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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-12-16 16:10:02 | 只看该作者 Only view this author
涂山雅雅 发表于 2021-12-16 03:36
sob老师好,我想计算这个含硫的化合物和汞的结合能,我实验体系中用的硝酸汞,想问一下计算的时候需不需要 ...

此外还需要显式考虑第一配位层的溶剂分子,并用隐式溶剂模型描述第一配位层外面的溶剂
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2021-12-16 16:14:19 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2021-12-16 05:22
抱歉社长 TDDFT这部分上课时没怎么听懂,这次是自己看讲义,比着例子做的,更深入的知识也没理解到位
...

还是先确认一下体系的多参考态性质有多大吧,比如用orca做一个FOD计算看看。如果多参考态性质大,以上我说的方法通通不适用,必须要么用基于CAS的方法,要么找一个单参考的参考态来算(比如把某个激发态当成参考态)
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-12-16 16:19:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-16 14:46
如果激发态的偏离理想值太大就不能,这说明算出来的激发态的自旋状态都不明确,结果也不靠谱
可以

明白了社长,就是说可以用ORCA的DFT/ROCIS算单点和激发态信息、判断自旋状态,而TDDFT算出的几何构象、振动和能量是可以用的。请问我这样理解对吗?

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发表于 Post on 2021-12-16 16:34:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 16:08
对于一般的荧光计算,TDDFT只需要优化发射的态,不需要优化最大吸收的态。因为吸收是在基态平衡位置上发 ...

我这个不是计算荧光,是个光催化反应,蓝光照射效率最高,而这个配合物的最大吸收波长正好是蓝光,所以我选了这个蓝光的激发态进行几何优化和振动分析。

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发表于 Post on 2021-12-16 16:36:51 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 16:14
还是先确认一下体系的多参考态性质有多大吧,比如用orca做一个FOD计算看看。如果多参考态性质大,以上我 ...

好的,我先学习一下FOD计算。多谢老师

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发表于 Post on 2021-12-16 16:53:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 16:10
此外还需要显式考虑第一配位层的溶剂分子,并用隐式溶剂模型描述第一配位层外面的溶剂

谢谢老师提醒,我溶剂用的水,计算的时候加了隐式模型scrf=smd,还需要加显式模型吗?看到文献中有的加了显式模型,有的没有加,不知道该相信哪个,感觉那些文献只是通过计算辅证了自己的实验结果,不是很专业。

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发表于 Post on 2021-12-16 17:09:20 | 只看该作者 Only view this author
涂山雅雅 发表于 2021-12-16 09:53
谢谢老师提醒,我溶剂用的水,计算的时候加了隐式模型scrf=smd,还需要加显式模型吗?看到文献中有的加了 ...

金属的第一配位层必须显式描述,对于精度要求特别高的计算甚至第二配位层也要显式描述,再外面用隐式溶剂模型
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-12-16 17:11:28 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2021-12-16 09:34
我这个不是计算荧光,是个光催化反应,蓝光照射效率最高,而这个配合物的最大吸收波长正好是蓝光,所以我 ...

你把实验每个波长下的效率除以这个波长下的吸光系数,再算哪个波长下效率最高,或者最好算一下量子产率。单纯的反应速率不能作为判据。蓝光照射效率最高可能只是因为吸收的光最多,可能不管激发哪个态都是弛豫到S1再反应的,此时优化蓝光那个态就没有意义
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发表于 Post on 2021-12-16 17:18:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 17:09
金属的第一配位层必须显式描述,对于精度要求特别高的计算甚至第二配位层也要显式描述,再外面用隐式溶剂 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-12-16 18:31:17 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 17:11
你把实验每个波长下的效率除以这个波长下的吸光系数,再算哪个波长下效率最高,或者最好算一下量子产率。 ...

哦哦,这样啊,谢谢老师
是不是大部分此类光化学反应都是先弛豫到S1态再发生反应?

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发表于 Post on 2021-12-16 18:34:17 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2021-12-16 11:31
哦哦,这样啊,谢谢老师
是不是大部分此类光化学反应都是先弛豫到S1态再发生反应?

不好说大部分,但是说相当一部分应该是可以的
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-12-16 18:58:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-16 18:34
不好说大部分,但是说相当一部分应该是可以的

好的,非常感谢老师

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发表于 Post on 2021-12-17 10:52:56 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我根据这个网址提供的CBS-QB3方法计算CN的电子亲和势,发现计算结果和示例有所出入,请问这是什么原因呢(输入文件除了坐标部分完全相同)?
网址:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... 3&lang=zh_CN#rd
我的结果:
Temperature=               298.150000 Pressure=                       1.000000
E(ZPE)=                      0.004853 E(Thermal)=                     0.007214
E(SCF)=                    -92.232967 DE(MP2)=                       -0.274094
DE(CBS)=                    -0.026971 DE(MP34)=                      -0.019204
DE(CCSD)=                   -0.032797 DE(Int)=                        0.008880
DE(Empirical)=              -0.015266
CBS-QB3 (0 K)=             -92.587566 CBS-QB3 Energy=               -92.585205
CBS-QB3 Enthalpy=          -92.584261 CBS-QB3 Free Energy=          -92.607244

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-17 12:11:20 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2021-12-17 10:52
sob老师您好,我根据这个网址提供的CBS-QB3方法计算CN的电子亲和势,发现计算结果和示例有所出入,请问这是 ...

例子不是我写的,别专门问我,直接问写的人

另外,我不认为CBS-QB3是计算电子亲合势的合理级别,毕竟单点部分只是加了最低限度的s、p角动量的弥散函数,算阴离子体系能量别指望能有多好。
对这么点体系远不如用CCSD(T)/aug-cc-pVQZ算电子亲和能来得准确


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发表于 Post on 2021-12-17 15:29:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-17 12:11
例子不是我写的,别专门问我,直接问写的人

另外,我不认为CBS-QB3是计算电子亲合势的合理级别,毕竟 ...

谢谢老师,也就是说这么小的体系完全可以用精度更高的方法和基组。另外再请教您:def2-SVP以及以def开头的一些列基组是g-09软件自带的吗?我在输入文件里写入后计算会报错?谢谢老师。

本版积分规则 Credits rule

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