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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-6-8 16:20:40 | 只看该作者 Only view this author
请问一下电子密度的最大值ρmax如何获取?能否在multiwfn中绘制这种图形,谢谢

1.png (53.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

1.png

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发表于 Post on 2018-6-8 16:45:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-8 02:47
harmonic frequencies是实际的fundamental frequencies的近似
仔细阅读
谈谈谐振频率校正因子

多谢老师!

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发表于 Post on 2018-6-8 19:43:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2018-6-9 00:11 编辑

老师,rout section是这样的:opt=(calcfc,maxstep=2,verytight) SCF=verytight nosymm freq b3lyp/GenEcp ,但是算完的结果老是有虚频,frequency(-30.83),infared(0.0591)试了其他方法也是一样?

解决了,加了老师的int=superfine,解决了。

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发表于 Post on 2018-6-8 22:40:23 | 只看该作者 Only view this author
老师,求过渡态可以先不算freq,计算完成后再补算吗?频率计算很慢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-9 03:11:42 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-6-8 22:40
老师,求过渡态可以先不算freq,计算完成后再补算吗?频率计算很慢

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-9 03:12:30 | 只看该作者 Only view this author
oucli 发表于 2018-6-8 16:20
请问一下电子密度的最大值ρmax如何获取?能否在multiwfn中绘制这种图形,谢谢

请在这里询问
http://bbs.keinsci.com/thread-10181-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-9 03:13:54 | 只看该作者 Only view this author
haha 发表于 2018-6-8 11:45
sob老师,您好,我在用rohf限制性开壳层优化结构,想继续用cis做激发态,但是没有rocis这样的关键词,想请 ...

用U呗
另外,无论是基于U还是RO的CIS,误差都巨大,现在完全没人用
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发表于 Post on 2018-6-10 08:31:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ABetaCarw 于 2018-6-10 08:37 编辑

老师好,我对于荧光计算有些懵,想请教几个问题。
1荧光的吸收光谱和发射光谱是不是分别对应 垂直吸收和 垂直发射 的能量
2将UV-Vis数据的S1以上的振子强度都设为0可以得到荧光发射光谱,而UV-Vis不是吸收谱吗?为啥删减之后变成了荧光发射光谱了。我这里看的是讲义绘制联苯荧光发射光谱那部分内容的疑问。
3荧光猝灭现象是不是等同于荧光发射能为0 ,这两个概念和跃迁禁阻又是什么关系。
谢谢老师
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-10 09:27:25 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-6-10 08:31
老师好,我对于荧光计算有些懵,想请教几个问题。
1荧光的吸收光谱和发射光谱是不是分别对应 垂直吸收和  ...


1 荧光是发射过程,没有荧光吸收一说
2 UV-Vis是吸收谱。并不是说把UV-Vis的S1以上的振子强度设为0,而是对S1极小点做TDDFT计算时,把S1以上的f设为0。量化里,只有一个“电子激发计算”的概念,到底最终的结果怎么去解释、对应于实验上的什么概念,那取决于你具体怎么计算
3 不是一码事。荧光淬灭特指因为外部原因,导致实际荧光发射强度极弱(不是发射能为0)。而跃迁禁阻则是由于体系内在特征的缘故,令某些跃迁对应的f很接近于0。
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发表于 Post on 2018-6-10 12:18:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-10 09:27
1 荧光是发射过程,没有荧光吸收一说
2 UV-Vis是吸收谱。并不是说把UV-Vis的S1以上的振子强度设为0, ...

我现在有一个有机分子 有很强的荧光, 在和Fe离子配合时候 会导致原本很强的荧光消失了。那么通过什么样的计算可以证明出现荧光猝灭?还是说这样的现象只出现在实验里 而不能通过计算证明?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-10 13:10:31 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-6-10 12:18
我现在有一个有机分子 有很强的荧光, 在和Fe离子配合时候 会导致原本很强的荧光消失了。那么通过什么样 ...

算算振子强度,看发生了什么变化
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发表于 Post on 2018-6-10 19:24:52 | 只看该作者 Only view this author
老师,Gaussian09的脚本为啥里面需要创建一个tmp临时文件夹?cd进去之后各种文件都在tmp里面生成感觉不方便查看。能否省去创建tmp这个步骤,直接在一开始input.gjf所在目录计算?

高斯脚本.jpg (65.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

高斯脚本

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-11 05:51:28 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-6-10 19:24
老师,Gaussian09的脚本为啥里面需要创建一个tmp临时文件夹?cd进去之后各种文件都在tmp里面生成感觉不方便 ...

PBS的事我不清楚,可以单独发个帖子
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发表于 Post on 2018-6-11 10:42:45 | 只看该作者 Only view this author

高斯优化结构问题

想请教一下,高斯中只能构建钙原子,如何优化钙离子。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-11 10:57:27 | 只看该作者 Only view this author
大慧慧 发表于 2018-6-11 10:42
想请教一下,高斯中只能构建钙原子,如何优化钙离子。

一个原子没法优化,优化what?
起码得有两个
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