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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-12 13:46:58 | 只看该作者 Only view this author
liucyx 发表于 2021-5-11 21:50
恳求各位指导,拜谢

仔细看此文,看清楚每一个空行
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

scf=conver=8毫无意义,本来这就是默认的
给Sb用这么烂的基组跟其它原子的6-31G**根本不搭,还不如直接用def2-SVP,还省得你自定义基组和赝势写错
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-5-13 10:44:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 陈小北 于 2021-5-13 10:46 编辑

Sob老师好

我的问题是关于自旋多重度判断的,下图是我的体系:


我是这样判断的,Fe是+3价,Cl是-1价,周围的大环配体两个X分别为O和N,不带电,所以整个体系是+2价

但是中央+3价的铁原子自旋多重度有2,4,6三种情况,所以我在自旋多重度上分别算了2,4,6

但是这三种情况高斯都会报L301错误,把自旋多重度改为1才能正常优化

我想问一下我对体系的电荷和自旋多重度判断有错吗,为什么电荷是2自旋多重度是1?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-13 19:20:11 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2021-5-13 10:44
Sob老师好

我的问题是关于自旋多重度判断的,下图是我的体系:

自旋多重度的判断显然得考虑整个体系,又不是光给Fe部分设的。如果整个体系总电子数为偶数,自旋多重度显然不可能为偶数

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-5-15 16:40:54 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP优化结构,CBS-QB3只计算单电能(Geom=check, guess=read),遇到SCF不收敛。请教 加入SCF(novaracc,noincfock) int=acc2e=12等关键词,会对CBS-QB3的每一步都起作用吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-15 17:19:35 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-5-15 16:40
B3LYP优化结构,CBS-QB3只计算单电能(Geom=check, guess=read),遇到SCF不收敛。请教 加入SCF(novaracc,no ...

未必
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发表于 Post on 2021-5-15 17:42:42 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2021-5-13 03:44
Sob老师好

我的问题是关于自旋多重度判断的,下图是我的体系:

电荷数判断错误。
你可以这样判断电荷,把Fe、Cl从分子里抠掉,把剩下的部分当作一个有机分子,把它的主要共振式画出来,你就知道这个配体根本不是中性的。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-5-15 18:55:05 | 只看该作者 Only view this author

刚才查看了out文件,确实在CBS-QB3加入的关键字,到后面就没有了。因为后面的ccsd的scf不收敛,这种情况我该怎么办呢? 换方法吗?

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发表于 Post on 2021-5-15 19:54:10 | 只看该作者 Only view this author
基元反应(过程)才能用opt=TS、QST2、3搜索过渡态吗?如何判断一个反应是否为基元反应呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-15 20:09:41 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-5-15 18:55
刚才查看了out文件,确实在CBS-QB3加入的关键字,到后面就没有了。因为后面的ccsd的scf不收敛,这种情况 ...

换个别的热力学组合方法就完了。诸如下文提及的方法,是利用脚本执行的,每一步都可以精确控制关键词

高性价比热力学组合方法G4(MP2)-6X的计算方法
http://sobereva.com/419http://bbs.keinsci.com/thread-10096-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-15 20:11:46 | 只看该作者 Only view this author
Dolantin 发表于 2021-5-15 19:54
基元反应(过程)才能用opt=TS、QST2、3搜索过渡态吗?如何判断一个反应是否为基元反应呢?


只有一步的过程。找到TS之后跑个IRC便清楚
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发表于 Post on 2021-5-15 20:47:14 | 只看该作者 Only view this author
Dolantin 发表于 2021-5-15 12:54
基元反应(过程)才能用opt=TS、QST2、3搜索过渡态吗?如何判断一个反应是否为基元反应呢?

如果能找到一个过渡态,从这个过渡态往两边走IRC,分别能走到反应物和产物,那么这个反应就是基元反应。
不过注意两点:
(1)这里的措辞是“如果能找到一个”,也就是说,你找到一个过渡态走IRC不能走到反应物和产物,不代表这个反应不是基元反应,也可能是你找错了。
(2)有的时候,在反应物和产物不变的情况下,反应有好几条路可以走,其中有的是基元反应,有的不是。有可能其中的非基元反应的势垒比基元反应低。我说的这个标准只能判断这些路里面有一条是基元反应,不能用来判断其中最主要的反应途径是不是基元反应。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-5-15 20:52:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-15 20:11

只有一步的过程。找到TS之后跑个IRC便清楚

谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2021-5-15 20:53:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-15 20:47
如果能找到一个过渡态,从这个过渡态往两边走IRC,分别能走到反应物和产物,那么这个反应就是基元反应。
...

感谢!阅读了几个帖子和物化教材,整明白原理了

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发表于 Post on 2021-5-16 11:11:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-15 20:09
换个别的热力学组合方法就完了。诸如下文提及的方法,是利用脚本执行的,每一步都可以精确控制关键词

...

好的,感谢老师

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发表于 Post on 2021-5-17 08:46:19 | 只看该作者 Only view this author
对同一分子两个结构的计算能量差别太小,想请教各位老师是什么原因。

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