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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 04:27:59 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2018-5-29 23:38
老师,我看了一下,在载入fch时候,计算的积分值是没有问题的。三重态的接近2.0,五重态的接近4.0。而在 ...

别管那个,毫无意义
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 04:28:20 | 只看该作者 Only view this author
jackieiii 发表于 2018-5-29 21:18
好的,卢老师,我按照你的提示,然后再去做了一下irc,可以正常结束,但是,这个点就是现在这样子2个点就 ...

这类问题这里说过
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 04:28:35 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-5-29 21:13
sob老师好,图中所示是其中一个优化好的AB复合物构型,如果算结合自由能的话,想要得到片段A(B)的自由 ...

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发表于 Post on 2018-5-30 09:25:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-30 04:27
别管那个,毫无意义

好的,谢谢老师解答

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发表于 Post on 2018-5-30 10:46:44 | 只看该作者 Only view this author
老师,multiwfn里面怎么没有功能19(准备查看定域轨道)。是fchk文件里面没有保存什么信息吗?

1111.jpg (98.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

1111.jpg

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发表于 Post on 2018-5-30 12:07:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ABetaCarw 于 2018-5-30 12:12 编辑


老师好,我想参考老师在讲解溶剂模型时候给的计算pKa的算例研究某物质的pKa。
这个物质4个可以脱掉的H ,通过化学直觉我不知道它最先脱掉什么。我该如何确定脱H 位置顺序?
是不是可以这样做:每个都试一下计算pKa 然后比较哪个最低。
这个不是准备用来发文章 是要验证一个绕不开的猜想。
iBond数据库里面没有这个物质的pKa
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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发表于 Post on 2018-5-30 12:15:58 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ABetaCarw 于 2018-5-30 12:20 编辑
lily19830130 发表于 2018-5-30 10:46
老师,multiwfn里面怎么没有功能19(准备查看定域轨道)。是fchk文件里面没有保存什么信息吗?

吐槽一句你的版本号。先升级一下最新版再试试。
我拖了一个gjf文件进去都能看到19号,当然啦 真的输入19回车 还是会报错的。我用的3.5版本
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 18:06:51 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-5-30 10:46
老师,multiwfn里面怎么没有功能19(准备查看定域轨道)。是fchk文件里面没有保存什么信息吗?


总是要用Multiwfn最新版本,总要勤快更新Multiwfn版本
博文中的版本明显比你的新
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 18:13:30 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-5-30 12:07
老师好,我想参考老师在讲解溶剂模型时候给的计算pKa的算例研究某物质的pKa。
这个物质4个可以脱掉的H  ...

可以都算pka
嫌麻烦的话也可以用波函数分析方法讨论,见Journal of Computational Chemistry 2018, 39, 117–129。
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发表于 Post on 2018-5-30 21:54:44 | 只看该作者 Only view this author
老师,关于搜索MECP的教程。我看了您的博客http://sobereva.com/286,感觉还是有点不明白。博文中说Input_Header_A和Input_Header_B两个文件中的坐标是不同态的结构。但是不同态的反应路径中,得到最终的产物,可能单重态需要6步(5个过渡态),多重态需要4步(3个过渡态),那这个能量交叉点(MECP)是不是和作图有关系啊?

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发表于 Post on 2018-5-30 22:52:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!能不能请教您两个问题:找过渡态时out文件中A92   L(9,29,53,30,-1)      193.6053         calculate D2E/DX2 analytically,中L后边的数字代表什么意思?L为-2又代表什么?

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发表于 Post on 2018-5-30 23:14:59 | 只看该作者 Only view this author
请问大博士,优化富氧自由基HOOO应该当作双自由基么,此时应该考虑对称性破缺的问题么?
自己决定自己的DNA

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 23:18:28 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2018-5-30 23:14
请问大博士,优化富氧自由基HOOO应该当作双自由基么,此时应该考虑对称性破缺的问题么?

用stable检测一下闭壳层波函数的稳定性就清楚了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 23:18:57 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-5-30 22:52
sob老师您好!能不能请教您两个问题:找过渡态时out文件中A92   L(9,29,53,30,-1)      193.6053         c ...

linear bend,看Gaussian手册opt关键词部分的说明
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-30 23:19:47 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-5-30 21:54
老师,关于搜索MECP的教程。我看了您的博客http://sobereva.com/286,感觉还是有点不明白。博文中说Input_H ...


如博文所述,这俩文件记录的是坐标之前的部分,不含坐标。

和作图没有什么关系
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