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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2020-4-17 09:04:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-4-16 18:29
你先确认NH基态到底是单重态还是三重态,然后用量化程序算完了看分子轨道图是怎么分布的
就算得失电子过 ...

sob老师您好。我做了NH自由基的分子轨道,确实是有非键轨道的,NH得电子后也确实填充到了非键轨道中。
我最近看了一篇文献,讲的V2CO2中引入过渡金属原子后,O吸附H的能力变弱。他认为是O从过渡金属得到电子,填充到了O-H的反键轨道中引起。轨道弛豫和电子相关效应并没有提,是大体系下轨道弛豫和电子相关效应的影响很小吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-19 00:42:58 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2020-4-17 09:04
sob老师您好。我做了NH自由基的分子轨道,确实是有非键轨道的,NH得电子后也确实填充到了非键轨道中。
...

并非很小,只不过他这种说法更形象直白,试图抓住关键因素,而轨道弛豫、电子相关,即便起到重要因素,也没法形象地表述。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-4-19 01:14:31 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,我以IRC=(calcfc,LQA,maxpoints=50,stepsize=15)为关键词进行IRC计算后,发现一边走了19步达到了PES minimum自动停止,而另一边走满了50步还没能把能量走平,所以想再续算20个点。于是我将关键词改为IRC=(restart,maxpoints=70)并复制了chk文件重新提交了任务,但是很快就报错停止了。报错信息显示为:
PESDtA: IPath=     1 IPoint=          52 Max Points=          51
PESDtA: Invalid IPoint.
Error termination ... l123.exe
因为之前没加见到过这样的错误,所以我想请教一下您,请问这样一般是什么原因导致的呢?谢谢老师。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-19 01:37:57 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2020-4-19 01:14
Sob老师,我以IRC=(calcfc,LQA,maxpoints=50,stepsize=15)为关键词进行IRC计算后,发现一边走了19步达到了P ...

没见过这种情况
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发表于 Post on 2020-4-19 01:41:34 | 只看该作者 Only view this author

好的,那我直接指定没算完的方向,重新从头跑一下IRC吧。因为体系也不是特别的大。谢谢老师。
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发表于 Post on 2020-4-19 13:18:18 | 只看该作者 Only view this author

请问如何进入BES库,拷基组定义?

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发表于 Post on 2020-4-19 13:59:02 | 只看该作者 Only view this author
那叫BSE基组库。
进去后左边选择你要的基组,右边周期表选择你要的元素,下面Format选择基组文件格式(就是给什么程序用的),点Get Basisa Set 就得到了基组定义数据的文件。
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发表于 Post on 2020-4-19 14:22:33 | 只看该作者 Only view this author
哦,新手不是很了解。去哪能找到BES基组库呢?

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发表于 Post on 2020-4-19 14:29:13 | 只看该作者 Only view this author

有个问题想请教一下sob老师。上图是我的一个单点计算的out文件的summary部分,我想请教一下,图中的E(RM062X)这个能量代表什么意思,是考虑了零点能校正之后的结果吗?如果我想计算通过氢键等弱作用结合的体系的结合能,取上图中的E来进行相关计算合理吗?谢谢。

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发表于 Post on 2020-4-19 14:30:52 | 只看该作者 Only view this author
茗漾696 发表于 2020-4-19 14:22
哦,新手不是很了解。去哪能找到BES基组库呢?

那 叫 B S E

https://www.basissetexchange.org/

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发表于 Post on 2020-4-19 16:02:01 | 只看该作者 Only view this author
Google拼错了都能给你搜出来,何况2L还告诉你了。做伸手党花的时间比自己搜还多。


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发表于 Post on 2020-4-19 16:54:17 | 只看该作者 Only view this author

请问在高斯输入文件中,b972/pcSseg-1的基组定义怎么写?

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发表于 Post on 2020-4-19 17:09:30 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2020-4-19 17:19:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 刘小英雄steven 于 2020-4-19 17:45 编辑

老师好,1)静态DFT计算中在涉及薛定谔方程这块是只考虑了电子哈密顿算符吗?即未将原子核动能哈密顿算符考虑在内。2)BO近似可以忽略电子哈密顿算符里面得原子核之间得作用吗?(知乎似乎有人这样讲,利用BO近似使得哈密顿算符只剩下电子动能+外势+电子间作用三项,传送门https://www.zhihu.com/question/30510921)。3)所以一般量化软件opt任务求得电子能E,就是动能+电子与电子间的库仑互斥能+核与核之间的库仑互斥能+电子与核之间的库仑吸引能得的代数和,分别对应薛定谔方程左边4个算符吗? 4)交换关联项仅仅不描述了电子和电子间作用,也有核与核/核与电子间的作用吗?            我是电力专业,真的有点蒙,请老师指点指点

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发表于 Post on 2020-4-19 18:07:38 | 只看该作者 Only view this author

如何输入def2-TZVPPD的计算格式,希望能给个实例,谢谢。

如标题,我想用def2-TZVPPD这个基组,奈何怎样写都不对,不知道哪里出了错误,希望能给个实例,谢谢

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