计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

10

帖子

0

威望

59

eV
积分
69

Level 2 能力者

3046#
发表于 Post on 2017-3-1 12:03:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-1 11:25
仔细看此文就懂了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314

看了帖子明白了,没有写的都采取了默认值,谢谢Sob老师!!!

31

帖子

0

威望

121

eV
积分
152

Level 3 能力者

3047#
发表于 Post on 2017-3-1 16:31:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-1 06:04
质子的自由能并不为零,你对质子做个freq就看出来了,其平动对热力学量有贡献

谢谢sob老师!

52

帖子

0

威望

1302

eV
积分
1355

Level 4 (黑子)

3048#
发表于 Post on 2017-3-1 18:21:59 | 只看该作者 Only view this author
老师,请问这个错误是怎么回事?google了下有人说是chk硬盘空间不足,硬盘还有200g感觉不像;有人说是g09d01的bug,小白不太明白。请问这是怎么回事?输入文件是G09W.D01自带tests里的test0837.gjf,谢谢老师

QQ图片20170301181733.png (43.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

QQ图片20170301181733.png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3049#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-1 18:49:59 | 只看该作者 Only view this author
PhoenixYeti 发表于 2017-3-1 18:21
老师,请问这个错误是怎么回事?google了下有人说是chk硬盘空间不足,硬盘还有200g感觉不像;有人说是g09d0 ...

图中第二行提示了,此文件不存在
如果从chk中读取信息,不用这种做法即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

52

帖子

0

威望

1302

eV
积分
1355

Level 4 (黑子)

3050#
发表于 Post on 2017-3-1 18:54:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-1 18:49
图中第二行提示了,此文件不存在
如果从chk中读取信息,不用这种做法即可

谢谢老师解答

175

帖子

0

威望

2136

eV
积分
2311

Level 5 (御坂)

3051#
发表于 Post on 2017-3-2 11:09:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,想问您一下guess=mix命令一般在什么情况下使用?如果我的优化因收敛失败而报错,加上这个命令以后算出来的HOMO/LUMO是不是不能直接分析呢?
It's my life and it's now or never

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3052#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-2 13:52:01 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2017-3-2 11:09
sob老师,想问您一下guess=mix命令一般在什么情况下使用?如果我的优化因收敛失败而报错,加上这个命令以后 ...

用的场合和方式看此文
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

此文没说的情况没必要用
这跟优化没直接关系

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
wrtgcn + 4 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1102

帖子

18

威望

6703

eV
积分
8165

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

3053#
发表于 Post on 2017-3-2 14:56:06 | 只看该作者 Only view this author
通过振子强度和两个态之间的能量差就可以根据爱因斯坦公式计算激发态寿,计算公式为:寿命τ=3/(2*f*ΔE^2)。最近有个审稿人要求提供这个公式的参考文献,不知道Sob老师有没有推荐引用的文章呢?
Stand on the shoulders of giants

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3054#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-2 18:00:30 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-2 14:56
通过振子强度和两个态之间的能量差就可以根据爱因斯坦公式计算激发态寿,计算公式为:寿命τ=3/(2*f*ΔE^2) ...

J Comput Chem 26: 1214–1221, 2005

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
冰释之川 + 5 非常感谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

122

帖子

0

威望

2336

eV
积分
2458

Level 5 (御坂)

3055#
发表于 Post on 2017-3-3 08:48:54 | 只看该作者 Only view this author

高斯 报错 求助

本帖最后由 my_aman 于 2017-3-3 10:20 编辑

老师 大神们好 :
我在高斯上计算38原子二元金属团簇时使用
%Mem=8GB
#P SVWN/LanL2DZ Opt

0 1
设置SCF=noiincfock 或者 SCF=conver=6 或者SCF=vshift=500
在linux系统总是报错 l1.exe,但是在windows系统软件上用 却能算,请问 怎么修改呢???这是为什么呢?求大神指点 新手一枚

]Z~NYDD)EX9X$98BOUM5@8U.png (5.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

高斯输入文件

高斯输入文件

Ag4Cu34-1-opt.log

4.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

高斯输出报错

Ag4Cu34-1-o.log

4.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

输出报错

Ag4Cu34-1-op.log

4.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

输出报错

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3056#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-3 09:20:02 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-3-3 08:48
老师 大神们好 :
我在高斯上计算38原子二元金属团簇时使用
%Mem=8GB


noiincfock应当为noincfock
把报错时对应的输入输出文件传上来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

122

帖子

0

威望

2336

eV
积分
2458

Level 5 (御坂)

3057#
发表于 Post on 2017-3-3 10:33:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-3 09:20
noiincfock应当为noincfock
把报错时对应的输入输出文件传上来

sob老师已上传报错文件等,请指正谢谢老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3058#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-3 17:18:24 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-3-3 10:33
sob老师已上传报错文件等,请指正谢谢老师

关键词用得完全不对
Opt=noincfock
Opt=vshift=500
Opt=conver=6

这些都应当把opt改成SCF。注意看手册,哪些关键词里面能用哪些选项
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

122

帖子

0

威望

2336

eV
积分
2458

Level 5 (御坂)

3059#
发表于 Post on 2017-3-3 18:45:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-3 17:18
关键词用得完全不对
Opt=noincfock
Opt=vshift=500

不好意思 老师 粗心 写错了 下次一定注意  请问 老师 我在文献上看的是这种方法优化9个原子的 ,我用此方法优化38个原子的可以吗  谢谢老师了

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

3060#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-3 20:45:39 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-3-3 18:45
不好意思 老师 粗心 写错了 下次一定注意  请问 老师 我在文献上看的是这种方法优化9个原子的 ,我用此方 ...

优化得了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 20:05 , Processed in 0.203888 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list