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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2026-2-14 23:41:33 | 只看该作者 Only view this author

硫酸根离子配合双PANI分子 ,以L502报错,解决方法都试过然而无效

各位老师好,本人在计算硫酸根离子配合双PANI分子时,每次都会出现报错,前几次出现了各种各样的报错,本人已解决,但是现在一直出现L502,不收敛的报错,尝试各种解决方案均以失败告终,请问各位老师,是分子结构的问题还是其他方面的问题


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-15 06:58:24 | 只看该作者 Only view this author
3079987747 发表于 2026-2-14 23:41
各位老师好,本人在计算硫酸根离子配合双PANI分子时,每次都会出现报错,前几次出现了各种各样的报错,本人 ...

稍有结构化学常识都知道这初始结构完全离谱,严重过近接触,而且硫酸根的构型完全错误


下文都明确说过
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61


当前连体系净电荷也没设对

拿3-21g做计算纯属开玩笑,结果毫无意义,就连用于预优化都不可接受

谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

强烈建议看看
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html
以及推荐通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)先好好系统、全面、正确学一遍基础知识再计算,免得像这样胡算瞎算瞎试白费巨量时间,哪怕没报错结果也几乎没法用



北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2026-2-17 22:02:15 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,如果一个反应路径存在势能面交叉,例如最低反应路径是三重态的产物复合物经过单重态的过渡态生成单重态的产物,为了对比该路径中三个结构的能量,三重态结构活性空间的选择需要与单重态结构活性空间的选择保证一致吗(均是(m,n))?我发现好像无法实现,还是说此时三重态结构活性空间的选择不受单重态结构活性空间的影响,只需要保证两个单重态结构活性空间一致即可呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-18 06:37:25 | 只看该作者 Only view this author
Xx_DerEnTh 发表于 2026-2-17 22:02
各位老师好,如果一个反应路径存在势能面交叉,例如最低反应路径是三重态的产物复合物经过单重态的过渡态生 ...

这不属于“简单量子化学问题答疑专帖”的范畴,请单独发主题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2026-2-18 16:00:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-2-18 06:37
这不属于“简单量子化学问题答疑专帖”的范畴,请单独发主题

感谢sob老师的指正与建议,得益于sob老师的指导,本人已经解决现在的问题,以后一定多利用现在的资源,多多学习,避免再出现相似的问题!

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发表于 Post on 2026-3-1 13:47:02 | 只看该作者 Only view this author

重叠型二茂铁优化结果

卢老师陈老师好,在thermo这部分,做练习题Fe2+与(C5H5)-反应生成重叠型二茂铁时,我建立的二茂铁初始结构与您的一样(重叠型,D5h的point group),Gaussian跑出来的结果,在GaussView中Results显示的vibrations却有小小的差异,您给的结果前两个vibrations是39cm-1, 169cm-1...,而我的是43cm-1, 172cm-1... 这种情况是错在哪里了呢?Ps,用的理论方法和基组都是您练习题上要求的。谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-1 21:07:38 | 只看该作者 Only view this author
Huijue 发表于 2026-3-1 13:47
卢老师陈老师好,在thermo这部分,做练习题Fe2+与(C5H5)-反应生成重叠型二茂铁时,我建立的二茂铁初始结构 ...

和版本有关。诸如G09和G16默认的积分格点精度就足以导致这种程度的差异。并且如果初始结构不精确相同,由于收敛限不是无限严格的,也可能最终带来这样的差异

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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
各位老师我想请问一下可以根据HOMO-LUMO的轨道匹配程度用来预测有机配体和金属离子结合能力大小吗?我看好像目前HOMO-LUMO轨道目前都是用来预测催化反应活性,不知道这个是不是同样可以用来预测配位结合。另外还想问一下各位老师有没有其他推荐的参数用来预测有机配体对金属离子吸附能力预测,或者推荐一些相关的理论书籍文献

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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2026-3-7 10:30
各位老师我想请问一下可以根据HOMO-LUMO的轨道匹配程度用来预测有机配体和金属离子结合能力大小吗?我看好 ...

不要过于高估和神化前线轨道理论。
想算结合能力直接算个binding energy就足够直接了吧。
相互作用分析还可以参考卢天老师的这篇综述:《Angew. Chem.上发表了全面介绍各种共价和非共价相互作用可视化分析方法的综述

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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 09:23 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2026-3-7 10:30
各位老师我想请问一下可以根据HOMO-LUMO的轨道匹配程度用来预测有机配体和金属离子结合能力大小吗?我看好 ...

诸如此类能轻易较准确定量计算的就没必要去预测,参考
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html


基于轨道的分析更适合拿来解释定量计算的结果
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发表于 Post on yesterday 13:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 KCM@SHU 于 2026-3-9 13:36 编辑

各位老师我最近想算ZIF-8的吸附,然后我看到一篇文章他用ZIF-8的γ点取样法选取一个片段最后用Gaussian去做计算优化,如下图,我想问一下这样从周期性结构里面截取代表性片段计算的时候需不需要考虑片段电荷呢?(印象里面大多数周期性结构似乎不考虑带电?),正常情况下咪唑上一个N会脱去氢带一个负电,但是按照他这个片段,有六个咪唑,而且都脱去氢了,应该有六个负电,然后两个锌离子带+4,是不是gaussian计算的时候应该设置电荷为-2比较合适?(文章计算细节里面没提电荷)原文DOI:10.1021/acs.est.3c10653

202603091331548259..png (511.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

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发表于 Post on yesterday 19:04 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2026-3-9 13:33
各位老师我最近想算ZIF-8的吸附,然后我看到一篇文章他用ZIF-8的γ点取样法选取一个片段最后用Gaussian去做 ...

如果一个周期性体系的电荷数不为0,说明体系结构或者电子数搞错了,例如多氢、漏氢、多电子、少电子等。不难估计出,只要是DFT能算得动的大小的晶胞,晶粒大到能用肉眼看见,但凡每个晶胞带一个电,库伦排斥能都足够让晶体原地爆炸了,这样的晶体根本存在不了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on yesterday 19:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2026-3-9 19:04
如果一个周期性体系的电荷数不为0,说明体系结构或者电子数搞错了,例如多氢、漏氢、多电子、少电子等。 ...

老师那如果像他这样算MOF结构的时候,从里面选取高度对称的片段作为代表,是应该把一些漏氢的部分补上让其带正电来算,还是不修改,片段带什么电就设置什么电荷去算呢?

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