一个分子的激发态,分子有C,H,O组成,大约50个原子,但不知道关键词应该咋样写
#p opt td b3lyp/6-31+g(d) scrf=(solvent=toluene) geom=connectivity
还是#p opt td=(singlets,nstates=10,root=1) b3lyp/6-31+g(d) scrf=(solvent=toluene) geom=connectivity
看了一些帖子说Nstates设置的越大越精确,现在迷惑需不需要写nstates,应该写多大,应该用第一种还是第二种呢,我看大部分人都用的第二种形式,但是我上次用的第一种形式也计算完成了,只是花的时间有些长,请各位大神指导一下,谢谢!


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发表于 Post on 2017-3-1 11:12:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-1 06:01
不要把LUMO打成LOMO
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谢谢大神,不好意思,下次注意。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 11:25:27 | 只看该作者 Only view this author
ybb122 发表于 2017-3-1 11:04
需要优化一个分子的激发态,分子有C,H,O组成,大约50个原子,但不知道关键词应该咋样写
#p opt td b3lyp/ ...

仔细看此文就懂了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
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