简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

wwen · 发表于 Post on 2020-8-29 20:48:46

sobereva 发表于 2020-8-28 03:53
我不清楚你说的“CASSCF得到的输出文件”具体指什么、哪步给Multiwfn用

就是用下面的这个输入文件计算后得到的log文件直接拖到Multiwfn中进行AdNDP分析，然后就会出现闪退现象。
%chk=CAS-2SI-S-AdNDPY.chk
%mem=2048MB
%nprocshared=4
#p casscf(2,2)/6-31g(d) pop=nboread guess=mix gfinput iop(6/7=3) scf=maxcyc=500

casscf(2,2)/6-31g(d) opted

0 1
C                1.53440900 0.77855500 -0.69209300
C                1.53440900 -0.77855500 -0.69209300
H                1.47198400 1.17007700 -1.70228200
H                2.45176700 1.16996100 -0.26451500
H                1.47198400 -1.17007700 -1.70228200
H                2.45176700 -1.16996100 -0.26451500
C                0.00000000 0.00000000 1.69501200
H                -0.88751300 0.00000000 2.31640500
H                0.88751300 0.00000000 2.31640500
C                -1.53440900 0.77855500 -0.69209300
H                -2.45176700 1.16996100 -0.26451500
H                -1.47198400 1.17007700 -1.70228200
C                -1.53440900 -0.77855500 -0.69209300
H                -2.45176700 -1.16996100 -0.26451500
H                -1.47198400 -1.17007700 -1.70228200
Si                0.00000000 -1.33366100 0.34551900
Si                0.00000000 1.33366100 0.34551900

$NBO DMNAO AONAO $END

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-30 14:05:54

wwen 发表于 2020-8-29 20:48
就是用下面的这个输入文件计算后得到的log文件直接拖到Multiwfn中进行AdNDP分析，然后就会出现闪退现象。 ...

写guess=mix gfinput iop(6/7=3)毫无意义

你先确保当前任务输出的NBO部分信息的格式和DFT一样。说不清楚的话就上传输出文件

wwen · 发表于 Post on 2020-8-31 15:59:07

sobereva 发表于 2020-8-30 14:05
写guess=mix gfinput iop(6/7=3)毫无意义

你先确保当前任务输出的NBO部分信息的格式和DFT一样。说不清 ...

老师这是我的输出文件（由于log文件太大无法上传所以我把它放到了word里）麻烦您了~

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-31 17:58:14

wwen 发表于 2020-8-31 15:59
老师这是我的输出文件（由于log文件太大无法上传所以我把它放到了word里）麻烦您了~

显然要压缩后再上传啊，为什么限制不能上传超过500K的log文件，就是因为不压缩就上传会极度浪费论坛服务器空间
论坛首页公告栏明确说了

上传大于500KB文本型文件前必须先压缩！！

压缩后再上传。doc实在看着太费劲

wwen · 发表于 Post on 2020-9-1 09:15:31

sobereva 发表于 2020-8-31 17:58
显然要压缩后再上传啊，为什么限制不能上传超过500K的log文件，就是因为不压缩就上传会极度浪费论坛服务 ...

不好意思，已压缩上传

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-1 19:51:02

wwen 发表于 2020-9-1 09:15
不好意思，已压缩上传

我用目前官网上最新的Multiwfn，载入你的文件，能正常进入主功能14，搜索了一下轨道也没出现崩溃问题

19 Orbital localization analysis 20 Visual study of weak interaction
21 Energy decomposition analysis
100 Other functions (Part 1) 200 Other functions (Part 2)
300 Other functions (Part 3)
14
Loading NAO information...
This is a closed shell calculation
The number of atoms: 17
The number of NAOs: 133
The number of basis functions: 133
Loading DMNAO matrix...
Note: Contributions from core NAOs to density matrix ( 30 electrons) have be
en eliminated
Note: Default exhaustive search list is the entire system
======== Adaptive natural density partitioning (AdNDP) ========
Note: Candidate orbital list is empty currently
Residual valence electrons of all atoms in the search list: 38.008000
-10 Return to main menu
-2 Various other settings and functions

复制代码

wwen · 发表于 Post on 2020-9-2 15:24:44

sobereva 发表于 2020-9-1 19:51
我用目前官网上最新的Multiwfn，载入你的文件，能正常进入主功能14，搜索了一下轨道也没出现崩溃问题

...

不好意思老师，那个是手动加了轨道能以后的文件，这个是直接算出来没有修改的文件。

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-3 01:54:30

wwen 发表于 2020-9-2 15:24
不好意思老师，那个是手动加了轨道能以后的文件，这个是直接算出来没有修改的文件。

这是因为CASSCF没有单电子有效哈密顿算符，也因此没有NAO轨道能量，导致Multiwfn试图载入NAO轨道能量时出错。我已更新Multiwfn官网上的3.8(dev)解决了这个问题，当发现没有记录NAO轨道能量时就忽略掉了

wwen · 发表于 Post on 2020-9-4 14:52:09

sobereva 发表于 2020-9-3 01:54
这是因为CASSCF没有单电子有效哈密顿算符，也因此没有NAO轨道能量，导致Multiwfn试图载入NAO轨道能量时出 ...

好的，非常感谢老师！

84015917 · 发表于 Post on 2020-9-11 10:30:01

sob老师，您好。我想问一下如果想把一个有机阳离子刚好放到一个长方体里边，怎样可以确定这个长方体的长宽高（也就是给有机分子下一个定义：怎样可以得到有机分子的长轴和短轴）

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-12 04:30:40

84015917 发表于 2020-9-11 10:30
sob老师，您好。我想问一下如果想把一个有机阳离子刚好放到一个长方体里边，怎样可以确定这个长方体的长宽 ...

使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴
http://sobereva.com/426（http://bbs.keinsci.com/thread-10226-1-1.html）

84015917 · 发表于 Post on 2020-9-12 09:33:52

sobereva 发表于 2020-9-12 04:30
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴
http://sobereva.com/426（http://bbs.keinsci.com/th ...

谢谢老师

84015917 · 发表于 Post on 2020-9-22 17:19:46

在centOS下安装Multiwfn，报了个这样的错误Multiwfn: error while loading shared libraries: libXm.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory，
.bashrc也正确设置了
本来以为是服务器没装motif，后来又跑去装motif，
Loaded plugins: refresh-packagekit, security
Setting up Install Process
No package motif available.
Error: Nothing to do
请问下是哪里没设置好

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-22 22:30:09

84015917 发表于 2020-9-22 17:19
在centOS下安装Multiwfn，报了个这样的错误Multiwfn: error while loading shared libraries: libXm.so.4: ...

当前就是没装motif
我不知道你具体用的CentOS什么版本，7.x的话yum install motif就可以装

dingniu2 · 发表于 Post on 2020-10-2 15:38:56

请问老师，两个片段A与B相互作用成复合物AB，想讨论A与B片段之间成键轨道，反键轨道进出电子情况，有的人用DOS讨论，请问老师对于这类问题用态密度DOS和用电荷分解分析CDA相比，哪个更好？

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