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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-8-23 10:01:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 阿萨大厦 于 2021-8-23 10:08 编辑

请问各位老师们,我在使用高斯软件B3LYP/6-31G*计算模拟多个乳糖分子的Raman光谱的运行结束的时候,再次用gview打开时出现如图的错误,并且无法点击vibration查看光谱数据;请问怎么解决?

p3.png (74.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

p3.png

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发表于 Post on 2021-8-23 14:40:48 | 只看该作者 Only view this author

基于特定态溶剂模型做TDDFT计算激发能时对SCF Done后面的值的选择问题

本帖最后由 Fegnhua 于 2021-8-23 14:53 编辑

各位老师以及同学们好,本人模拟计算小白,在参考sob老师的文章《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法》(http://sobereva.com/314)后,依据4.5基于特定态溶剂模型做TDDFT计算对苯二甲酸的激发能时,对(2)中:得到基态在平衡溶剂下的能量(SCF Done后面的值)这句话有个疑问,我所计算得到了很多个SCF Done后面的值,请问是应该选择第一次计算得到的值,还是最后一次计算得到的值呢?虽然这是一个小问题,还是烦请各位解答一下,谢谢!


将计算输出文件out文件作为附件上传。

ExE.out

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-23 15:23:44 | 只看该作者 Only view this author
Grease 发表于 2021-8-23 09:22
大家好!我想咨询一下使用B3LYP-D3(BJ)泛函计算两个十八烷酸锂分子之间的弱相互作用力合适吗?有没有更好的 ...

以后发帖的标题绝对不要用诸如这次你用的“泛函的选择”,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html了解论坛的规矩

合适
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-23 15:24:22 | 只看该作者 Only view this author
阿萨大厦 发表于 2021-8-23 10:01
请问各位老师们,我在使用高斯软件B3LYP/6-31G*计算模拟多个乳糖分子的Raman光谱的运行结束的时候,再次用g ...

任务没算完或者异常终止了,对于后者仔细看输出文件末尾搞清楚原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-8-23 15:45:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-23 15:23
以后发帖的标题绝对不要用诸如这次你用的“泛函的选择”,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1 ...

好的,辛苦社长

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发表于 Post on 2021-8-23 15:55:22 | 只看该作者 Only view this author
Grease 发表于 2021-8-23 02:22
大家好!我想咨询一下使用B3LYP-D3(BJ)泛函计算两个十八烷酸锂分子之间的弱相互作用力合适吗?有没有更好的 ...

可以,不过泛函不是算准这个体系的重点,重点在于显式描述Li的溶剂化,以及对Li的配位模式做构型搜索。把这两方面做好了,泛函选取倒不是什么问题,随便哪个常见的杂化泛函加色散校正都行
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-23 18:01:37 | 只看该作者 Only view this author
Fegnhua 发表于 2021-8-23 14:40
各位老师以及同学们好,本人模拟计算小白,在参考sob老师的文章《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光 ...

学术求助帖不得发到公社大厅板块!
公社大厅板块的版头用超级大的红字都明确公告了,怎么还乱找地方发帖
这次给你移动了,下次在严重不恰当的地方发帖直接删帖+记违规+扣分处理
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-23 18:05:35 | 只看该作者 Only view this author
Fegnhua 发表于 2021-8-23 14:40
各位老师以及同学们好,本人模拟计算小白,在参考sob老师的文章《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光 ...

第一次
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发表于 Post on 2021-8-23 18:37:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-23 18:01
学术求助帖不得发到公社大厅板块!
公社大厅板块的版头用超级大的红字都明确公告了,怎么还乱找地方发帖 ...

嗯嗯,好的社长,麻烦了,谢谢!

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发表于 Post on 2021-8-23 20:24:03 | 只看该作者 Only view this author

高斯计算报错

大家好,想请教一个问题,对于一个金属配合物的单分子,计算结果表明只能计算偶数自旋态,奇数会出错,比如有1 2 3 4 的自旋多重度(奇偶都存在)这几种,如果想要测试不同自旋态的自由能,需要怎么做呢?

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争取学好计算化学!

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发表于 Post on 2021-8-23 21:05:49 | 只看该作者 Only view this author
老师,我Gaussian优化之后,最后一步的结构,有些键没有显示出来,但是我文章里面需要显示,这个怎么办呢?
始终相信生活美好,万物可爱!

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发表于 Post on 2021-8-23 22:03:14 | 只看该作者 Only view this author
如果是奇数个电子的体系,只能算偶数自旋多重度,此时奇数自旋多重度不是因为程序的限制导致不能算,而是因为根本不可能存在。同理,偶数个电子的体系,只可能是奇数自旋多重度。建议自己去查一下自旋多重度的定义。

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Zikuan Wang
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BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-8-23 22:16:53 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-8-23 14:05
老师,我Gaussian优化之后,最后一步的结构,有些键没有显示出来,但是我文章里面需要显示,这个怎么办呢?

Gaussview里点改变键长的那个按钮,然后依次点两个原子,弹出的那个窗口里不仅可以改键长,还可以选择键级,你根据实际情况选择就行了
Zikuan Wang
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争取学好计算化学!

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发表于 Post on 2021-8-24 09:30:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-23 22:16
Gaussview里点改变键长的那个按钮,然后依次点两个原子,弹出的那个窗口里不仅可以改键长,还可以选择键 ...

好的,谢谢老师!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-24 11:38:42 | 只看该作者 Only view this author
yucuiju 发表于 2021-8-23 20:24
大家好,想请教一个问题,对于一个金属配合物的单分子,计算结果表明只能计算偶数自旋态,奇数会出错,比如 ...

仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html再发帖。下次再用诸如“高斯计算报错”这种违规标题直接删帖处理
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