计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8551#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 04:45:47 | 只看该作者 Only view this author
mlzhao 发表于 2019-3-13 17:11
老师,我在opt计算的时候为了防止出现l9999的错误在指令上加了NoEigenTest,但计算完后还是出现这个报错, ...

几何优化不收敛。
你又不是找过渡态,加noeigen完全多余
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8552#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 04:46:33 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2019-3-13 16:21
嗯嗯,谢谢老师。还有一个问题,我也遇到了http://bbs.keinsci.com/thread-1851-1-1.html里面描述的问题 ...

不要群里和论坛里同时问相同问题,群里已经回了
没有办法避免,要么fullscf要么BOMD
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8553#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 04:47:59 | 只看该作者 Only view this author
wth1219 发表于 2019-3-13 19:34
谢谢老师的答复!已拜读您推荐的文章。
然而现在又需要在已有优化结构的基础上计算同位素的振动频率,故 ...

甭用geom=check。直接把之前的优化任务输出文件打开,保存成新的gjf,在里面适当位置加上(iso=13)就完了。
另外,给Pople基组加弥散的+要写在G的前头
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

146

帖子

0

威望

1329

eV
积分
1475

Level 4 (黑子)

8554#
发表于 Post on 2019-3-14 09:36:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-14 04:46
不要群里和论坛里同时问相同问题,群里已经回了
没有办法避免,要么fullscf要么BOMD

老师,不可以加大时间步长吗?

46

帖子

0

威望

192

eV
积分
238

Level 3 能力者

8555#
发表于 Post on 2019-3-14 10:45:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-14 04:44
meta-GGA泛函一般都是在原文里就定义了什么相关泛函和什么交换泛函组合,meta-GGA交换泛函与乱七八糟的相 ...

老师,在高斯手册中描述有一些交换泛函是可以独立使用的,这样仅仅计算交换泛函要怎么应用?

22

帖子

0

威望

155

eV
积分
177

Level 3 能力者

8556#
发表于 Post on 2019-3-14 13:08:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-10 02:59
先把弥散去了再说,明显导致不容易收敛,对当前体系还根本没有必要,博文中特意强调了这点
对Fe这年头用 ...

社长大人,你好 我又重新修改了算法把弥散去除了,赝势对于Fe选择了SDD  电子选了6-31G*    但还是无法得到优化。麻烦再帮我看一下具体什么地方出了问题,我这个优化了好久,一直无法得到结果。附上输入,输出文件。

GOETHITE-14.LOG

294.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

goethite-14.gjf

2.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

10

帖子

0

威望

2806

eV
积分
2816

Level 5 (御坂)

8557#
发表于 Post on 2019-3-14 14:01:40 | 只看该作者 Only view this author

虚频及自旋多重度

在结构优化的时候出现虚频,该怎么办?另外如何处理体系的自旋多重度的问题。请赐教。

20

帖子

0

威望

343

eV
积分
363

Level 3 能力者

8558#
发表于 Post on 2019-3-14 16:07:44 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 用orca做NTO分析 产生的nto文件怎么查看轨道 Multiwfn不能直接打开

td_NTO.s1.nto

1.85 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8559#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 16:47:51 | 只看该作者 Only view this author
haha 发表于 2019-3-14 16:07
sob老师 用orca做NTO分析 产生的nto文件怎么查看轨道 Multiwfn不能直接打开

本来手册和博文里就从来没说Multiwfn能打开ORCA的NTO文件
干嘛不用Multiwfn直接做NTO分析而用ORCA那个功能做?
仔细看
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377http://bbs.keinsci.com/thread-5980-1-1.html

文中做法完全能用于对ORCA的TDDFT产生NTO,对输入文件的要求在手册3.21节写明了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8560#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 16:50:08 | 只看该作者 Only view this author
小小范 发表于 2019-3-14 14:01
在结构优化的时候出现虚频,该怎么办?另外如何处理体系的自旋多重度的问题。请赐教。

有虚频这种司空见惯老生常谈的问题去论坛首页google框搜,不要在发帖求助
仔细看
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html

“处理体系的自旋多重度的问题”指代不明,把问题交代清楚。都没说有什么问题谈何解决?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8561#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 16:50:50 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2019-3-14 09:36
老师,不可以加大时间步长吗?

加大步长估计问题更严重
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8562#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 16:51:36 | 只看该作者 Only view this author
jslo 发表于 2019-3-14 10:45
老师,在高斯手册中描述有一些交换泛函是可以独立使用的,这样仅仅计算交换泛函要怎么应用?

只用交换泛函并无实际意义。DFT之所以比HF强正在于考虑了相关泛函部分
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

8563#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-14 16:54:03 | 只看该作者 Only view this author
yq1123088 发表于 2019-3-14 13:08
社长大人,你好 我又重新修改了算法把弥散去除了,赝势对于Fe选择了SDD  电子选了6-31G*    但还是无法得 ...

解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
我没有可以补充的。

不过opt里加上calcfc,再加上maxstep=10,notrust减小优化步长上限,对于稳定初始优化过程可能有益从而避开结构变化太厉害导致的SCF难收敛的潜在可能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

175

帖子

0

威望

1057

eV
积分
1232

Level 4 (黑子)

8564#
发表于 Post on 2019-3-14 23:06:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好。我最近再算一个水分子转移氢的反应。由于体系较大,我优化结构用的是6-31g*和lanl2dz基组。 我用加大基组算能量金属是用SDD基组,非金属应该6-31g**基组可以吗?还是必须得用6-31+g**基组,有没有处于两者之间的基组呢。

10

帖子

0

威望

2806

eV
积分
2816

Level 5 (御坂)

8565#
发表于 Post on 2019-3-14 23:20:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-14 16:50
有虚频这种司空见惯老生常谈的问题去论坛首页google框搜,不要在发帖求助
仔细看
Gaussian中几何优化收 ...

就是在计算单电能或几何结构优化的时候,在输入文件的时候,不是要选择自旋多重度吗?GAUSSIAN会给出好几个选择,那要如何做决定呢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 16:19 , Processed in 0.782085 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list