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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-8-9 09:53:10 | 只看该作者 Only view this author
采用混合赝势基组对 金属配合物 Cr 4H2O 2Cl 进行opt freq 出错,请问是基组选的不对吗?

CrCl4H2O2.gjf

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CrCl4H2O2 1.zip

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发表于 Post on 2019-8-9 10:15:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-9 04:06
没大问题,虽然可能有人会挑刺

谢谢老师~

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发表于 Post on 2019-8-10 02:07:53 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,麻烦问一下,我在跑irc的时候,正常结束,但是打开Gaussview时出现unresolvable inconsistency between charge and multiplicity and orbital occupacies. Orbital data will be ignored。它从二重态变成单重态了,这该怎么解决呢?
第二个问题,我跑出来的是一个单峰状态,最低点和最高点事我要的构型,但是它继续跑回原构型了,我按着帖子的三个方法试了,但没有解决,和上面的多重态的变化有关系吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-10 08:11:37 | 只看该作者 Only view this author
钱慧璇 发表于 2019-8-9 09:53
采用混合赝势基组对 金属配合物 Cr 4H2O 2Cl 进行opt freq 出错,请问是基组选的不对吗?

别在两个地方同时问相同问题(置顶的新社员必读里明确说了),你在http://bbs.keinsci.com/thread-14171-1-1.html这里已经问了
下次出现此情况将扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-10 08:13:28 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2019-8-10 02:07
sob老师,麻烦问一下,我在跑irc的时候,正常结束,但是打开Gaussview时出现unresolvable inconsistency be ...

1 别管它,只要IRC能正常看就行了。往往是gview的bug。或者如果你用的是gv5,尝试gv6
2 看不懂你的问题,最好把IRC曲线图贴出来
跑IRC过程自旋多重度不会变化,gjf里自旋多重度是多少就是多少,程序不会自己中途切换
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发表于 Post on 2019-8-10 10:43:10 | 只看该作者 Only view this author
过渡态是二重态,跑irc就自动变成单重态,试了很多次,不知道怎么回事。这个是我跑出来的irc图形,麻烦sob老师帮我看看。

000-irc.jpg (102.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

000-irc.jpg

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发表于 Post on 2019-8-10 11:00:04 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我做的体系三个原子,两个异构体,一个直线型的,非金属在中间,金属在两边,一个三角形的,怎么也找不到过渡态,qst2也找不出来,怎么处理呢?

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发表于 Post on 2019-8-10 13:01:32 | 只看该作者 Only view this author
学习了

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发表于 Post on 2019-8-10 15:54:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-10 08:11
别在两个地方同时问相同问题(置顶的新社员必读里明确说了),你在http://bbs.keinsci.com/thread-14171- ...

好的,一定注意

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发表于 Post on 2019-8-10 16:05:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师好,我计算了一个模型分子,想通过模型分子(57个原子)优化的时间来估计下优化一个真实大分子(185个原子)需要多久时间,可以用什么公式呢?优化的方法的B3LYP/6-31G(d)-LANL2DZ,谢谢老师!

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发表于 Post on 2019-8-10 16:57:45 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,我想问一下,为什么我在计算的时候把硫酸的两个氢都设置成了氘,但是输出的文件里的硫酸两个氢算出来是氕不是氘呢?附件里是我的输入和输出文件。

D2SO4.gjf

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D2SO4.LOG

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发表于 Post on 2019-8-10 21:52:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 欢乐多 于 2019-8-10 22:52 编辑

老师,运算提示no space, 做振动分析,占这么大空间,是不收敛导致的吗?这个构象现在换基组得到的ECD,与其他构象另一种基组得到的ECD能够一起进行玻尔兹曼比例分布得到最终的ECD吗?

TIM图片20190810214606.png (14.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

TIM图片20190810214606.png
终日寻春不见春
芒鞋踏破岭头云
归来偶把梅花嗅
春在枝头已十分

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-11 06:14:55 | 只看该作者 Only view this author
欢乐多 发表于 2019-8-10 21:52
老师,运算提示no space, 做振动分析,占这么大空间,是不收敛导致的吗?这个构象现在换基组得到的ECD,与 ...

和收不收敛毫无关系
进去看看到底是什么文件占的自然就知道了
不能。基组必须统一,否则没法横向对比
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流年狭路相逢 发表于 2019-8-10 16:57
老师你好,我想问一下,为什么我在计算的时候把硫酸的两个氢都设置成了氘,但是输出的文件里的硫酸两个氢算 ...

同位素设定根本不影响几何优化结果,仔细看
谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响
http://sobereva.com/423http://bbs.keinsci.com/thread-10159-1-1.html
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陈丢丢 发表于 2019-8-10 16:05
sobereva老师好,我计算了一个模型分子,想通过模型分子(57个原子)优化的时间来估计下优化一个真实大分子(1 ...

没法这样估计
实际算一下185原子的单点,乘上几十倍差不多就是优化需要的时间。
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