计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

6991#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-16 10:53:45 | 只看该作者 Only view this author
ccccn345 发表于 2018-6-16 08:58
请教老师,

高斯表头,对于因为弥散函数不收敛问题,使用SCF=qc,novaracc,noincfock等keyword和不使用相 ...

没有任何影响
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

6992#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-16 10:54:26 | 只看该作者 Only view this author
younggood 发表于 2018-6-16 09:47
用高斯优化K2HPO4,这是我的输入文件:%nprocshared=10%mem=20000MB
# b3lyp/gen gfinput pseudo=read opt ...

论坛首页google框搜索“Inaccurate quadrature in CalDSu”
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

20

帖子

0

威望

85

eV
积分
105

Level 2 能力者

6993#
发表于 Post on 2018-6-16 15:19:59 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,您好,想请教您一个问题,用ccsdt进行单点能计算,出现了L913错误,该如何改正呢,谢谢您!
祝您端午安康。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

6994#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-17 12:48:31 | 只看该作者 Only view this author
app 发表于 2018-6-16 15:19
Sob老师,您好,想请教您一个问题,用ccsdt进行单点能计算,出现了L913错误,该如何改正呢,谢谢您!
祝 ...


搞清楚什么是CCSDT,别乱用这个词,仔细看
量子化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298

问问题时别问lxxx出错,直接贴报错提示。把报错提示输入论坛首页的google搜索框搜索,8成几率都能直接找到答案
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

198

帖子

0

威望

450

eV
积分
648

Level 4 (黑子)

6995#
发表于 Post on 2018-6-18 02:30:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 算一算 于 2018-6-18 03:37 编辑

请问,如果想看激发态的分子轨道形状,是不是任何软件都做不到?比如说我有一个分子,它的第一激发态是从MO 89 到 MO 90,这两个基态MO的样子我可以在GaussView里看到,但是如果我想看MO 90在激发态的样子,是不是没有哪个可视化软件可以实现?如果真的不能被可视化的话,那我能看到MO90在基态和激发态的波函数数据吗,高斯能打印出这样的数据吗?我很想比较一下MO 90在激发态和基态有什么不同

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

6996#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-18 10:35:52 | 只看该作者 Only view this author
算一算 发表于 2018-6-18 02:30
请问,如果想看激发态的分子轨道形状,是不是任何软件都做不到?比如说我有一个分子,它的第一激发态是从MO ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

198

帖子

0

威望

450

eV
积分
648

Level 4 (黑子)

6997#
发表于 Post on 2018-6-18 10:57:14 | 只看该作者 Only view this author

谢谢这么详细的解答。我想再确认一下TDDFT计算的激发态。您回复中说“以上各种激发态计算方法原理上都可以给出激发态的自然轨道”,但是实际上是不是TDDFT并没有计算激发态的自然轨道?还是说它计算了,但是置之不理?我想确认一下,是不是TDDFT计算后输出的所有结果,都是根据基态的轨道算出来的,压根儿就没有激发态自然轨道的事儿?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

6998#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-18 11:47:23 | 只看该作者 Only view this author
算一算 发表于 2018-6-18 10:57
谢谢这么详细的解答。我想再确认一下TDDFT计算的激发态。您回复中说“以上各种激发态计算方法原理上都可 ...

你想生成激发态自然轨道就能生成,见
在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然轨道分析实例
http://sobereva.com/403

Gaussian默认不生成激发态自然轨道而已
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

198

帖子

0

威望

450

eV
积分
648

Level 4 (黑子)

6999#
发表于 Post on 2018-6-18 12:10:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-18 11:47
你想生成激发态自然轨道就能生成,见
在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然 ...

谢谢提供这个方法,正在尝试使用。我现在还想问的是,TDDFT算激发能是不是用基态轨道算出来的?就是说,如果我把基态的那些轨道能量相减,乘以相应的coefficient的平方,就是TDDFT算出的激发能?

20

帖子

0

威望

85

eV
积分
105

Level 2 能力者

7000#
发表于 Post on 2018-6-18 14:29:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-17 12:48
搞清楚什么是CCSDT,别乱用这个词,仔细看
量子化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com ...

好的,老师,谢谢您。打扰您了。

8

帖子

0

威望

177

eV
积分
185

Level 3 能力者

7001#
发表于 Post on 2018-6-18 19:28:24 | 只看该作者 Only view this author

UB3LYP/6-31G9(d)做激发出现能量负值。

本帖最后由 st897100082 于 2018-6-18 19:31 编辑

双自由基结构,以价态0 、自旋3和自旋5 进行opt freq ub3lyp/6-31g(d) 拿到T1结构,
再以B3lyp/6-31g(d)和UB3LYP/6-31G(D)分别做激发价态0,自旋多重度1,TD=(nstates=20,triplet).


问题一、B3LYP没有振子强度,Ub3lyp出现振子强度
问题二、所有单点的第一激发能都出现了负值。





6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

7002#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-18 19:40:37 | 只看该作者 Only view this author
st897100082 发表于 2018-6-18 19:28
双自由基结构,以价态0 、自旋3和自旋5 进行opt freq ub3lyp/6-31g(d) 拿到T1结构,
再以B3lyp/6-31g(d)和 ...


T1显然是用自旋多重度3来算,用5算莫名其妙
既然是算双自由基,算单重态时候显然不能直接写B3LYP,否则默认当成RB3LYP来算,结果明显是错的。用U算时候写triplet毫无意义,下文里明确说过,只有参考态是闭壳层时候才能用triplet设定。

Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
上文中也说了激发能算出来是负值是什么原因、怎么处理

另见
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

230

帖子

0

威望

790

eV
积分
1020

Level 4 (黑子)

7003#
发表于 Post on 2018-6-18 21:07:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-18 19:40
T1显然是用自旋多重度3来算,用5算莫名其妙
既然是算双自由基,算单重态时候显然不能直接写B3LYP,否 ...

Sob老师好,我有个关于自旋密度和自旋布居的问题想请教一下您。之前在网上看了您的帖子,最近在算自旋密度时碰到这样一个问题。一个原子的Mulliken自旋布居显示有0.55,但是用gview观察他的自旋密度等值面图却没有明显的自旋密度分布。相似结构中的同样一个原子,Mulliken自旋布居是-0.41,用gview在同样density下看自旋密度等值面图就有明显的自旋密度分布。想问您一下这种情况正常吗,是什么原因导致的呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

7004#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-19 00:05:04 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2018-6-18 21:07
Sob老师好,我有个关于自旋密度和自旋布居的问题想请教一下您。之前在网上看了您的帖子,最近在算自旋密 ...

改小等值面数值再看

谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

230

帖子

0

威望

790

eV
积分
1020

Level 4 (黑子)

7005#
发表于 Post on 2018-6-19 09:11:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-19 00:05
改小等值面数值再看

谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算

谢谢老师回复。我的等值面数值已经调的很小了,许多几乎没有什么自旋布居的原子上都有了很明显的自旋密度,相反我想看的那个院子上明明自旋布居有0,55但周围却没有什么自旋密度分布。老师我把我的out文件和cub文件私下传给您,您帮忙看一下可以吗,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 12:55 , Processed in 0.380182 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list