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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-27 00:12:26 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-5-27 00:06
老师,经过计算单重态的反应路径能垒较低,反应路径中中间体,过渡态的波函数是不是都必须是稳定的?还有有 ...

如果说整个反应路径上所有驻点都是单重态能量最低,那么从头到尾单重态波函数一直都是稳定的
如果只是某一步单重态的中间体、过渡态能量比其它多重度更低,那没法说其它基元步骤中依然是单重态能量最低
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发表于 Post on 2018-5-27 08:34:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-27 00:12
如果说整个反应路径上所有驻点都是单重态能量最低,那么从头到尾单重态波函数一直都是稳定的
如果只是某 ...

老师,为了确定反应路径到底是单重态还是多重态,我计算了单重态(1)和多重态(3)的反应路径,发现多重态(3)的反应路径的能垒均要高于单重态(1)的(但是起始的中间体的能量是多重态比单重态稳定),得到反应产物需要的步骤也不一样。这种确定是不是不对?文献上是这样确定的,把单重态的反应路径计算完之后,直接在单重态每一步的分子结构下计算多重态的能量,这样单重态和多重态之间比较时步骤数量是一样的,可以对比每一步单重态和多重态的能量高低。到底哪种方法对?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-27 14:50:26 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-5-27 08:34
老师,为了确定反应路径到底是单重态还是多重态,我计算了单重态(1)和多重态(3)的反应路径,发现多重 ...

不同自旋多重度有不同反应路径,这是很正常的,光是用单重态驻点算其它自旋多重度,没有什么确切物理意义
两种多重度的反应路径都算出来,放到一起讨论
刚开始的时候从单重态和更高自旋多重度的态发生反应都有可能
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发表于 Post on 2018-5-27 23:35:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-27 14:50
不同自旋多重度有不同反应路径,这是很正常的,光是用单重态驻点算其它自旋多重度,没有什么确切物理意义 ...

老师,我看的文献上就是通过单重态的结构计算三重态的能量,相互比较来说明反应是单重态进行的(好像他把第一个过渡态的能量作为原点)。这样做是否正确?如图所示:

1111.jpg (36.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-28 00:06:40 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-5-27 23:35
老师,我看的文献上就是通过单重态的结构计算三重态的能量,相互比较来说明反应是单重态进行的(好像他 ...

这顶多算是个近似的讨论方式,物理意义不强,毕竟三重态的驻点结构和单重态不同,严格来说应当计算三重态结构下三重态能量
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发表于 Post on 2018-5-28 10:08:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-28 00:06
这顶多算是个近似的讨论方式,物理意义不强,毕竟三重态的驻点结构和单重态不同,严格来说应当计算三重态 ...

谢谢老师!

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发表于 Post on 2018-5-28 10:53:19 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,大体系算反应,orca可以胜任吗?orca计算快,但是用orca算反应的文献远远不如高斯多,是不是orca在过渡态搜索上有问题?

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发表于 Post on 2018-5-28 12:09:04 | 只看该作者 Only view this author
您好。我用sobMECP找交叉点时,runfirst.sh执行没有问题,但runMECP.sh运行出错。test里的例子也无法运行,请问是什么原因?

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发表于 Post on 2018-5-28 12:11:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好!请问def2-QZVPP(-g,-f)在ORCA 4.0中怎么实现?谢谢!

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发表于 Post on 2018-5-28 12:12:39 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-5-28 10:53
Sob老师,大体系算反应,orca可以胜任吗?orca计算快,但是用orca算反应的文献远远不如高斯多,是不是orca ...

ORCA的构型优化比较慢。更适合用来算单点。

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发表于 Post on 2018-5-28 12:33:11 | 只看该作者 Only view this author
Accelerator 发表于 2018-5-28 12:12
ORCA的构型优化比较慢。更适合用来算单点。

orca单点能神器这点确实很好,我的体系感觉用orca纯泛函做结构优化和gaussian杂化泛函比还是快很多。但是orca搜索过渡态听说不如高斯,主要担心这块。

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发表于 Post on 2018-5-28 15:46:29 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师好,我看您的博文中写到用Mulliken方法做原子的自旋布居时不能有弥散函数存在,想问问您有没有相关的参考文献呢?最近看到也有文章在用Mulliken方法做自旋布居时加了弥散函数,所以想问问您有没有详细规定不能使用弥散函数的文献,在自己发文章的时候可以给审稿人解释下自己为什么不用弥散函数。谢谢老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-28 17:32:34 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-5-28 10:53
Sob老师,大体系算反应,orca可以胜任吗?orca计算快,但是用orca算反应的文献远远不如高斯多,是不是orca ...


可以胜任
过渡态搜索没问题,只不过算法没有Gaussian做得好,而且缺乏较好的图形界面帮助观看,而且ORCA本身用户也比Gaussian少得多。另外ORCA在计算Hessian方面支持的方法的局限性大、而且有时候容易出问题,这点没有Gaussian成熟。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-28 17:33:11 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2018-5-28 15:46
Sob老师好,我看您的博文中写到用Mulliken方法做原子的自旋布居时不能有弥散函数存在,想问问您有没有相关 ...

http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml
里面有详细讨论
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-28 17:34:29 | 只看该作者 Only view this author
honors 发表于 2018-5-28 12:11
sob老师,您好!请问def2-QZVPP(-g,-f)在ORCA 4.0中怎么实现?谢谢!


你得自己定义基组。在ORCA4里没法直接写关键词使用。
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