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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-11 16:44:44 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2019-3-10 12:10
Sob老师好,最近用Gaussian09计算NBO想生成.47文件,但是计算时报如下错误:
Storage needed:    744664  ...

NBO 3.1的bug
用Multiwfn生成就完了,把fch载入Multiwfn,进入主功能100的子功能2,选择导出.47。要么你就用更新的NBO版本,需要花钱
某些情况换基组也能解决,但有的时候绕不过去。
别信网上乱七八糟说法
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-11 16:46:41 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2019-3-11 10:29
老师,计算层状材料之间的氢键作用,我选择了周期性结构,使用opt,freq作为计算任务,最后却没有优化到固 ...

你用高斯做PBC计算?怎么会跑到同一个面上?这样理应会造成很大的位阻。最好上图来说明
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-11 16:47:13 | 只看该作者 Only view this author
Unisan 发表于 2019-3-10 21:44
Sob老师,请问想从理论层次上了解分子激发(TD,UV)计算结果中的f值,以及激发态寿命计算的理论基础该看那 ...

把此文以及其中提到的文章认认真真看了就足够了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-11 16:48:08 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2019-3-11 10:00
请问老师,常看到不同文献计算同样一个催化反应,有的是一般气相催化,有的是电催化,有的是光催化,请问这 ...

这个话题比较大,建议你单独发帖
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发表于 Post on 2019-3-11 17:13:12 | 只看该作者 Only view this author

TDDFT计算激发态的输入文件相关问题

sobereva大神,我看了您的帖子:使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征(http://sobereva.com/434http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html),对里面3.1部分讲的:"而且任务只能是对单个结构做激发态计算,不能是诸如激发态优化、激发态振动分析的输出文件",想请教sobereva大神,对单个结构做激发态计算的输入文件应该包含那些关键词。先谢过大神了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-11 17:45:42 | 只看该作者 Only view this author
小螃蟹 发表于 2019-3-11 17:13
sobereva大神,我看了您的帖子:使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征(http://so ...

直接写TD就完了,这里有例子
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html

"使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征"文中也都有现成的例子
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发表于 Post on 2019-3-11 20:20:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-11 17:45
直接写TD就完了,这里有例子
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobere ...

谢谢sobereva大神,我会好好看看的

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发表于 Post on 2019-3-11 21:58:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-11 16:47
把此文以及其中提到的文章认认真真看了就足够了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的 ...

哦,谢谢老师!
还想请教一下,若知道x-x激发权重、x nm激发 f值各不相同的本质该如何做?或是这些因子是一系列复杂计算得出的,人力不可及?

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发表于 Post on 2019-3-11 22:27:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-11 16:44
NBO 3.1的bug
用Multiwfn生成就完了,把fch载入Multiwfn,进入主功能100的子功能2,选择导出.47。要么你 ...

好的,谢谢Sob老师回复,我试试用咱们Multiwfn生成一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-12 05:17:26 | 只看该作者 Only view this author
Unisan 发表于 2019-3-11 21:58
哦,谢谢老师!
还想请教一下,若知道x-x激发权重、x nm激发 f值各不相同的本质该如何做?或是这些因子 ...

想考察f用Multiwfn进行分析,看
Multiwfn支持的电子激发分析方法一览
http://sobereva.com/437http://bbs.keinsci.com/thread-11406-1-1.html

f主要决定于跃迁电偶极矩的大小,如上文提到的,在Multiwfn里可以直接给出各对轨道间跃迁对其产生的贡献(还可以先转换为NTO再去讨论主导的NTO之间的偶极矩积分、同时观看这俩NTO来分析),可以给出跃迁偶极矩密度、片段对跃迁偶极矩的贡献便于了解不同区域产生的影响,等等
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发表于 Post on 2019-3-12 15:56:20 | 只看该作者 Only view this author
老师您好!有一个问题想请教您:
我想研究一种类似于活性炭的固体材料中不同的官能团(比如环氧基、羧基)对CO2气体的吸附作用,想用gaussian进行计算。想请问老师,在建立碳材料模型时,我可以建立一个类似石墨烯的分子片段,将四周的C原子补上H,在适当的位置添加官能团,进行建模吗?!如果可以,需不需要建立的含不同官能团的分子片段具有一样多的C原子数?!
如果上述方法不可行,那是不是只能建成碳纳米带或石墨烯那种周期性结构了?!文章中多是这样的方式,也想请问老师,这两种建模方式那种更好?!
还有一个问题:算吸附能,也就是结合能,是不是应当用复合物的电子能-复合状态下的各分子的电子能?!即把复合物中的单个分子结构取出来,算单点能呢?!

以上是我当前遇到的问题,恳请老师予以指教,十分感谢!!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-12 19:11:11 | 只看该作者 Only view this author
sccc 发表于 2019-3-12 15:56
老师您好!有一个问题想请教您:
我想研究一种类似于活性炭的固体材料中不同的官能团(比如环氧基、羧基) ...

按你说的取一个边缘饱和的石墨烯片段算这个完全可以。不需要碳原子数非得相同。
以这种方式通过Gaussian等量化程序算,比起用第一性程序算方便得多,计算级别可选余地大得多,而且更关键的是可以结合Multiwfn做各种分析,文章内容一下子就充实起来了,不愁没得写,看:
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

怎么算看吸附能具体用在哪。如果跟实验对比,就得计算热力学量,这就得优化每个片段;如果只是理论方式研究吸附结构下的结合能,就不需要优化片段,用电子能量求差就够了。
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发表于 Post on 2019-3-12 19:26:36 | 只看该作者 Only view this author
请问各位资源分享板块的其他资料怎么查看,我只能找到当前蓝体字资料,如下图

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发表于 Post on 2019-3-12 19:28:44 | 只看该作者 Only view this author
shiyanan 发表于 2019-3-12 19:26
请问各位资源分享板块的其他资料怎么查看,我只能找到当前蓝体字资料,如下图

不好意思我会了

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发表于 Post on 2019-3-12 19:41:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-12 19:11
按你说的取一个边缘饱和的石墨烯片段算这个完全可以。不需要碳原子数非得相同。
以这种方式通过Gaussian ...

十分感谢老师的耐心解答!!!

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