计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

201

帖子

2

威望

1354

eV
积分
1595

Level 5 (御坂)

7936#
发表于 Post on 2018-10-31 15:04:07 | 只看该作者 Only view this author
老师,实验上常温做出来一个产物,是1位产物。我做计算研究1位和三位的竞争问题。
1,我找到的最低的1位路径势垒是 25 kcal/mol,3位是 25.6 kcal/mol.  都超过了21kcal/mol   计算级别M06/6-31g*  溶解自由能直接是用M06/6-31g* SCRF(SMD,solvent=AceticAcid) 得到的单点能加到之前的气相下自由能校正量得到的,相当于用再M06算的溶解自由能。 投稿的话有没有什么比较好的方式能说一下由于计算误差什么的超过了21kcal/mol? 还是直接不提这个事也行?

2,如果用这个势垒算反应速率的话一定很小,而且反应步骤很多,我觉得误差会很大所以没想算速率。 按照决速步来看1位只比3位低了0.6kcal/mol  这样用于说明1位很有优势会有啥问题吗?(或者也像1一样解释一下,比如说可能是计算误差导致差这么小,实际差的可能更大?)

谢谢老师

442

帖子

0

威望

1500

eV
积分
1942

Level 5 (御坂)

7937#
发表于 Post on 2018-10-31 15:46:28 | 只看该作者 Only view this author

高斯优化老是优化不出来

请问,我在做一个优化,总是优化不出来,是怎么回事呢?

微信图片编辑_20181031154512.jpg (89.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

微信图片编辑_20181031154512.jpg

581

帖子

0

威望

1700

eV
积分
2281

Level 5 (御坂)

7938#
发表于 Post on 2018-10-31 15:47:14 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!打扰了,请教一个问题:一个金属配合物我用M06/SDD/6-31G**优化,我用相同的理论级别算NRT可以吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

7939#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-31 15:48:43 | 只看该作者 Only view this author
413 发表于 2018-10-31 15:46
请问,我在做一个优化,总是优化不出来,是怎么回事呢?

量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

7940#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-31 15:48:51 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-10-31 15:47
sob老师您好!打扰了,请教一个问题:一个金属配合物我用M06/SDD/6-31G**优化,我用相同的理论级别算NRT可 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

7941#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-31 15:49:28 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2018-10-31 15:04
老师,实验上常温做出来一个产物,是1位产物。我做计算研究1位和三位的竞争问题。
1,我找到的最低的1位路 ...

这样字很多的问题还是单独发帖吧,也便于其他人看到给你建议
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

201

帖子

2

威望

1354

eV
积分
1595

Level 5 (御坂)

7942#
发表于 Post on 2018-10-31 17:37:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-31 15:49
这样字很多的问题还是单独发帖吧,也便于其他人看到给你建议

好的老师 下次知道了。自己水平太低发的问题很奇怪所以总也不想单独发帖,而且发在这也是因为主要很想请教一下您的想法。http://bbs.keinsci.com/thread-11276-1-1.html 期待您有空时看看,感谢老师。

581

帖子

0

威望

1700

eV
积分
2281

Level 5 (御坂)

7943#
发表于 Post on 2018-10-31 22:55:51 | 只看该作者 Only view this author

62

帖子

0

威望

355

eV
积分
417

Level 3 能力者

7944#
发表于 Post on 2018-11-1 11:13:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-28 10:36
波函数变化不连续
尝试从远往近扫,小步长
这么点体系,而且还是多重键体系,UKS描述必然不理想,而且 ...

sob老师,我尝试了由远及近扫描,还是不连续变化。
另外高斯有自带的多参考体系吗?我没有找到。
我用CAS方法计算,发现l510错误,结果不收敛,我想要放宽收敛限,但是之前看到过关键词没有记住,这回没找到。
还有一个,CAS方法是不是不适合扫描这样的任务?

195

帖子

0

威望

699

eV
积分
894

Level 4 (黑子)

7945#
发表于 Post on 2018-11-1 13:16:40 | 只看该作者 Only view this author
请问,使用caspt2如何创建三重态对儿啊,即(TT)1
谢谢!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

7946#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-1 16:57:22 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2018-11-1 11:13
sob老师,我尝试了由远及近扫描,还是不连续变化。
另外高斯有自带的多参考体系吗?我没有找到。
我用C ...

“有自带的多参考体系吗?”表述错误
Gaussian支持CASSCF,以及多参考二阶微扰方法OVB-MP2(非主流),做得都不好。
有问题搜论坛
适合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

581

帖子

0

威望

1700

eV
积分
2281

Level 5 (御坂)

7947#
发表于 Post on 2018-11-2 15:47:29 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我进行NRT计算,输入文件为$NBO NRT NRTRES=2000 NRTCHG=0.5 NRTFDM $END出现如下错误该如何解决呀, 4 reference structure(s) read from $NRTSTR keylist
Initial loops searched 6 bonding pattern(s); 3 were retained
Delocalization list threshold set to 1.98 kcal/mol for reference 1
Delocalization list threshold set to 1.19 kcal/mol for reference 2
APPEND: non-integer number of electrons (260.23209) found in resonance
             structure (388,  2).

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

7948#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-2 17:42:04 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-11-2 15:47
sob老师您好,我进行NRT计算,输入文件为$NBO NRT NRTRES=2000 NRTCHG=0.5 NRTFDM $END出现如下错误该如何 ...

不知道。可以到NBO官方论坛问问
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

581

帖子

0

威望

1700

eV
积分
2281

Level 5 (御坂)

7949#
发表于 Post on 2018-11-2 22:04:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-2 17:42
不知道。可以到NBO官方论坛问问

谢谢sob老师

581

帖子

0

威望

1700

eV
积分
2281

Level 5 (御坂)

7950#
发表于 Post on 2018-11-2 22:49:40 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!能不能再请教一个问题:如果一个涉及某个键生成的过渡态,我算了这个过渡态到反应物的IRC,发现从反应物到过渡态有电子从某个基团移到了另一个基团,我现在有个结论:从反应物到过渡态电子转移的量越多,位垒越高。这样结论有没有理论的支持呀?有没有文献可引

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 09:20 , Processed in 0.244323 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list