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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-4-13 15:13:50 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,linux的gaussian16,在安装目录下设置Default.Route,里面写了
-M- 48GB
-P- 16
请问老师如果Default.Route不填写MaxDisk,默认文件大小上限是整个硬盘,还是软件内部有个限定值?

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发表于 Post on 2021-4-13 15:33:42 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我有一个小问题,molpro和gaussian都可以进行CCSD(T)水平的单点能计算,但是对于开壳层体系而言,molpro只能rohf,但是gaussian可以uhf,是不是意味着对于开壳层体系,gaussian计算更精确。

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发表于 Post on 2021-4-13 15:40:02 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-4-12 15:55
构象有细微差别?还是没有收敛到稳定波函数?
应该对这些问题做仔细的检查。

怎么查看是否收敛到稳定波函数呀?刚刚接触,不太明白

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发表于 Post on 2021-4-13 15:41:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-13 09:03
那叫Hartree,不叫HF能量
0.006 Hartree的差异一点也不小,要么计算设定不同,要么优化到了不同结构,要 ...

请问sob老师,在哪里查看是否优化到稳定波函数呢

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发表于 Post on 2021-4-13 20:39:11 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-4-13 15:41
请问sob老师,在哪里查看是否优化到稳定波函数呢

有个关键词“Stable”,具体用法你查一下手册
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-4-13 22:24:07 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-4-13 20:39
有个关键词“Stable”,具体用法你查一下手册

好的好的,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 07:10:51 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-4-13 15:13
想请教一下

什么是高阶鞍点?

受力为0,但虚频超过一个的驻点。比如二阶鞍点
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 07:11:06 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2021-4-13 13:05
谢谢老师,请问如果命令行没写温度关键词,gaussian默认输出的是0K、273.15K、298.15K哪个温度下的热力学 ...

298.15K
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 07:11:38 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2021-4-13 15:13
请问老师,linux的gaussian16,在安装目录下设置Default.Route,里面写了
-M- 48GB
-P- 16

整个硬盘。或者说假定硬盘剩余空间无限大
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 07:12:26 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-4-13 15:40
怎么查看是否收敛到稳定波函数呀?刚刚接触,不太明白

公社论坛首页google框搜stable

此文也提了
使用Gaussian做镧系金属配合物的量子化学计算
http://sobereva.com/581http://bbs.keinsci.com/thread-21274-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 07:13:18 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2021-4-13 15:33
sob老师,我有一个小问题,molpro和gaussian都可以进行CCSD(T)水平的单点能计算,但是对于开壳层体系而言 ...


两种形式没有必然性哪个一定更好
实际上Gaussian也支持基于ROHF的CCSD(T),写ROCCSD(T)便可。但注意基于ROHF做后HF的方法有不同形式,应当看手册确认是相同的方法才能比
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发表于 Post on 2021-4-14 09:25:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-14 07:10
受力为0,但虚频超过一个的驻点。比如二阶鞍点

明白;感谢!

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发表于 Post on 2021-4-14 11:27:22 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian 使用报错

Error parsing secondary structure:
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
  1 2 1.000
  '
Last state= "Top"
使用Gaussian软件报错,请问1 2 1.000代表的是什么意思,要在原始文件中怎么修改?

}BSE64~_2QG)N2JX7RO{_PE.png (119.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

}BSE64~_2QG)N2JX7RO{_PE.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 12:36:53 | 只看该作者 Only view this author
王媛媛 发表于 2021-4-14 11:27
Error parsing secondary structure:
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
  1  ...

把(PDB...)都删掉,否则程序会试图从坐标后面读取二级结构信息
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发表于 Post on 2021-4-14 14:39:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 劲仔小鱼干 于 2021-4-14 14:41 编辑

请教一下各位老师,我已经把RDG_maxrho设为0,但还是存在很明显的环形等值面,我该怎么做才能使环形等值面正常显示呢?

屏幕截图 2021-04-14 143936.jpg (227.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

屏幕截图 2021-04-14 143936.jpg

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