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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 03:41:17 | 只看该作者 Only view this author
缄默寒夏 发表于 2019-4-18 22:11
使用直角坐标和Z-矩阵各有哪些优劣?考虑对称性会为计算带来哪些好处和坏处?



若无特殊情况,一律用笛卡尔坐标
非得用内坐标写的情况一般也就是需要对某些内坐标做刚性扫描的时候,见
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html
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发表于 Post on 2019-4-19 15:53:12 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我之前读取基态优化结构的时候都是取最后一帧保存成输入文件进行激发态优化,我现在疑惑的是如下图讲的,我这样做是不是并没有读取初猜波函数,只是给出了初猜结构,那什么时候需要读取初猜波函数呢?这两种做法有什么区别?

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发表于 Post on 2019-4-19 17:05:34 | 只看该作者 Only view this author
sober老师,想你叫您两个问题:
1、请问有没有办法对NTO的基态和激发态轨道做电子密度差图呀(如果可以是否合理)?
2、请问空穴-电子分析与基态-激发态电子密度差分析有什么区别?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 22:00:21 | 只看该作者 Only view this author
Unisan 发表于 2019-4-19 17:05
sober老师,想你叫您两个问题:
1、请问有没有办法对NTO的基态和激发态轨道做电子密度差图呀(如果可以是 ...

1 这个问题莫名其妙。“NTO的基态和激发态轨道”根本没法这么说
2 把此文仔细看懂,自然就知道空穴-电子分析能获得多得多得多的信息
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 22:06:50 | 只看该作者 Only view this author
shiyanan 发表于 2019-4-19 15:53
老师您好,我之前读取基态优化结构的时候都是取最后一帧保存成输入文件进行激发态优化,我现在疑惑的是如下 ...

用guess=read从chk里读取比默认情况下给出的初猜波函数更好的波函数作为初猜可以节约算参考态SCF部分的耗时
但由于这对于激发态优化来说是微不足道的,写guess=read没必要,可能也就节约你总任务的2%的耗时
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发表于 Post on 2019-4-20 00:05:56 | 只看该作者 Only view this author
老师,态密度分析能够解释哪些问题?我看了一下multiwfn的手册,发现DOS可以解释轨道的成分,不同原子对轨道的贡献。但是轨道成分分析不就可以了吗?请老师说一下,DOS分析的主要作用和功能,能解释哪些问题?

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发表于 Post on 2019-4-20 14:35:10 | 只看该作者 Only view this author

高斯计算中能否查看具体的轨道信息 求助

各位老师好,就是我计算了一个过渡态,然后能否查看这个高斯文件中相应的信息,指的是分子的某一个轨道被另一个分子的某一个电子占据的情况。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-20 23:47:38 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2019-4-20 00:05
老师,态密度分析能够解释哪些问题?我看了一下multiwfn的手册,发现DOS可以解释轨道的成分,不同原子对轨 ...

轨道数目很多,甚至近简并时,通过DOS图分析直观方便得多
而且还有Local DOS,靠挨个计算轨道成份是几乎没法考察的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-20 23:49:10 | 只看该作者 Only view this author
ad890 发表于 2019-4-20 14:35
各位老师好,就是我计算了一个过渡态,然后能否查看这个高斯文件中相应的信息,指的是分子的某一个轨道被另 ...

过渡态的时候分子原有形态已经基本被破坏了,已经没法说某分子的某个轨道了
顶多是某些情况下利用Multiwfn的CDA模块讨论片段轨道间的相互作用,仔细看
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
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发表于 Post on 2019-4-21 00:47:54 | 只看该作者 Only view this author
老师,我计算了气相反应中不同多重度的反应路径,多重度高的反应路径能垒高,但是相对能量低;多重度低的反应路径能垒低,但是相对能量要高。如何分析判断反应是按照哪种方式进行的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-21 02:04:30 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2019-4-21 00:47
老师,我计算了气相反应中不同多重度的反应路径,多重度高的反应路径能垒高,但是相对能量低;多重度低的反 ...

都有可能。参考两态反应性的综述:Acc. Chem. Res. 2000, 33, 139-145
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发表于 Post on 2019-4-21 10:56:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-21 02:04
都有可能。参考两态反应性的综述:Acc. Chem. Res. 2000, 33, 139-145

老师,是不是所有重金属参加的反应中都会有自旋交叉的现象(除非反应路径的能量上没有交叉)?

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发表于 Post on 2019-4-21 22:36:58 | 只看该作者 Only view this author
Sobereva老师您好,         问题1,我用Multiwfn对一个开壳层三重态分子进行轨道定域化,来分析某些原子间成键断键情况,定域化之后的轨道分为α电子部分和β电子部分两套轨道,老师这种情况下应该怎么来分析和处理,或者有什么办法能把定域化的两套轨道合并成一套。
         问题2,我用NBO6.0算问题1中的开壳层三重态分子的NBO轨道,来分析某些原子间成键断键情况时,算出的结果同样分为α电子部分和β电子部分两套轨道,老师这种情况下应该怎么来分析和处理,或者有什么办法能把定域化的两套轨道合并成一套。老师下面的图片是我用NBO6.0算NBO轨道的输入文件的截图。



                                                                                                                                                                                                                                                                                      谢谢 Sobereva老师 !   

NBO6.0共振输出文件截图.png (82.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-22 01:07:30 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2019-4-21 10:56
老师,是不是所有重金属参加的反应中都会有自旋交叉的现象(除非反应路径的能量上没有交叉)?

应该说有过渡金属容易导致出现势垒不是特别高的自旋交叉,因此在计算反应路径的时候往往需要考虑交叉对研究的问题的影响
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-22 01:08:57 | 只看该作者 Only view this author
zhaoruihua 发表于 2019-4-21 22:36
Sobereva老师您好,         问题1,我用Multiwfn对一个开壳层三重态分子进行轨道定域化,来分析某些原子间 ...

如本帖1L所示,波函数分析问题请发到“波函数分析与Multiwfn”这个专门的板块
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