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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2020-11-17 19:54:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xxu若白 于 2020-11-17 19:57 编辑
sobereva 发表于 2020-11-17 04:47
如果用全局指数衡量,亲电加成看亲核指数,亲核加成看亲电指数,用Multiwfn能直接算出来,看http://sober ...

谢谢sob老师,还要向您请教一下,比如说研究这两个分子(a和b)与亲核试剂(Nu-)进行加成反应。1. 对于全局亲电指数a<b,是不是说明b分子比a分子与Nu-更容易发生亲核加成反应?
2. 比较a分子的C13和b分子的C12位点对于亲核试剂Nu-的反应难易,Hirshfeld电荷和简缩福井函数如下表,q(N)这一列的值b>a,是不是就足够说明b分子的C12位点比a分子的C13位点更容易与Nu-发生反应?如果不够还需要计算哪些量?另外这种比较是合理的吗?
3. 局部亲电指数中的f+(r)是如何计算的?






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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-18 02:49:00 | 只看该作者 Only view this author
bannc 发表于 2020-11-17 08:07
大家好,我用b3lyp/6-31+g*计算级别对一个较大分子进行优化+振动分析。已经优化了60多步,快一个星期了还没 ...

如果你真的没加色散校正,极大可能你这个计算根本毫无意义

仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-18 02:53:34 | 只看该作者 Only view this author
xxu若白 发表于 2020-11-17 19:54
谢谢sob老师,还要向您请教一下,比如说研究这两个分子(a和b)与亲核试剂(Nu-)进行加成反应。1. 对于 ...

1 是
2 是
3 Multiwfn算概念密度泛函理论的量的那个功能里直接就能看福井函数等值面图
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发表于 Post on 2020-11-18 13:20:39 | 只看该作者 Only view this author
请问社长,想要开始学习多参考态方法,有哪些推荐的入门级书籍或者文献么?

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发表于 Post on 2020-11-18 13:24:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-18 02:49
如果你真的没加色散校正,极大可能你这个计算根本毫无意义

仔细看

谢谢社长大大指导~

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发表于 Post on 2020-11-18 13:48:53 | 只看该作者 Only view this author
九曜 发表于 2020-11-18 13:20
请问社长,想要开始学习多参考态方法,有哪些推荐的入门级书籍或者文献么?

ORCA的CASSCF tutorial可以看一下,https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/dlext/?cat=4
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2020-11-18 17:09:13 | 只看该作者 Only view this author

在高斯中分子的xyz坐标方向怎么确定?

各位老师好,我想用高斯给图中分子加一个z轴正方向的电场,请问在gaussview中应该怎么操作可以确保和图中的方向保持一致?

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发表于 Post on 2020-11-18 17:15:33 | 只看该作者 Only view this author
加上nosymm关键词,你画的是什么样子就是什么样子,不会让高斯去自动旋转到标准取向下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-18 18:35:25 | 只看该作者 Only view this author
hxlzu 发表于 2020-11-18 17:09
各位老师好,我想用高斯给图中分子加一个z轴正方向的电场,请问在gaussview中应该怎么操作可以确保和图中的 ...

谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-18 18:37:34 | 只看该作者 Only view this author
九曜 发表于 2020-11-18 13:20
请问社长,想要开始学习多参考态方法,有哪些推荐的入门级书籍或者文献么?

明年量化高级班会深入浅出讲授




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发表于 Post on 2020-11-19 00:39:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-18 18:37
明年量化高级班会深入浅出讲授

感谢社长,我先自己学习了解一下,期待明年的高级班。

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发表于 Post on 2020-11-19 00:43:29 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-18 13:48
ORCA的CASSCF tutorial可以看一下,https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/dlext/?cat=4

感谢!我去学习一下^_^

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发表于 Post on 2020-11-19 16:12:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-18 18:35
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297(http://bbs.keinsci.com/thread ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2020-11-19 16:43:55 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请教一个过渡态能垒是负数的问题。
我加大基组之前过渡态的能量比反应物高0.03kcal/mol,加大基组后过渡的能量比反应物低了0.65kcal/mol,造成这个的原因是反应物自由矫正量数值大一些,有没有什么办法可以解决这个问题。

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发表于 Post on 2020-11-19 16:56:25 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2020-11-19 16:43
各位老师好,请教一个过渡态能垒是负数的问题。
我加大基组之前过渡态的能量比反应物高0.03kcal/mol,加大 ...

这是正常现象。
能垒这么低的情况下,过渡态理论已经不适用了,所以即使你算准了也没有定量价值。所以只要不把这个能垒换算成速率常数,也不把这个能垒和其他能垒接近0的反应互相比较(也就是说假如有另一个能垒+1kcal/mol的反应,你不能说你现在这个反应比那个反应快),能垒低于0是可以接受的。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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