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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-26 03:13:16 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2019-6-25 10:07
老师,Mn+,三重态的轨道我用multiwfn计算时为什么每次计算出来的轨道都不一样呢?怎么保证每次都一样(只有 ...

问题不明确
Multiwfn只是显示轨道的,产生轨道本身是量化程序干的事
我不知道什么叫“每次都不一样”。说不清楚就上传文件来明确说明
scf=tight本来就是默认的,和这个完全扯不上关系
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2019-6-26 13:59:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-26 03:13
问题不明确
Multiwfn只是显示轨道的,产生轨道本身是量化程序干的事
我不知道什么叫“每次都不一样”。 ...

最近有点晕,说话有点语无伦次了。fragment molecular orbital分析计算的是部分分子结构的轨道。但是如果用gaussian计算多次比较后发现用multiwfn查看时轨道的能量值不一样啊。反复试了一下,发现如果同样结构(Mn+)的两次计算之间计算其他的计算任务,那么这两次的结果就不一样。现在将Mn+的两个计算结果上传,请查看。

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发表于 Post on 2019-6-26 17:29:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-24 02:42
1 实际量子化学的数值计算中不是解久期方程,而是做矩阵对角化。结构化学书里那种手算求解的时候才是解久 ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2019-6-27 13:59:20 | 只看该作者 Only view this author
【求助:简缩 Fukui 函数值大小影响问题】
老师您好,为了比较不同位点同自由基反应的难易程度,我用 Mutiwfn 计算出了分子的简缩 Fukui 函数的F0值,目前我知道值越大说明越容易和自由基反应,但是我想要问一下,两个原子之间的 F0 值差距多少时,与自由基的反应会有明显差别,有文献中提到这个问题吗?
谢谢老师!

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发表于 Post on 2019-6-29 11:49:31 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师您好,

我刚接触计算化学,很多东西还在学习当中,如有描述不合适的地方请见谅。我想要计算两个距离为4 nm的银纳米团簇的吸收光谱来验证两个纳米团簇之间存在plasmonic耦合,因为具有plasmonic性质的Ag粒子在光激发下会形成偶极,偶极与偶极之间的相互作用会影响其吸收光谱。能否用可以计算弱相互作用的双杂化泛函通过TDDFT来计算两个纳米团簇的吸收光谱?我用的软件是orca,我已经尝试了B2PLYP和B2GP-PLYP。同单个的银纳米簇相比,两个间距为4 nm的银纳米簇的吸收光谱发生了2nm的红移。这种结果可以认为是偶极的影响吗?多谢老师~!

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发表于 Post on 2019-6-29 16:37:51 | 只看该作者 Only view this author
老师们好!我想问一下:
1.QM/MM与oniom的主要区别在哪里?
2.两者在gif表头方面有哪些区分?


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-1 10:14:26 | 只看该作者 Only view this author
狄拉克自带buff 发表于 2019-6-29 16:37
老师们好!我想问一下:
1.QM/MM与oniom的主要区别在哪里?
2.两者在gif表头方面有哪些区分?

Gaussian做不了QM/MM,只能做ONIOM(QM:MM)来试图等效体现QM/MM的效果

二者描述QM和MM部分耦合的思路截然不同。随便找点介绍两个方法的文章很快就懂了

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狄拉克自带buff + 4 谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-1 10:15:01 | 只看该作者 Only view this author
teao 发表于 2019-6-27 13:59
【求助:简缩 Fukui 函数值大小影响问题】
老师您好,为了比较不同位点同自由基反应的难易程度,我用 Mut ...

波函数分析问题请发到Multiwfn与波函数分析专版,注意看此帖1L的红字

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-1 10:18:01 | 只看该作者 Only view this author
wslcc 发表于 2019-6-29 11:49
sob 老师您好,

我刚接触计算化学,很多东西还在学习当中,如有描述不合适的地方请见谅。我想要计算两个 ...

我对你说的这种作用机制不太了解。
这红移只有一丁点,未必能体现这点。
没必要非得用双杂化泛函,普通泛函照样能说明。建议你用个普通泛函也做计算,看是否也同样有这种特征,如果有的话,用Multiwfn做空穴-电子分析(见http://sobereva.com/434),考察一下跃迁的本质,看看能否和你说的作用机制联系起来
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lufenghxu 发表于 2019-6-26 13:59
最近有点晕,说话有点语无伦次了。fragment molecular orbital分析计算的是部分分子结构的轨道。但是如果 ...

垃圾关键词加得太多了

我不知道你说的“结果”具体指什么,能量还是轨道图形。单个原子带nosymm的时候求解的波函数明显有任意性,诸如每次算的p轨道朝向不同
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发表于 Post on 2019-7-1 19:27:10 | 只看该作者 Only view this author

关于分子中带Se元素的计算

各位老师好,如果我的分子带Se原子,我在计算的时候有必要加上f角动量吗,我想计算的分子带一个硒吩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-1 19:42:24 | 只看该作者 Only view this author
qinsc 发表于 2019-7-1 19:27
各位老师好,如果我的分子带Se原子,我在计算的时候有必要加上f角动量吗,我想计算的分子带一个硒吩。

怎么正确问适合什么基组在这里写明了:
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

仔细看完了,该不该用带f极化档次的基组自然就心里有数了
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发表于 Post on 2019-7-1 20:22:25 | 只看该作者 Only view this author

DFT包含TD-DFT吗?

各位老师好,我下面的图片对吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-2 07:49:46 | 只看该作者 Only view this author
zhuhaibo 发表于 2019-7-1 20:22
各位老师好,我下面的图片对吗?

原始的DFT只能算基态,TDDFT是把DFT进一步扩展成含时形式,重大用处之一是可以用于算激发态
包不包含只是个说法问题,看语境。
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发表于 Post on 2019-7-2 15:58:06 | 只看该作者 Only view this author
老师好,在相同计算条件下,计算荧光发射能过程中所得到振子强度越大,是否意味发光效率越高?谢谢

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