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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-30 11:07:51 | 只看该作者 Only view this author
alexwpch 发表于 2018-11-30 09:15
sob老师好,
我用您的G4MP2.pl对out文件进行处理时,出现了“Can't take log of 0 at ./G4MP2.pl line 298 ...

对照我提供的例子研究

G4MP2_6x.gjf

686 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

G4MP2_6x.out

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G4MP2_6x.pl

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发表于 Post on 2018-11-30 11:23:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-30 11:07
对照我提供的例子研究

不好意思,sob老师,对照例子发现多打了个空格。。。。
谢谢您了!

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发表于 Post on 2018-11-30 12:50:28 | 只看该作者 Only view this author

高斯能量计算

老师您好,我想问一下进行单点能计算时,为什么summary 里面的能量和输出文件里SCF的不一样

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发表于 Post on 2018-11-30 13:48:35 | 只看该作者 Only view this author
summary里是ccsd的能量,scf done是HF的能量

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发表于 Post on 2018-11-30 15:32:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-29 23:11
这属于波函数分析的内容,到波函数分析版块发帖吧

好的,谢谢老师,那我去波函数分析那里从新发帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-30 15:51:49 | 只看该作者 Only view this author
maxiaoke 发表于 2018-11-30 12:50
老师您好,我想问一下进行单点能计算时,为什么summary 里面的能量和输出文件里SCF的不一样

8104L已经回复了。
读数据时候甭从gview的summary里读,直接从输出文件中自己读对应的能量,gview某些情况下判断错误,会误了大事
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发表于 Post on 2018-11-30 16:03:41 | 只看该作者 Only view this author
你们好,我想咨询一下高斯计算中的耦合分子计算问题:
1、如果从diamond中提取出晶体结构(单个分子)进行高斯计算,是否不需要优化就可以进行计算呢?
2、如果从diamond中提取出晶体结构(两个耦合分子)进行高斯计算,需要进行优化氢原子之后才能计算呢?如果是,请问具体是如何治优化氢原子呢?是直接在最后的其他中输入H 然后选择基组吗?(可以提供具体方法吗?)
3、我在计算单重态和三重态的激发态能级的时候发现结果是一样的,是我的输入文件有问题吗?(是否有相关帖子可以参考呢?)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-30 19:17:27 | 只看该作者 Only view this author
roseeesor 发表于 2018-11-30 16:03
你们好,我想咨询一下高斯计算中的耦合分子计算问题:
1、如果从diamond中提取出晶体结构(单个分子)进行 ...

1 得优化氢原子
2 是
优化时候把重原子冻结即可,看
在Gaussian中做限制性优化的方法
http://sobereva.com/404
3 应该是数据读错了或者关键词错误,如果用TDDFT算的,看
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
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发表于 Post on 2018-11-30 21:47:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 roseeesor 于 2018-11-30 21:49 编辑
sobereva 发表于 2018-11-30 19:17
1 得优化氢原子
2 是
优化时候把重原子冻结即可,看

谢谢sob老师,非常感谢您的回复。帖子我已经阅读过了,针对问题3您建议的帖子优化T1结构的方法里面,我做了以下两个输入文件(附件),您能否帮忙看一下是否有问题呢?
1,针对优化T1结构:Job type:opt —— method :Ground State,DFT, B3LYP
2,基于上部结构优化:Job type:energy  —— method :TDDFT,DFT, B3LYP
但是其中有一点我不是很明白,对于第一步中method 为什么不是选择TD-SCF吗?因此不是计算激发态的结构吗?
另外,计算三重态时,我希望选择M06-2X作为基组,但是我发现我没有这个相应的基组,我是否可以在计算之前把输入文件用文本格式打开,将其中的基组直接改为M06-2X呢?这是否有问题呢?

三重态T1优化步骤.png (20.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

三重态T1优化步骤.png

三重态T1优化步骤2.png (19.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

三重态T1优化步骤2.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-1 01:26:02 | 只看该作者 Only view this author
roseeesor 发表于 2018-11-30 21:47
谢谢sob老师,非常感谢您的回复。帖子我已经阅读过了,针对问题3您建议的帖子优化T1结构的方法里面,我做 ...

甭用gview写输入文件,自己手写。那个界面low爆了,用那个界面永远提高不了,会永远处于菜鸟阶段
帖子里也没让你用gview写
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发表于 Post on 2018-12-1 09:08:51 | 只看该作者 Only view this author
请问闭壳层基态分子的TD-DFT计算中输出的激发态的<S**2>总是0,这样的结果对吗?

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发表于 Post on 2018-12-1 09:50:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-30 15:51
8104L已经回复了。
读数据时候甭从gview的summary里读,直接从输出文件中自己读对应的能量,gview某些情 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-1 13:31:14 | 只看该作者 Only view this author
Accelerator 发表于 2018-12-1 09:08
请问闭壳层基态分子的TD-DFT计算中输出的激发态的总是0,这样的结果对吗?

如果要求算的激发态都是单重态就是这样,三重态就不是
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发表于 Post on 2018-12-1 13:58:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-1 01:26
甭用gview写输入文件,自己手写。那个界面low爆了,用那个界面永远提高不了,会永远处于菜鸟阶段
帖子里 ...

谢谢老师,我明白了,那我继续尝试一下

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发表于 Post on 2018-12-1 18:26:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Accelerator 于 2018-12-1 18:49 编辑
sobereva 发表于 2018-12-1 13:31
如果要求算的激发态都是单重态就是这样,三重态就不是

那么这样求出来的激发态都是闭壳层吗 还是已经经过了自旋投影

本版积分规则 Credits rule

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