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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-12-29 23:16:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-25 01:27
1 图便宜用前者,能量相关计算结果后者好一些(M06-2X通常更好)。波函数分析这俩都差不多
2 用(3)就行 ...

谢谢老师,还有3个问题请教。
1.也就是说对As用lanl08(d)和SDD这种即使包括了考虑相对论效应的赝势,其精度还不如全电子基组def2-svp,更不如def2-tzvp,是吗?
2.如果采用几何优化对低周期元素用def2-svp,对As用def2-tzvp这样混合基组对几何结构改进大吗?有必要吗?
3.做波函数分析时,在def2-svp和def2-tzvp下差别不大?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-30 04:56:54 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2018-12-29 23:16
谢谢老师,还有3个问题请教。
1.也就是说对As用lanl08(d)和SDD这种即使包括了考虑相对论效应的赝势,其 ...

1 比def2-SVP好,但不如def2-TZVP。对于第四周期之后的,本来def2就是赝势基组,用的就是相对论赝势
2 毫无意义,还会造至审稿人质疑。def2里面每一种基组,对于整个周期表,都可以达到相同的描述质量,所以一个元素用好基组一个元素用差基组完全说不通。不重要的区域用差基组才是合理的
3 看具体什么分析
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-30 04:57:26 | 只看该作者 Only view this author
roseeesor 发表于 2018-12-29 17:25
sob大神你好,我在利用晶体结构进行基态,单重激发态和三重激发态的优化计算时,发现有个问题
1、在我优 ...

1 S1,T1时候优化整个分子。
2 是。但最好令nstates比root高一些
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发表于 Post on 2018-12-30 08:59:37 | 只看该作者 Only view this author
sob老师打扰了,想请教两个问题:一是反应级数和反应分子数的区别和联系?二是如何从势能面上看出整个反应的反应级数和反应分子数和单个基元反应的反应级数和反应分子数?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-30 10:46:28 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-12-30 08:59
sob老师打扰了,想请教两个问题:一是反应级数和反应分子数的区别和联系?二是如何从势能面上看出整个反应 ...

级数是比较表观的概念,不一定和实际基元反应实际参与的分子数对应。势能面不体现这个问题
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发表于 Post on 2018-12-30 11:25:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-30 10:46
级数是比较表观的概念,不一定和实际基元反应实际参与的分子数对应。势能面不体现这个问题

谢谢sob老师您的回复,还想问一下,如何看出一个反应的反应分子数,是从配平的方程式看吗?还是看决速步的过渡态里边有几个底物分子?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-31 06:35:29 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-12-30 11:25
谢谢sob老师您的回复,还想问一下,如何看出一个反应的反应分子数,是从配平的方程式看吗?还是看决速步 ...

从计算角度关心的是基元反应到底是几个分子参与的反应,这个和化学方程式完全是两码事。
基元反应基本都是单分子、双分子反应,而三分子反应极罕见,三个分子光时是同时碰上的几率都很低。
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发表于 Post on 2018-12-31 14:25:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-31 06:35
从计算角度关心的是基元反应到底是几个分子参与的反应,这个和化学方程式完全是两码事。
基元反应基本都 ...

谢谢sob老师,您辛苦了

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发表于 Post on 2018-12-31 21:47:55 | 只看该作者 Only view this author
NICS的原始定义,体现的是对外磁场的各项同性(Isotropic)屏蔽      
NICS_ani这里指的是磁屏蔽各向异性(anisotropy)值,定义为ε_3 - (ε_1 + ε_2)/2,ε代表磁屏蔽张量的本征值,由小到大排序。各向异性值越大的地方说明这个地方对不同方向外磁场的屏蔽能力差异越大。
那么NICS值代表的各项同性是指这个地方对不同方向外磁场的屏蔽能力无差异吗?还是在算NICS的时候把三个值(XX,YY,ZZ)平均就把各向异性的差别给平均掉了?
NICS_ani只是代表屏蔽能力差异大小吗?在芳香性的衡量中有什么具体的应用吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-1 05:49:50 | 只看该作者 Only view this author
CharlesGe 发表于 2018-12-31 21:47
NICS的原始定义,体现的是对外磁场的各项同性(Isotropic)屏蔽      
NICS_ani这里指的是磁屏蔽各向异性(a ...

平均掉了
我看过的文章里印象中没有用NICS_ani来讨论芳香性的(可能有但是我忘了),但由于芳香性特征的不同会反映在这个数值上,所以这个量其实和芳香性也是能找到关系的。

PS:芳香性属于波函数分析的主题,之后有相关问题建议发在本论坛的波函数分析与Multiwfn专版上
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发表于 Post on 2019-1-1 23:37:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-1 05:49
平均掉了
我看过的文章里印象中没有用NICS_ani来讨论芳香性的(可能有但是我忘了),但由于芳香性特征的 ...

谢谢老师,如果计算NICS我先用B3LYP/6-31G*优化结构,再用B3LYP/6-31+G*做单电能去求NICS可以吗?还是说应用B3LYP/6-31+G*级别优化的结构去求芳香性呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-2 06:42:12 | 只看该作者 Only view this author
CharlesGe 发表于 2019-1-1 23:37
谢谢老师,如果计算NICS我先用B3LYP/6-31G*优化结构,再用B3LYP/6-31+G*做单电能去求NICS可以吗?还是说 ...

优化加不加弥散对结构影响甚微,优化时候没必要加,纯粹浪费时间
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发表于 Post on 2019-1-2 09:53:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-2 06:42
优化加不加弥散对结构影响甚微,优化时候没必要加,纯粹浪费时间

好的  谢谢Sob老师

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发表于 Post on 2019-1-2 10:10:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-27 11:16
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

老师您好,我根据您的解决SCF不收敛的帖子,尝试了很多组的关键词,还有加在一起组合的,但是仍然不能收敛,一方面是由于我没有找到病根对症下药,我不知道怎么去找是什么原因导致的不收敛,只能看到结果文件末尾显示收敛失败,请老师指导下找到病根的方法,此外,结果文件在Gview中无法看能量变化(options选项无法使用),也不能判断是否震荡,我加了解决震动的关键词试着优化了,仍然显示不收敛,所以请老师指导一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-2 11:09:57 | 只看该作者 Only view this author
cqu_xiaoq 发表于 2019-1-2 10:10
老师您好,我根据您的解决SCF不收敛的帖子,尝试了很多组的关键词,还有加在一起组合的,但是仍然不能收 ...

关于SCF不收敛的解决、原因,我全都在博文里说的,没有任何可以补充的
SCF不收敛和几何优化不收敛是两回事。gv打开优化任务的输出文件如果看不到收敛曲线,说明打开时候没选read intermediate geometries
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