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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-10-27 09:49:05 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-10-26 10:51
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html
这个帖子是2楼写的 你看了后就能自己解决这类报错问题了, ...

谢谢

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发表于 Post on 2018-10-27 10:04:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-26 11:54
提问Gaussian问题的注意事项;Gaussian FAQ
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=4829

谢谢老师指正!

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发表于 Post on 2018-10-27 10:17:49 | 只看该作者 Only view this author
之前用B3LYP优化不成功,看了帖子后转用B3WP91优化好后,想用输出的坐标作为初始结构再次用B3LYP进行优化,我这个时候应该从输出文件中的最后一个Input orientation选坐标还是用最后一个Standard orientation?

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发表于 Post on 2018-10-27 13:46:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-26 21:32
别用SV(P),过时了,用def2-SVP,写def2SVP,手册里都写着
def-TZVP写成TZVP

好的,谢谢sobereva老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-27 14:38:25 | 只看该作者 Only view this author
yq1123088 发表于 2018-10-27 10:17
之前用B3LYP优化不成功,看了帖子后转用B3WP91优化好后,想用输出的坐标作为初始结构再次用B3LYP进行优化, ...

没事甭用B3PW91,平均性能不如B3LYP,也不会有任何优势
“优化不成功”这种表述严重含糊不清,显然要看具体报错,不看报错显然不知道怎么解决问题
几何优化不收敛看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-10-27 22:28:16 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2018-10-27 23:23:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2018-10-27 23:28 编辑

老师,对于π*和d轨道之间的反馈π键,是不是相位也要一致?我觉得空轨道的π*因为没有电子可以不用相位一致,不知道对不对?另外,是不是轨道相位因为不同矩阵块的运算也会导致有差异。但是我不知道我的是不是这种情况?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-27 23:26:22 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-10-27 23:23
老师,对于π*和d轨道之间的反馈π键,是不是相位也要一致?我觉得空轨道的π*因为没有电子可以不用相位一 ...

不对
需要相位匹配
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-10-27 23:29:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2018-10-27 23:36 编辑
sobereva 发表于 2018-10-27 23:26
不对
需要相位匹配

老师,如何会不会是因为不同矩阵块运算导致的相位不一致呢?烯烃的π*轨道和过渡金属的d轨道之间作用时,是不是可以考虑π*的反键轨道可以有两种相位(两个p轨道旋转180°还是反键轨道)?谢谢老师这么晚还来解惑。

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发表于 Post on 2018-10-28 09:25:43 | 只看该作者 Only view this author

sob 老师,我想要找的N2--N+N,过程的自由能曲线,我先用片段组合波函数方法算了一个初猜,然后guess=read,进行扫描,取点算自由能。计算结果有一个悬崖是跳跃,曲线如图。这是什么原因呢?我应该如何解决?

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发表于 Post on 2018-10-28 10:06:17 | 只看该作者 Only view this author
请问,泛函的长程校正里的长程到底是指多长,两分子间距几埃能算长程?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-28 10:35:22 | 只看该作者 Only view this author
算一算 发表于 2018-10-28 10:06
请问,泛函的长程校正里的长程到底是指多长,两分子间距几埃能算长程?

没有确切划分标准
看《最优化“调控”区间分离密度泛函理论的研究进展》一文的图2,看长程校正到什么时候已经到100%,心里就有数了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-28 10:36:28 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2018-10-28 09:25
sob 老师,我想要找的N2--N+N,过程的自由能曲线,我先用片段组合波函数方法算了一个初猜,然后guess=read ...

波函数变化不连续
尝试从远往近扫,小步长
这么点体系,而且还是多重键体系,UKS描述必然不理想,而且也显得太low。应当用多参考方法
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-28 10:40:27 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-10-27 23:29
老师,如何会不会是因为不同矩阵块运算导致的相位不一致呢?烯烃的π*轨道和过渡金属的d轨道之间作用时, ...

两部分独立SCF求解轨道时,相对整体相位是随机的
对于p的两个瓣与d的重叠,你应当理解为“相位相同 相位相同”和“相位相反 相位相反”其实是一码事,都是对称匹配。但“相位相同 相位相反”则对称不匹配的
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发表于 Post on 2018-10-28 11:56:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-28 10:40
两部分独立SCF求解轨道时,相对整体相位是随机的
对于p的两个瓣与d的重叠,你应当理解为“相位相同 相位 ...

老师,下面的两张图是不是你所说的“相位相反 相位相反”的情况。烯烃π*是空轨道,d轨道满电子。

2222.jpg (27.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

d轨道

d轨道

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烯烃π*

烯烃π*

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