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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-4-15 12:46:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-14 11:04
FMO理论一般不考虑HOMO、LUMO以外的

老师,那HOMO和LUMO以外轨道之间的作用有没有统一的名称或理论?我看资料时看到,轨道之间的作用很广泛,有HOMO,LUMO,还有占据轨道和占据轨道之间的等。

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发表于 Post on 2019-4-15 14:36:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-15 09:51
弱相互作用算能量必须加弥散,优化不是必须的(但此时需要用3-zeta)

明白了 谢谢老师

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发表于 Post on 2019-4-15 22:00:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 阿di达思 于 2020-12-11 14:15 编辑

sob老师您好!可否用静电势解释不同污染物去除效果的差异?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 00:09:00 | 只看该作者 Only view this author
阿di达思 发表于 2019-4-15 22:00
sob老师您好!可否用静电势解释粘土矿物对不同阴离子型污染物吸附效果的差异?

有可能可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 00:09:41 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2019-4-15 12:46
老师,那HOMO和LUMO以外轨道之间的作用有没有统一的名称或理论?我看资料时看到,轨道之间的作用很广泛, ...

没听说过
“占据轨道和占据轨道之间”这属于交换互斥,此文里提了
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 00:10:37 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2019-4-15 12:15
sob老师您好!下面那个计算溶剂重整能的公式这么理解呀?这四个能量是怎样算出来的?和您帖子中考虑非平衡 ...

乱谈外重组能的计算
http://sobereva.com/333
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发表于 Post on 2019-4-16 09:58:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 498746012 于 2019-4-16 09:59 编辑

谢谢sob老师,您帖子中是donor的外重组能,是不是acceptor也是同样的计算流程。把donor和acceptor两个外重组能加起来就是总的外重组能,这样理解对吗?按照您帖子中算第二步能量E(UB3LYP) =  -385.643911228和您的为什么不一样呀,我的输入文件如下,而且读第一步的chk文件,结构为第一步优化好的结构,# b3lyp/6-31g*   scrf=read

alkene_3

1 2
C       2.4348210       -0.7089820      -0.0000010
C       1.2454540       -1.4040750      0.0000030
C       0.0000140       -0.7173650      0.0000000
C       -0.0000160      0.7173600       0.0000000
C       1.2454320       1.4040790       0.0000030
C       2.4348050       0.7090030       -0.0000020
H       -1.2428750      -2.4915960      0.0000060
H       3.3796150       -1.2456590      -0.0000050
H       1.2429120       -2.4915830      0.0000010
C       -1.2454360      -1.4040860      0.0000000
C       -1.2454570      1.4040810       0.0000000
H       1.2428800       2.4915890       0.0000000
H       3.3795950       1.2456870       -0.0000050
C       -2.4348170      0.7089850       0.0000000
C       -2.4348010      -0.7090000      -0.0000020
H       -1.2429010      2.4915880       0.0000040
H       -3.3796230      1.2456440       -0.0000020
H       -3.3795950      -1.2456770      -0.0000010

noneq=read

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发表于 Post on 2019-4-16 11:03:50 | 只看该作者 Only view this author
Win 64版的Gaussian 16 最多使用32核?

操作系统Win 10 专业版

卢老师推荐的双路服务器CPU:2* XEON E5-2686 v4

输入文件:
%mem=36GB
%chk=C:\Users\win\Desktop\lx\s1gas.chk
%nprocshared=36
#P b3lyp 6-31G* opt

输出文件的第一句就是
Default is to use a total of  32 processors:
                               32 via shared-memory
                                1 via Linda
Entering Link 1 = C:\G16W\l1.exe PID=      9864.
  
Copyright (c) 1988-2017, Gaussian, Inc.  All Rights Reserved.
....................

在Cite this work as:
Gaussian 16, Revision B.01,
的后面有如下有“Will use up to 36 processors via shared memory.”
******************************************
Gaussian 16:  EM64W-G16RevB.01 16-Dec-2017
                14-Apr-2019
******************************************
%mem=36GB
%chk=C:\Users\win\Desktop\mn.chk
%nprocshared=36
Will use up to 36 processors via shared memory.
------------------

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 11:09:31 | 只看该作者 Only view this author
yygong 发表于 2019-4-16 11:03
Win 64版的Gaussian 16 最多使用32核?

操作系统Win 10 专业版

实测Win64 Gaussian核数很多时效率极低,在我来看没太大用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 11:11:20 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2019-4-16 09:58
谢谢sob老师,您帖子中是donor的外重组能,是不是acceptor也是同样的计算流程。把donor和acceptor两个外 ...

我没时间细看。注意高斯版本对于牵扯溶剂模型问题计算结果影响明显
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发表于 Post on 2019-4-16 11:46:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-16 11:11
我没时间细看。注意高斯版本对于牵扯溶剂模型问题计算结果影响明显

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2019-4-16 11:50:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-16 11:09
实测Win64 Gaussian核数很多时效率极低,在我来看没太大用

卢老师好,请问在win系统装VMware虚拟机弄个centos,用linux版高斯跑30来个核数是效率可以不?如果不好我直接上linux,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-16 12:18:09 | 只看该作者 Only view this author
yygong 发表于 2019-4-16 11:50
卢老师好,请问在win系统装VMware虚拟机弄个centos,用linux版高斯跑30来个核数是效率可以不?如果不好我 ...

vmware虚拟机的客户机最多支持16核
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发表于 Post on 2019-4-16 13:37:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-16 12:18
vmware虚拟机的客户机最多支持16核

谢谢卢老师指导!

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发表于 Post on 2019-4-17 10:04:20 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,使用大核和小核赝势分别计算了铀酰离子配合物的结合能,结果发现小核赝势下配合物的结合能更大,且小核赝势下配位键的距离也更短,从基组层面上应该如何分析呢?

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