计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8056#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 21:57:04 | 只看该作者 Only view this author
haha 发表于 2018-11-27 11:06
sobereva老师,我用CASSCF算自由基O=N-OCH2CH2O,选取的活性空间包括了O以及ONO的轨道,但是结果都是O的跃 ...

没有这个限制
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

99

eV
积分
106

Level 2 能力者

8057#
发表于 Post on 2018-11-27 22:06:35 | 只看该作者 Only view this author

问题求助

大家好,想请教大家一个问题,构型优化包含不同同位素该怎么设置来区分同位素呢,例如优化一个分子中,该分子既有C12也有C13。
希望大家可以帮忙解答一下,非常感谢!





6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8058#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 22:09:39 | 只看该作者 Only view this author
VASP-DFT 发表于 2018-11-27 22:06
大家好,想请教大家一个问题,构型优化包含不同同位素该怎么设置来区分同位素呢,例如优化一个分子中,该分 ...

分子计算问题别发到第一性原理版去
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”及具体内容(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),别就写个“问题求助”
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8059#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 22:10:14 | 只看该作者 Only view this author
VASP-DFT 发表于 2018-11-27 22:06
大家好,想请教大家一个问题,构型优化包含不同同位素该怎么设置来区分同位素呢,例如优化一个分子中,该分 ...

仔细看
谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响
http://sobereva.com/423
看完就知道这个问题是无意义的

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

99

eV
积分
106

Level 2 能力者

8060#
发表于 Post on 2018-11-27 22:14:10 | 只看该作者 Only view this author
谢谢您的回复。我会仔细看看“谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响”。

183

帖子

0

威望

795

eV
积分
978

Level 4 (黑子)

8061#
发表于 Post on 2018-11-27 23:34:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-27 21:56
如果是激发态优化任务,先确认第一步的激发能是正的
如果就是单个结构下激发态计算任务,确保和stable=o ...

老师,我做的是激发态优化,第一步的激发能是正的,随着优化步数增多,激发能就慢慢变成了负值。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8062#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 23:43:44 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-11-27 23:34
老师,我做的是激发态优化,第一步的激发能是正的,随着优化步数增多,激发能就慢慢变成了负值。

减小步长上限再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

183

帖子

0

威望

795

eV
积分
978

Level 4 (黑子)

8063#
发表于 Post on 2018-11-28 00:27:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 DUNING 于 2018-11-28 10:06 编辑
sobereva 发表于 2018-11-27 23:43
减小步长上限再试

老师,之前我在优化激发态时能量和受力都出现震荡,所以为了改善能量震荡,我之前就已经调整了步长,用的关键词是maxstep=3.notrust。对了,老师,我后来发现在用stable=opt找稳定波函再用guess=read读入的时候,之前的RPEB1PBE全变成了UPBE1PBE,是不是说明我的基态多重度有问题?我之前一直默认的是单重态,所以我又计算了该构型下三重态和单重态的单点能,发现三重态能量还是高一些的。难道我应该在三重态下优化一下基态结构吗?

20

帖子

0

威望

314

eV
积分
334

Level 3 能力者

8064#
发表于 Post on 2018-11-28 09:41:09 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我计算一种分子共晶体的荧光光谱,取晶体中的双分子重复单元,对氢原子进行了优化,计算吸收光谱用的m062x tzvp  TD(nstates=20) scrf(SMD,solvent=generic,read) 混合溶剂, 优化激发态结构时采用m062x tzvp  TD opt方法,我的问题如下:(1)由于是晶体结构,对双分子进行优化与实际结果偏差较大,吸收光谱只优化了氢原子是否可以?(2)优化激发态结构时耗时很慢,对所有分子优化会不会与初始晶体状态差异很大,这样的结果是否可信?(3)这样的步骤是否合理?谢谢老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8065#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-28 17:26:17 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-11-28 00:27
老师,之前我在优化激发态时能量和受力都出现震荡,所以为了改善能量震荡,我之前就已经调整了步长,用的 ...

没有问题。只不过stable=opt可能最后尝试了改用U来计算来查看能量是否会降低,所以读到的也是U。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8066#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-28 17:27:15 | 只看该作者 Only view this author
oucli 发表于 2018-11-28 09:41
老师您好,我计算一种分子共晶体的荧光光谱,取晶体中的双分子重复单元,对氢原子进行了优化,计算吸收光谱 ...

如果实验就是晶体状态测的,对比时重原子不用优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

183

帖子

0

威望

795

eV
积分
978

Level 4 (黑子)

8067#
发表于 Post on 2018-11-28 17:36:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-28 17:26
没有问题。只不过stable=opt可能最后尝试了改用U来计算来查看能量是否会降低,所以读到的也是U。

谢谢老师,那还有办法可以让我的激发能变成正的啊?

20

帖子

0

威望

314

eV
积分
334

Level 3 能力者

8068#
发表于 Post on 2018-11-29 09:15:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-28 17:27
如果实验就是晶体状态测的,对比时重原子不用优化

优化S1态也不用优化嘛老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8069#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-29 13:24:19 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-11-28 17:36
谢谢老师,那还有办法可以让我的激发能变成正的啊?

到了激发能成了负的那一帧的结构,再次用stable=opt然后guess=read进行优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

8070#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-29 13:26:59 | 只看该作者 Only view this author
oucli 发表于 2018-11-29 09:15
优化S1态也不用优化嘛老师

S1肯定得优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 06:22 , Processed in 0.255044 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list