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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-7-29 08:42:46 | 只看该作者 Only view this author
电荷和自旋多重度写错了吧

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发表于 Post on 2021-7-29 08:43:21 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢大神的指导

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发表于 Post on 2021-7-29 18:11:05 | 只看该作者 Only view this author
老师我想问一下,gaussian中force和stable命令是不是不可以一起用?为什么

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发表于 Post on 2021-7-29 19:31:33 | 只看该作者 Only view this author
想请教一下老师们,最近想尝试进行过渡态计算,想使用低精度基组预优化一下,找到了一个虚频,但他的震动模式并不是想要的,这个过渡态还有意义吗?这个时候还有用高精度基组计算的必要吗,要怎么样调整才能去除不想要的虚频呢?

h-co_1.rar

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-30 06:56:45 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2021-7-29 18:11
老师我想问一下,gaussian中force和stable命令是不是不可以一起用?为什么

不能
本来就是两个没直接联系的任务,而且手册里也没声明可以直接联用,显然可能直接把Gaussian搞糊涂
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-30 06:59:34 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-7-29 19:31
想请教一下老师们,最近想尝试进行过渡态计算,想使用低精度基组预优化一下,找到了一个虚频,但他的震动模 ...

6-311G*本来对于opt freq就足够用了,完全没必要进一步提升

初始结构明显没有过渡态的模样,导致最后只是收敛到一个构象变化的过渡态。重新调整过渡态初猜
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发表于 Post on 2021-7-30 11:10:16 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我最近在尝试进行过渡态的计算,反应过程是褐煤模型中含氧官能团的脱除过程,在B3LYP/6-311(d,p)水平下计算的过渡态有意义吗?后续研究要考虑水分子对这个过程的影响,因此是否需要加色散矫正或者改用M062X方法?要加弥散函数吗?

HMCOOH_1.zip

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发表于 Post on 2021-7-30 15:29:29 | 只看该作者 Only view this author
zjy123 发表于 2021-7-30 04:10
老师您好,我最近在尝试进行过渡态的计算,反应过程是褐煤模型中含氧官能团的脱除过程,在B3LYP/6-311(d,p ...

要加色散校正。结构优化可以仍然用B3LYP,单点能用M062X。如果后续反应过程不涉及明显带负电荷的原子,就不需要加弥散函数。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-7-30 15:39:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-30 15:29
要加色散校正。结构优化可以仍然用B3LYP,单点能用M062X。如果后续反应过程不涉及明显带负电荷的原子,就 ...

OK,谢谢老师。

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发表于 Post on 2021-7-30 15:43:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-30 06:59
6-311G*本来对于opt freq就足够用了,完全没必要进一步提升

初始结构明显没有过渡态的模样,导致最后 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-8-5 14:55:21 | 只看该作者 Only view this author

报错分析

想问一下提交优化任务,输出文件的结果一直是这个Operation on file out of range.是初始结构给的不合理还是bug?

捕获.PNG (8.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

该分子 的输出报错信息

该分子 的输出报错信息

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发表于 Post on 2021-8-5 15:35:59 | 只看该作者 Only view this author
给完整输出文件
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2021-8-5 20:42:01 | 只看该作者 Only view this author

高斯计算实现

求助,本人计算小白,想问各位大佬,图片中的加黄部分是如何实现的,也就是input文件咋写?
它这个是一个双杂化泛函的意思吗?实在不懂,希望大家能帮帮我,先谢谢大家了

QQ截图20210805203745.png (143.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

QQ截图20210805203745.png

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发表于 Post on 2021-8-5 21:20:16 | 只看该作者 Only view this author
身在一个没有计算的课题组,自己想整一个计算,太难了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-5 22:44:49 | 只看该作者 Only view this author
北风18 发表于 2021-8-5 20:42
求助,本人计算小白,想问各位大佬,图片中的加黄部分是如何实现的,也就是input文件咋写?
它这个是一个 ...

单点级别//优化级别

不要效仿这种文章,计算级别早已过时

仔细看此文
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
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