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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-12-11 20:41:28 | 只看该作者 Only view this author
muxijiao 发表于 2018-12-11 20:09
你的题目应该是“扫描单体和二聚体的几何结构的Gaussian输入文件怎么做”

谢谢,可不可以教教我

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发表于 Post on 2018-12-12 00:16:51 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
另外,过渡态是在ultrafine和tight下找的

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发表于 Post on 2018-12-13 10:27:00 | 只看该作者 Only view this author

请问我的分子优化的时候为什么只有多重态为2的时候才可以优化设为1会报错。

%nprocshared=2
%mem=1000MB
%chk=E:\cal\1.chk
# opt freq b3lyp/gen geom=connectivity pseudo=read

2

0 2
Y                  1.68134909    6.23604860    8.39688419
...........结构数据....

Y 0
LanL2DZ
****
C H N S O 0
6-31g*
****

Y 0
LanL2DZ




无标题.jpg (103.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

无标题.jpg

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发表于 Post on 2018-12-13 10:28:07 | 只看该作者 Only view this author
中文名 钇 外文名 Yttrium 化学符号 Y 相对原子质量 89 原子序数 39

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发表于 Post on 2018-12-13 10:42:45 | 只看该作者 Only view this author
[Kr] 4d1 5s2 的原子怎么看都得有单电子吧

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发表于 Post on 2018-12-13 10:55:32 | 只看该作者 Only view this author
highlight 发表于 2018-12-13 10:42
[Kr] 4d1 5s2 的原子怎么看都得有单电子吧

也就是说这个元素 是没有单重态的?

我刚接触计算不太久  还不太明白

怎么判断什么样的分子 应该用单重态  什么样的分子用多重态呐   比如2或者是3

谢谢您的回复

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发表于 Post on 2018-12-13 11:27:05 | 只看该作者 Only view this author
luosha505 发表于 2018-12-13 10:55
也就是说这个元素 是没有单重态的?

我刚接触计算不太久  还不太明白

http://bbs.keinsci.com/thread-4836-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-9945-1-1.html
在这个坛子里一搜一大堆关于怎么设置自旋多重度的帖子。
你这个体系应该电子数是奇数,所以自旋多重度应该是偶数。

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发表于 Post on 2018-12-13 17:26:36 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,这里我想咨询一下关于用高斯计算NTO轨道的一些问题:
1,在计算能级中对应的轨道跃迁与NTO计算的结果差别较大,想请您帮忙看一下是否有问题呢?
(1)输入文件:td=(triplets,nstates=20) b3lyp/6-31g(d) pop(saveNTO,NTO) density=transition=1 geom=connectivity(计算S0到T1的NTO,请问输出文件是否有误呢?)
(2)输出能级文件:
  Excited State   1:      Triplet-A      2.9813 eV  415.87 nm  f=0.0000  <S**2>=2.000
     103 ->108         0.10488
     104 ->108         0.35896
     105 ->108         0.43093
     106 ->108        -0.27667
     107 ->108        -0.19870
This state for optimization and/or second-order correction.
Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) =  -1970.43583565   
Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density.

(3)NTO数据:
Alpha  occ. eigenvalues --    0.00108   0.00215   0.00877   0.01258   0.01586
Alpha  occ. eigenvalues --    0.04353   0.92978
Alpha virt. eigenvalues --    0.92978   0.04353   0.01586   0.01258   0.00877
Alpha virt. eigenvalues --    0.00215   0.00108   0.00035   0.00022   0.00017

(4)根据上述的输出结果,是否还是参考NTO数据主要以HOMO到LUMO的跃迁的?因为我计算了8个文件,全部计算结果都是表明主要以HOMO到LUMO的跃迁。
2、计算多聚体从S0到T1的NTO轨道,输入文件如单具体一致,td=(triplets,nstates=20) b3lyp/6-31g(d) pop(saveNTO,NTO) density=transition=1 geom=connectivity,但是出现错误,请问多聚体的计算方法是否有所不同呢?
3、根据您之前的帖子说density=transition=1是代表从基态到第一激发态的意思,那如果我要计算从T1态到S0的NTO轨道,是否以T1优化的结构进行计算呢?其输入文件如下是否合理呢 td=(triplets) b3lyp/6-31g(d) pop(saveNTO,NTO) geom=connectivity


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-13 19:04:19 | 只看该作者 Only view this author
量化问题不要发到分子模拟版,十分初级的问题不要单独发帖,直接在此帖跟帖提问

你的问题在8114L有正确回复
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-13 19:07:38 | 只看该作者 Only view this author
roseeesor 发表于 2018-12-13 17:26
sob老师您好,这里我想咨询一下关于用高斯计算NTO轨道的一些问题:
1,在计算能级中对应的轨道跃迁与NTO计 ...

问“轨道跃迁与NTO计算的结果差别较大”说明你没理解NTO的最基本思想。二者根本没有可比性
NTO和MO根本就没有一一对应的关系,之间是酉变换的关系。

强烈建议改用Multiwfn做NTO分析,我早就不用Gaussian干这事了。比Gaussian好用得多。仔细看
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377
怎么算和单体还是多聚体没有任何关系。

你要考察从T1发射就用T1优化的结构做NTO分析
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-13 19:27:09 | 只看该作者 Only view this author
iuhgnor 发表于 2018-12-11 19:06
我在跑IRC时提前结束,输出文件显示“PES minimum detected within a second-order step.”。在CCL上看到有 ...

仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400

当程序发现IRC再继续走能量会升高,就会认为已经十分逼近极小点而不再走了

记得此时IRC必须也得用ultrafine
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-13 19:30:03 | 只看该作者 Only view this author
比基尼 发表于 2018-12-11 19:29
请教一下大神,如何用M06/6-31+G(d)来扫描单体和二聚体的几何结构?可以教教我这个新手吗?谢谢大家。

记得以后求助帖不要发到资源分享区。仔细看置顶的新人必读贴

直接在论坛首页google框搜索“扫描”就能提供给你足够的信息
如果是有机体系,要用M06-2X而非M06,仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272
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发表于 Post on 2018-12-13 20:33:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-13 19:07
问“轨道跃迁与NTO计算的结果差别较大”说明你没理解NTO的最基本思想。二者根本没有可比性
NTO和MO根本 ...

谢谢老师,我先再仔细学习理解一下。

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发表于 Post on 2018-12-14 08:47:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-13 19:30
记得以后求助帖不要发到资源分享区。仔细看置顶的新人必读贴

直接在论坛首页google框搜索“扫描”就能 ...

谢谢老师,我知道了。下次我会注意的。

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发表于 Post on 2018-12-14 10:22:47 | 只看该作者 Only view this author
请问sob大神,我最近在一些关于磷光的文章中,经常会发现文中会谈论到其主要的系间窜跃(ISC)通道,但是又没有任何数据表明为什么某些是主要的,某些是次要的,请问是可以进行计算的吗?例如是通过计算自旋轨道耦合常数(SOC)得来的吗?(图1,参考文献Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 12160 –12164)另外图2,参考文献:[color=rgba(0, 0, 0, 0.79)] J. Mater. Chem. C, 2018, 6, 8733-8737 中的
integrated transition probability (%)又是如何得来的呢?




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图1 ISC通道

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图2

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