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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-2-5 21:12:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-5 14:39
1 一般振动分析都是在谐振近似下进行的,此时频率会被系统性高估,因此要乘校正因子来修正。看
谈谈谐振 ...

非常感谢社长的详细解答,谢谢谢谢谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-2-6 03:31:42 | 只看该作者 Only view this author
doublelbegins 发表于 2018-2-5 16:03
老师您好,想向老师请教一下附件里的频率计算的任务顺利收敛了且查看后没有虚频,但是用GaussView打开显示f ...

gv5的bug,gv6打开无问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-2-6 09:44:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-6 03:31
gv5的bug,gv6打开无问题

谢谢,辛苦老师了!

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发表于 Post on 2018-2-6 13:42:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-5 14:28
需要加
但如果是横向对比目的,前后分子数都相同,由于相减时候会抵消,可以不用考虑这项

好的,我明白了,非常感谢!

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发表于 Post on 2018-2-7 15:44:56 | 只看该作者 Only view this author

请教一下自旋多重度为2的结构基团优化后的homo、lumo轨道判断

优化了单自由基的基态结构,opt+freq ub3lyp/6-31g*,得到的结构如何去判断HOMO/LUMO结构?
以及相关的轨道电子云分布?有人说开壳层体系无homo/lumo概念,为somo/lumo概念,该如何判断该结构的somo/lumo轨道呢以及电子云。
谢谢。

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发表于 Post on 2018-2-7 16:27:14 | 只看该作者 Only view this author
大家下午好,可否请教一个关于三苯胺能隙的问题:
本人采用b3lyp/6-31g(d)优化三苯胺分子,优化完成后,得到能级数据如下:LUMO为-0.297eV,HOMO为-4.946eV,能隙为4.649ev,导师说LUMO数据有问题,能隙不符合逻辑。
于是改用b3lyp/6-3111g(d,p)优化,优化完成后,得到能级数据如下:LUMO为-0.904eV,HOMO为-5.308eV,能隙为4.404eV。
之前用b3lyp/6-31g(d)算的其他染料分子的能隙大概在2eV左右,这次算的三苯胺分子能隙达到4eV,导师说理论上不应该这么大,我也不知道是什么情况,希望大家指点一二

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-2-7 17:47:48 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2018-2-7 15:44
优化了单自由基的基态结构,opt+freq ub3lyp/6-31g*,得到的结构如何去判断HOMO/LUMO结构?
以及相关的轨 ...

记得上传较大文本型文件前必须压缩以节约宝贵的论坛空间


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-2-7 17:50:23 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2018-2-7 16:27
大家下午好,可否请教一个关于三苯胺能隙的问题:
本人采用b3lyp/6-31g(d)优化三苯胺分子,优化完成后, ...

没有理由说计算结果有问题,使用的计算级别对于当前体系完全合理,轨道能量也很正常
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发表于 Post on 2018-2-7 20:17:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-7 17:47
记得上传较大文本型文件前必须压缩以节约宝贵的论坛空间

谢谢sober老师,再请教一下,如果是自由基的话应该是限制性开壳层还是非限制性开壳层?
带一个正负电荷的基团采用限制性开壳层还是非限制性开壳层?谢谢,两种方法的能量差异大么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-2-7 22:35:32 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2018-2-7 20:17
谢谢sober老师,再请教一下,如果是自由基的话应该是限制性开壳层还是非限制性开壳层?
带一个正负电荷 ...

如果没有特殊情况,只要是开壳层体系,一律用非限制性开壳层形式计算。RO形式比U计算慢得多,而且不容易收敛,结果一般也不如U好
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发表于 Post on 2018-2-8 13:37:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-7 22:35
如果没有特殊情况,只要是开壳层体系,一律用非限制性开壳层形式计算。RO形式比U计算慢得多,而且不容易 ...

谢谢

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发表于 Post on 2018-2-8 15:13:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lily19830130 于 2018-2-8 15:14 编辑

老师,分子A 和催化剂C反应,第一步脱去一分子水,同时生成分子B;然后新的分子B和催化剂C继续反应,请问第一步生成完水分子,原子数目少了,反应路径曲线上最后一点的能量值包含水分子还是不包括?如图所示:

1111.jpg (22.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

1111.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-2-8 15:24:51 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-2-8 15:13
老师,分子A 和催化剂C反应,第一步脱去一分子水,同时生成分子B;然后新的分子B和催化剂C继续反应,请问第 ...


包括
对于第一步来说,产物就是B+水,所以描述第一步能量变化的时候水得有
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发表于 Post on 2018-2-8 17:01:06 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 上完动力学的课有一些地方不知道想的对不对,请教您:

用MD模拟一个体系,比如说水盒子,和用量化方法优化这个水盒子,两者对比。 可否认为MD模拟的过程,是水盒子这个“特大分子”在各个“构象”之间转变的过程;而量化优化出的是水盒子这个“特大分子”的各个“构象”?

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发表于 Post on 2018-2-8 17:21:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-2-8 15:24
包括
对于第一步来说,产物就是B+水,所以描述第一步能量变化的时候水得有

谢谢老师!那后面的反应历程,怎么办?不用找中间体的结构,直接找过渡态吗?

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