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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-12-4 09:36:24 | 只看该作者 Only view this author
老师,寻找local minimum和transition state的时候,设置不同的多重度,比如设置多重度分别为1和3,最后优化得到的结构是不是不一样?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-4 12:54:27 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2017-12-4 09:36
老师,寻找local minimum和transition state的时候,设置不同的多重度,比如设置多重度分别为1和3,最后优 ...

明显不一样
势能面都不一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-12-4 14:50:56 | 只看该作者 Only view this author
大家好~请教个困惑已久的问题,
fundamental frequency, harmonic frequency, anharmonic frequency
分别是什么?它们之间有什么区别呢?
谢谢大家~

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发表于 Post on 2017-12-4 14:59:32 | 只看该作者 Only view this author
请问一下sob老师:
CBS limit 外推时,用的为Duuning's 的基组 cc-pvnz (2,3,4)
外推公式为三参数方程:E(n)=CBS+A/e^(n-1)+B/e^((n-1)^2)
参考文献为:
1994--Benchmark calculations with correlated molecular wave functions. IV. The classical barrier height of the H+H2→H2+H reaction.
请问就是简单的解三元三次方程组吗?
为什么求解的CBS limit和文章中的不一样?
cc-pVDZ:-154.529428
cc-pVTZ:-154.699789
cc-pVQZ:-154.748621谢谢~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-4 15:19:45 | 只看该作者 Only view this author
尚艳磊 发表于 2017-12-4 14:59
请问一下sob老师:
CBS limit 外推时,用的为Duuning's 的基组 cc-pvnz (2,3,4)
外推公式为三参数方程:E ...


我暂时没时间细看,你就按此文做就行了,准没错
谈谈能量的基组外推
http://sobereva.com/172
外推公式有很多,结果也会有所不同,上文的做法是最省事、最常用的。
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发表于 Post on 2017-12-4 18:34:41 | 只看该作者 Only view this author

求助——想学习用Q-Chem计算interaction energy的方法

各位老师、前辈们好,请老师和各位前辈指教,用Q-Chem计算interaction energy,怎么操作,有什么帖子或者手册需要初学者先看的吗?
谢谢老师、前辈们!

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发表于 Post on 2017-12-4 19:28:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-4 12:54
明显不一样
势能面都不一样

如图所示,TS1a-LA2、TS2-LA2等结构对应singlet和triplet的能量值是同一个结构吗?

1111.jpg (13.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

1111.jpg

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发表于 Post on 2017-12-4 19:42:30 | 只看该作者 Only view this author
Sob 老师,   下图是Feo+的分子轨道图  请问:
①这个图是怎么得来的,是通过计算方法直接得到还是凭借相应知识自己画出来的,我该怎样才能自己得到这样的图
②图上的电子该怎么对应上相应的原子  如 氧原子对应什么电子   Fe对应什么电子

746766857537374345.jpg (120.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

746766857537374345.jpg

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发表于 Post on 2017-12-4 20:52:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-15 20:33
VMD就可以,graphics-representation里建立两个rep,不同选区,不同显示方式

sob老师,更具体的步骤麻烦能再指点一下吗?现在还是操作不来 VMD手册上有吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-4 21:02:39 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2017-12-4 18:34
各位老师、前辈们好,请老师和各位前辈指教,用Q-Chem计算interaction energy,怎么操作,有什么帖子或者手 ...

不管是用什么程序,计算相互作用能都是计算复合物的能量,然后减去两个单体的能量。
复合物计算能量前需要先优化。计算单体能量时候用的结构通常是从复合物优化后的坐标中直接提取的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-4 21:03:51 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2017-12-4 19:28
如图所示,TS1a-LA2、TS2-LA2等结构对应singlet和triplet的能量值是同一个结构吗?

看文中具体描述。如果过渡态只是在一个自旋多重度下找的,那么结构相同。如果分别是在两个自旋多重度下找的,结构就不同。
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不懂计算 发表于 2017-12-4 20:52
sob老师,更具体的步骤麻烦能再指点一下吗?现在还是操作不来 VMD手册上有吗?

远程说不清楚,进入graphics设定界面,稍微把玩一下选项就会
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yangjianfeng 发表于 2017-12-4 19:42
Sob 老师,   下图是Feo+的分子轨道图  请问:
①这个图是怎么得来的,是通过计算方法直接得到还是凭借相 ...


对FeO+六重态进行优化,最后会给你各个轨道的能量。把能量由高到低绘制成这种图就完了,chemdraw就可以。图中纵坐标不是按照能量精确确定横杠的位置的,只是个定性示意。

这些轨道都是分子轨道,不直接对应哪个原子。
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发表于 Post on 2017-12-4 21:16:56 | 只看该作者 Only view this author
老师,购买NBO6.0的时候需要开通银行卡的什么功能?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-4 21:36:09 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2017-12-4 21:16
老师,购买NBO6.0的时候需要开通银行卡的什么功能?


什么都不需要开通,有卡号,还有背面的安全码,就可以支付。
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