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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-6 13:21:44 | 只看该作者 Only view this author
戴上墨镜看世界 发表于 2018-3-6 10:56
请问一下,计算完两个分子之间的相互作用能之后,想进一步分析,除了分析氢键能之外还有什么方法呀?还有就 ...


Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

我不知道你说的dw是什么。如果是vdw,用博文中的方法能充分展现和考察
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2018-3-6 14:22:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-6 13:21
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

谢谢老师!

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发表于 Post on 2018-3-6 14:43:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-6 13:19
光从曲线上没有必然问题

老师您帮我看看吧,我上传到百度网盘上了,IRC这个文件,我一直就没找到前面的过渡态,老师说我的断键过程是不合理的。前面应该有过渡态,但是我做IRC是直接到的反应物,并没有中间体(自己构造模型,确实有个中间体)。很迷茫,不确定应不应该继续找下去。麻烦老师了。https://pan.baidu.com/disk/home?errno=0&errmsg=Auth%20Login%20Sucess&&bduss=&ssnerror=0&traceid=#list/path=%2F&vmode=list

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发表于 Post on 2018-3-6 18:46:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-6 13:21
对有机体系,可以用Multiwfn算拉普拉斯键级,这体现的是共价键级
用NBO的NRT分析,给出的键级也会把离子 ...

谢谢社长!

有没有定量表达的参数?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-6 21:03:57 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2018-3-6 18:46
谢谢社长!

有没有定量表达的参数?

我说的拉普拉斯键级和NRT键级已经是定量的了
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发表于 Post on 2018-3-6 23:41:57 | 只看该作者 Only view this author
显示正常结束,log文件中opt的四个条件都YES,但是显示failure reading molecule specification的文本框,gv里面没有分子结构。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-7 07:10:38 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-3-6 23:41
显示正常结束,log文件中opt的四个条件都YES,但是显示failure reading molecule specification的文本框,gv ...


如果不是gv6尝试gv6
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发表于 Post on 2018-3-7 09:43:08 | 只看该作者 Only view this author
扫描的时候遇到输入语法错误,感觉没有错吧????求助一下~感谢大神帮助!
#p opt=modredundant td=(nstates=6) M062X/6-31g(d,p) scrf=(LR-pcm,solve
nt=water)
----------------------------------------------------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
6) M062X/6-31g(d,p) scrf=(LR-pcm,solvent
                           '
Last state= "SCR2"
TCursr=    185585 LCursr=        58
Error termination via Lnk1e in /apps/chem/Gaussian/G09_D01/g09/l1.exe at Wed Mar  7 09:40:47 2018.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

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发表于 Post on 2018-3-7 11:36:46 | 只看该作者 Only view this author

分子轨道问题

计算分子轨道的什么,每个分子轨道都有α-自旋和β-自旋,我们一般看α-自旋,这是为什么?两个的区别是什么?有没有解释这方面的文献?求各位大师解惑,不胜感激!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-7 14:08:57 | 只看该作者 Only view this author
zhaoxy 发表于 2018-3-7 09:43
扫描的时候遇到输入语法错误,感觉没有错吧????求助一下~感谢大神帮助!
#p opt=modredundant td=(ns ...

没有LR-PCM的写法
不要自己造关键词
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-7 14:10:29 | 只看该作者 Only view this author
无耻狡辩 发表于 2018-3-7 11:36
计算分子轨道的什么,每个分子轨道都有α-自旋和β-自旋,我们一般看α-自旋,这是为什么?两个的区别是什 ...


没有“一般看α-自旋”之说
看哪套轨道,或者都看,完全取决于你看轨道想干什么
这种最基础知识不是看文献的事,文献不教“什么是分子轨道”这种些基础知识,这是阅读量化基本理论书籍的事,在科音的量化初级班里也会详细讲
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发表于 Post on 2018-3-7 16:32:54 | 只看该作者 Only view this author
请问,对于化学反应,能量统计时必须要考虑零点校正能吗?如果不考虑可以吗?原因?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-7 17:41:43 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2018-3-7 16:32
请问,对于化学反应,能量统计时必须要考虑零点校正能吗?如果不考虑可以吗?原因?


看你具体算什么问题
要计算热力学数据的时候不是光考虑ZPE,而是要考虑当前研究温度下的热力学校正量。光考虑个ZPE什么也不是
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发表于 Post on 2018-3-7 18:20:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-7 17:41
看你具体算什么问题
要计算热力学数据的时候不是光考虑ZPE,而是要考虑当前研究温度下的热力学校正量 ...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-7 19:13:26 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2018-3-7 18:20
计算Electronic Energy (EE)

既然算的是电子能量,显然就没ZPE的事
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