简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

Scarlett-ww · 发表于 Post on 2021-1-26 19:44:53

sobereva 发表于 2021-1-26 19:27
进入期刊主页，输入卷号和页码直接就能搜到

才发现，谢谢Sob老师。

Freeman · 发表于 Post on 2021-2-7 19:42:13

老师好。
用Multwfn做静电势插值，好像只能选择核静电势和总静电势。如果要看电子引发的静电势，可不可以把wfn文件里的核电荷数都改成0再输入跟Multiwfn？这样做不会有什么问题吧？

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-7 21:54:56

Freeman 发表于 2021-2-7 19:42
老师好。
用Multwfn做静电势插值，好像只能选择核静电势和总静电势。如果要看电子引发的静电势，可不可以 ...

第14号用户自定义函数直接对应的就是电子的静电势，看Multiwfn手册2.7节

因此启动Multiwfn前，把settings.ini里的iuserfunc设成14，然后Multiwfn里选择被计算的函数时选择user-defined function即可

wy标点人生 · 发表于 Post on 2021-2-8 23:47:52

各位老师好！我想请教一下，VMD安装上打开出现闪退是什么原因？

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-8 23:55:32

wy标点人生发表于 2021-2-8 23:47
各位老师好！我想请教一下，VMD安装上打开出现闪退是什么原因？

没具体信息没法说

CayJ · 发表于 Post on 2021-2-9 10:20:22

请问老师：如何模拟计算季铵盐在水中的溶解度？

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-10 01:06:28

CayJ 发表于 2021-2-9 10:20
请问老师：如何模拟计算季铵盐在水中的溶解度？

这个不是Multiwfn范畴的问题，应当单独在分子模拟板块发帖

seenbefore · 发表于 Post on 2021-2-27 10:02:29

本帖最后由 seenbefore 于 2021-2-27 10:31 编辑

请问Multiwfn的视角调节的up/down为什么不是360度而是180度？做IRC上各点的分析的时候有一个点的结构取向不知道为什么发生了变化，怎么调也调不到和之前的一致，这种有什么解决方法，计算单点的时候加入nosymm可行吗？
悲报，nosymm没用，不知道Multiwfn对取向的判定究竟是怎么实现的。

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-27 19:43:29

seenbefore 发表于 2021-2-27 10:02
请问Multiwfn的视角调节的up/down为什么不是360度而是180度？做IRC上各点的分析的时候有一个点的结构取向不 ...

180度是图形库对视角的限制

如果输入文件里的朝向与其它相邻的IRC点之间是连续的，加nosymm才有用

Multiwfn不涉及对取向的判断问题。给Multiwfn的输入文件里是什么坐标Multiwfn就显示成什么坐标。视角和坐标是两回事。

wy标点人生 · 发表于 Post on 2021-2-28 11:58:33

老师，我要用二阶微扰理论进行了自然键轨道(NBO)分析，我看了sob老师你相关帖子，也下载了VMD和Wultiwfn软件，但是好像还是画不出来

,这怎么办呢？我可能是对于具体步骤不清楚。希望老师帮帮忙！

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-28 20:06:49

wy标点人生发表于 2021-2-28 11:58
老师，我要用二阶微扰理论进行了自然键轨道(NBO)分析，我看了sob老师你相关帖子，也下载了VMD和Wultiwfn软 ...

该说的步骤这里都说了，已经极尽详细了，重复不出来说明操作不对，反复仔细阅读
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

另外，看以下文章也有帮助
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269（http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html）
使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图（含视频演示）
http://sobereva.com/447（http://bbs.keinsci.com/thread-11122-1-1.html）

wy标点人生 · 发表于 Post on 2021-2-28 21:20:05

sobereva 发表于 2021-2-28 20:06
该说的步骤这里都说了，已经极尽详细了，重复不出来说明操作不对，反复仔细阅读
使用Multiwfn绘制NBO及 ...

好的，谢谢sob老师，我再去试试！

wrtgcn · 发表于 Post on 2021-3-2 11:11:32

Sob老师，抱歉我之前发错了板块。关于原子电荷的计算，我想请教您两个问题：

我的研究体系是改性碳材料表面，气体小分子的吸附和分解过程，不涉及金属。之前一直采用的是Mulliken电荷，并基于此分析催化剂表面、以及气体分子分解前后的性质。但最近收到意见，要求采用AIM电荷重新计算一些关键结构；我计算AIM电荷后发现，一些结构中部分原子上的AIM电荷，确实与采用Mulliken电荷时的数值有较大差异。现在需要解释，造成这样情况的原因。由于我之前对AIM电荷不太了解，因此想请问您：
1. AIM电荷与Mulliken电荷在相同体系，部分原子上有明显差异，可能有哪些主要的原因？
2. 在目前的体系中，采用哪种电荷结果更为可信？

麻烦您了，谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-3 01:37:07

wrtgcn 发表于 2021-3-2 11:11
Sob老师，抱歉我之前发错了板块。关于原子电荷的计算，我想请教您两个问题：

我的研究体系是改性碳材料 ...

AIM电荷非常垃圾，仔细看此文便知：《原子电荷计算方法的对比》http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml

Mulliken电荷虽然也不理想，但多数情况比AIM更有化学意义。

对固体表面问题有的是可以用的选择，比如REPEAT、Hirshfeld-I、CM5等
CP2K算REPEAT电荷最近我的博文里还给了例子
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）

Q-Chembio-llg · 发表于 Post on 2021-3-8 10:13:21

卢老师好，我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时，在定义分子片段的时候出现Error: Unable to find parameter for atom 1 with type ?的报错，请问是什么原因呢？谢谢。

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