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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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争取学好计算化学!

13456#
发表于 Post on 2021-7-14 09:52:34 | 只看该作者 Only view this author
老师,def2tzv和def2tzvp是一样的基组吗?
始终相信生活美好,万物可爱!

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发表于 Post on 2021-7-14 11:45:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-13 15:55
没现成的关键词,需要手算

谢谢sob老师,请问有没有浅显易懂的计算TAE[CCSD(T)]的资料呀

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13458#
发表于 Post on 2021-7-14 15:30:44 | 只看该作者 Only view this author

请问在做单点计算时是否有必要加弥散函数?

想算一个氯代烷烃的加氢反应速率,通过freq算完自由能校正量后,在做单点时是否有必要加弥散?多谢各位老师的指点!

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13459#
发表于 Post on 2021-7-14 15:34:46 | 只看该作者 Only view this author
这个加氢反应涉及催化剂吗?大体是什么类型的催化剂?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2021-7-14 15:51:44 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-7-14 02:52
老师,def2tzv和def2tzvp是一样的基组吗?

不是,p代表极化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-14 16:00:51 | 只看该作者 Only view this author
joeson 发表于 2021-7-14 15:30
想算一个氯代烷烃的加氢反应速率,通过freq算完自由能校正量后,在做单点时是否有必要加弥散?多谢各位老师 ...

仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

没事别乱加弥散
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-14 16:05:32 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-7-14 09:52
老师,def2tzv和def2tzvp是一样的基组吗?

def2tzv只是Gaussian里的关键词,并不存在这个基组
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-14 16:20:28 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2021-7-14 11:45
谢谢sob老师,请问有没有浅显易懂的计算TAE[CCSD(T)]的资料呀

有基本量化常识,照着定义就直接能算了
有什么不清楚的再具体问
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发表于 Post on 2021-7-14 16:38:03 | 只看该作者 Only view this author
请问:想利用gview构建一个二聚体的模型(模型涉及两种分子C4H8N8O8 & C4H3N5O6),应该如何构建?

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发表于 Post on 2021-7-14 17:19:04 | 只看该作者 Only view this author
老师们好,最近我通过等键方法在计算一个含噻吩的有机环状分子的环应变能时发现算出来的值是负值,查阅一下文献觉得可能是环内的相互作用在拆解出来之后没有很好的抵消,请问这种情况接下来应该怎么做比较好?

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发表于 Post on 2021-7-14 17:43:26 | 只看该作者 Only view this author
dududu 发表于 2021-7-14 09:38
请问:想利用gview构建一个二聚体的模型(模型涉及两种分子C4H8N8O8 & C4H3N5O6),应该如何构建?

你会构建单体吧?
在同一个gaussview窗口里构建两个单体,然后摆好两者的相对取向以及距离就行了
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-14 18:12:16 | 只看该作者 Only view this author
dududu 发表于 2021-7-14 16:38
请问:想利用gview构建一个二聚体的模型(模型涉及两种分子C4H8N8O8 & C4H3N5O6),应该如何构建?

直接摆
如果可能有多种可能的结合构型,并且想确保得到最稳定构型,应当用genmer+molclus做构型搜索

genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-14 18:12:47 | 只看该作者 Only view this author
落雁 发表于 2021-7-14 17:19
老师们好,最近我通过等键方法在计算一个含噻吩的有机环状分子的环应变能时发现算出来的值是负值,查阅一下 ...

交代清楚具体怎么算的,否则没法回答
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13469#
发表于 Post on 2021-7-14 19:57:51 | 只看该作者 Only view this author
请问 用MS切割ZSM-5分子筛为多少多少T 怎么来判断切割的是否正确呢?

(我想复刻文献上的128T的Z5分子筛 不知道自己切的对不对)

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发表于 Post on 2021-7-14 20:02:54 | 只看该作者 Only view this author
请问 用MS的小铅笔来画一个分子 在简单的连接后怎么判断画的这个分子的键长和键角是否正确 谢谢

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