计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13576#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-12 23:50:22 | 只看该作者 Only view this author
csqc 发表于 2021-8-12 23:49
CASSCF活化空间和轨道的选择原则,调轨道依据
本人是新手

公社论坛首页google框搜,早就有诸多讨论和相关资源
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

68

帖子

0

威望

1646

eV
积分
1714

Level 5 (御坂)

13577#
发表于 Post on 2021-8-13 10:03:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-12 22:45
我不知道你的ONIOM是怎么做的,用的什么关键词,也不知道你怎么导出的ONIOM高层的波函数。如果是以常规方 ...

谢谢老师回复
oniom是PBE1PBE/6-31G* /UFF 导出波函数的话,直接formchk -MS *.chk导出的高层的波函数,前面原子的键级感觉没问题,最后一个原子的话,感觉对应关系有问题

47

帖子

0

威望

206

eV
积分
253

Level 3 能力者

13578#
发表于 Post on 2021-8-13 21:09:22 | 只看该作者 Only view this author
在文献中,得知Molpro处理CCSD、CASPT2类方法比Gaussian要好,
想请问下老师们,有哪些开源软件对CCSD、CASPT2类的处理可以媲美Molpro?

1万

帖子

0

威望

9893

eV
积分
22141

Level 6 (一方通行)

13579#
发表于 Post on 2021-8-13 21:43:02 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-8-13 14:09
在文献中,得知Molpro处理CCSD、CASPT2类方法比Gaussian要好,
想请问下老师们,有哪些开源软件对CCSD、CA ...

你是想问开源还是免费?这是两个不同的概念。
如果只想问免费,ORCA可以。如果用ORCA的话,建议用NEVPT2而非CASPT2,因为NEVPT2没有intruder state,计算结果比较稳定
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

69

帖子

0

威望

445

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

13580#
发表于 Post on 2021-8-13 22:32:24 | 只看该作者 Only view this author

苯环氧化过渡态搜索计算报错:2070

各位老师好,我在做苯环氧化过程的模拟,在过渡态搜索过程中报错如下:the processing of the last link ended abnormally. all processing has been aborted. the output file will not open. please see the end of the output file for additional information

请问各位老师是何原因,怎样解决呢?

输入文件:
%chk=E:\Gassian calculation\0811\TS\TS3.chk
# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq 6-31g(d,p) scf=qc m062x

Title Card Required

0 2
C                 -0.56487295    0.94285727    0.78231083
C                  0.57575005    1.40412327   -0.08530517
C                 -1.66281495    0.30573527    0.18128883
C                  1.36269805    0.44371627   -0.61242717
C                  0.48614774   -0.76286796    1.14362431
C                  0.98633705   -0.89574073   -0.15826217
H                  1.00087209   -0.12297466    1.85614908
H                 -0.73555795    1.42050827    1.74214583
H                  0.68072305    2.45744827   -0.32742917
H                  2.13834405    0.64634027   -1.34407817
H                  1.20783705   -1.82194673   -0.67566717
O                 -1.51412395   -0.41829973   -0.86239117
H                 -0.10977483   -1.55455452    1.59725180
H                 -0.46082805   -1.03436227   -0.92801683

TS3.gjf

975 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13581#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-13 22:36:46 | 只看该作者 Only view this author
落微 发表于 2021-8-13 22:32
各位老师好,我在做苯环氧化过程的模拟,在过渡态搜索过程中报错如下:the processing of the last link en ...

提问Gaussian问题的常识:绝对不要问l几几几报错怎么回事,更不要问2070提示怎么处理(Windows版只要是报错一律会提示这个,根本没有任何有效信息),应当从输出文件末尾逐渐往上找对应报错的确切的提示语句并贴出来,关键词也一并贴出来。说不清楚的时候直接上传输出文件。强烈建议把报错语句先拷到bbs.keinsci.com首页google框进行搜索寻找答案。

绝对不要把scf=qc当默认用的关键词,这里明确说了
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13582#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-13 22:39:50 | 只看该作者 Only view this author
发光 发表于 2021-8-13 21:09
在文献中,得知Molpro处理CCSD、CASPT2类方法比Gaussian要好,
想请问下老师们,有哪些开源软件对CCSD、CA ...

Molpro的CCSD比起Gaussian并没有多大优势,虽说速度更快,但优势也没那么悬殊,没有为此刻意用Molpro的必要
免费的ORCA的CCSD比Gaussian快一些,而且还有DLPNO版可以用能算明显大得多的体系

CASPT2是免费的OpenMolcas的专长。用ORCA也可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13583#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-13 22:41:50 | 只看该作者 Only view this author
心向暖阳 发表于 2021-8-13 10:03
谢谢老师回复
oniom是PBE1PBE/6-31G* /UFF 导出波函数的话,直接formchk -MS *.chk导出的高层的波函数, ...

键级就明显不合理,C-F居然都到了12点几

先进入Multiwfn主功能0看看结构、轨道是否都正常,并且也显示一下轨道占据数看看是否都没问题。并且也建议按照Multiwfn手册附录5的做法检验一下载入的波函数的合理性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

47

帖子

0

威望

206

eV
积分
253

Level 3 能力者

13584#
发表于 Post on 2021-8-14 12:47:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-13 22:39
Molpro的CCSD比起Gaussian并没有多大优势,虽说速度更快,但优势也没那么悬殊,没有为此刻意用Molpro的必 ...

谢谢老师

47

帖子

0

威望

206

eV
积分
253

Level 3 能力者

13585#
发表于 Post on 2021-8-14 13:03:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-13 21:43
你是想问开源还是免费?这是两个不同的概念。
如果只想问免费,ORCA可以。如果用ORCA的话,建议用NEVPT2 ...

谢谢老师

40

帖子

0

威望

276

eV
积分
316

Level 3 能力者

13586#
发表于 Post on 2021-8-14 16:05:19 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我想请问一下:我在很多文献中看到SOC计算中出现了如图所示的 (T1,S0)之间的常数,但是我在使用Dalton计算的时候输出文件里没有找到相关内容,只有从S1开始的,请问这种S0到T1的常数需要怎么计算呢?

202108141605132013..png (41.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

202108141605132013..png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13587#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-14 23:40:01 | 只看该作者 Only view this author
落雁 发表于 2021-8-14 16:05
老师好,我想请问一下:我在很多文献中看到SOC计算中出现了如图所示的 (T1,S0)之间的常数,但是我在使用Dal ...

一个例子,S0与各个三重态激发态之间的SOC
TD_H2S.out (43.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

40

帖子

0

威望

276

eV
积分
316

Level 3 能力者

13588#
发表于 Post on 2021-8-15 23:37:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-14 23:40
一个例子,S0与各个三重态激发态之间的SOC

我照着老师您的例子试了一下,发现Dalton中提示:SO-integrals are calculated for  H: no mean-field 无法正常结束,请问这应该怎么处理

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

13589#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-15 23:38:14 | 只看该作者 Only view this author
落雁 发表于 2021-8-15 23:37
我照着老师您的例子试了一下,发现Dalton中提示:SO-integrals are calculated for  H: no mean-field 无 ...

也许是版本问题
用和我相同的版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

2

帖子

0

威望

31

eV
积分
33

Level 2 能力者

13590#
发表于 Post on 2021-8-16 21:02:17 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian 计算三重态激发态能量

大家好,本人刚接触高斯计算,有很多不懂得地方,麻烦大家指教。我用TDDFT计算几何优化后的一个分子的三重态激发态能量,计算出来的结果是负值,请问这是什么问题,怎样正确计算呢。这是计算的命令:%nprocshared=4
%chk=E:\homo\sanbenan\44.chk
%mem=1000MB
#p td(nstates=5) ub3lyp/6-31g(d) scrf=solvent=THF


这是输出的结果:



本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 13:01 , Processed in 0.300430 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list