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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-8-24 08:34:04 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,请问在ADF软件中计算单重态与三重态之间的自旋轨道耦合常数,提交的初始文件是优化的基态结构还是优化的激发态结构?谢谢
有一篇文献提到的是优化的T1 态,但没有解释理由。谢谢

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发表于 Post on 2018-8-24 09:27:35 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请问:一个具有ICT性质的分子,使用特定态溶剂模型计算荧光发射能时是不是应该更准?但现在发现,特定态溶剂模型下得到的荧光发射能反而没有在线性溶剂模型下得到的准确,这个该如何理解?十分感谢。

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发表于 Post on 2018-8-24 15:20:19 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,由于刚刚接触理论计算,在计算的时候不清楚自选多重度设置是否正确,是不是可以用stable=opt检验一下?另外我算的是共晶含有弱相互作用,但是再算BDE时不涉及弱相互作用,那么在优化和计算单点能的时候要不要加弥散函数呢?问题可能过于小白,请各位老师多多见谅.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 16:55:41 | 只看该作者 Only view this author
lianghua飘 发表于 2018-8-24 01:25
请教sob老师,如何在Gaussian和NWchem的输出文件总读取自由能,谢谢

仔细看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 16:57:08 | 只看该作者 Only view this author
ssfm 发表于 2018-8-24 15:20
各位老师好,由于刚刚接触理论计算,在计算的时候不清楚自选多重度设置是否正确,是不是可以用stable=opt检 ...

只需要检测,用stable就够了。但即便它提示稳定,也不一定真的稳定,你用stable检测一下三重态水分子的计算就知道了

优化只要用了3-zeta基组就可以不加,能量应当加
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 16:57:49 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-8-23 21:16
老师,新装了ORCA 4.0.1 发现只能单核心运行。直接在输入文件中pal4会导致任务直接死掉,这是为什么呢?

没输出信息不好判断
可能是MPI运行环境没弄好
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 16:59:15 | 只看该作者 Only view this author
lijiaqi 发表于 2018-8-24 08:34
老师你好,请问在ADF软件中计算单重态与三重态之间的自旋轨道耦合常数,提交的初始文件是优化的基态结构还 ...

每个结构都可以计算SOC常数,用什么结构看目的,诸如考察磷光问题用T1结构

相关信息看
使用Gaussian+PySOC在TDDFT下计算旋轨耦合矩阵元
http://sobereva.com/411
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 16:59:54 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2018-8-24 09:27
Sob老师,请问:一个具有ICT性质的分子,使用特定态溶剂模型计算荧光发射能时是不是应该更准?但现在发现, ...

应当用特定态或者校正的线性响应模型。你发现线性响应模型更准,应当是误差幸运抵消所致
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 17:00:18 | 只看该作者 Only view this author
万山红遍 发表于 2018-8-23 10:45
sob老师,你好
请问如何通过计算说明一个物质的PH值

对一个分子只能说各个位点的pka,没法说PH
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发表于 Post on 2018-8-24 17:22:12 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Theor_Comp 于 2018-8-24 17:35 编辑
sobereva 发表于 2018-8-24 16:59
应当用特定态或者校正的线性响应模型。你发现线性响应模型更准,应当是误差幸运抵消所致

那该情况下,应该怎么办呢?应当用特定态模型,但是线性模型的结果又更准,此时该如何在文中说这个事情呢?主要是用特定态模型时,结果与实验结果差别很大(荧光发射能 实验波长450nm,线性模型计算为420 nm, 而特定态计算却为750nm),谢谢Sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 19:01:14 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2018-8-24 17:22
那该情况下,应该怎么办呢?应当用特定态模型,但是线性模型的结果又更准,此时该如何在文中说这个事情呢 ...

尝试校正的线性响应模型(g16里可以直接用)
或者就用线性响应模型,审稿人如果不是很内行,估计也不会要求比较特定态的情况
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发表于 Post on 2018-8-24 19:29:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-24 19:01
尝试校正的线性响应模型(g16里可以直接用)
或者就用线性响应模型,审稿人如果不是很内行,估计也不会 ...

Sob老师,1. 目前遇到的是审稿人要求使用“cLR, VEM, SS”这些除线性模型以外的模型,但特定态结果又与实验差别很大,所以来请教您。
2. g16校正的线性响应模型如何使用呢?
谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-24 19:37:42 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2018-8-24 19:29
Sob老师,1. 目前遇到的是审稿人要求使用“cLR, VEM, SS”这些除线性模型以外的模型,但特定态结果又与实 ...

例如
# PBE1PBE/6-311G* TD scrf(correctedLR,solvent=ethanol)
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发表于 Post on 2018-8-24 19:56:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-24 16:57
只需要检测,用stable就够了。但即便它提示稳定,也不一定真的稳定,你用stable检测一下三重态水分子的计 ...

谢谢老师您耐心的回复,如果想要确保稳定的话是不是根据这个帖子里面说的可以做到?http://bbs.keinsci.com/thread-9012-1-1.html

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发表于 Post on 2018-8-24 20:44:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Theor_Comp 于 2018-8-24 21:15 编辑
sobereva 发表于 2018-8-24 19:37
例如
# PBE1PBE/6-311G* TD scrf(correctedLR,solvent=ethanol)

Sob老师,1. 用校正的线性模型(cLR-PCM)来计算荧光发射能,可以使用LR-PCM优化出来的激发态结构吗?如果再重新优化激发态结构耗时较多            2. 使用校正的线性模型来计算激发能时,当做电子激发时,基态结构是用LR-PCM得到的也可以,还是说必须换成cLR-PCM?

3. 在校正模型下, 如果使用IPCM,是不是这样scrf(correctedLR,IPCM,solvent=ethanol)?不加时仍是默认的是IEFPCM?

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