简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-4 05:31:05

niubaotian85 发表于 2020-7-3 21:22
大神，请问一下，我对一个笼型结构的某个环计算它的NICS（1） ZZ，但是Bq在环的内部，而不是在环的上方1埃 ...

下文的做法中，Multiwfn会给你两个Bq，取恰当的就完了
利用Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ
http://sobereva.com/261（http://bbs.keinsci.com/thread-297-1-1.html）

The X,Y,Z coordinate of the points below and above 1 Angstrom of the plane from
the point you defined, respectively:
1.2583175359 -2.8072527609 0.7081814199 Angstrom
0.6676824641 -0.9747472391 0.1668185801 Angstrom
告诉了平面的拟合误差（如果平面本身就是纯平的则误差为0）、此平面的单位法向量，以及从刚才输入的环中心沿着法向量向上和向下分别移动1埃后的坐标。这两个坐标就可以设为Bq原子来计算NICS(1)_ZZ了。假设整个体系大体是个平面，那么用这两个点的NICS(1)_ZZ值取平均是比较合理的。不过当前体系是笼状体系，所以我们只应当取处在环外的那个点来算NICS(1)_ZZ。

niubaotian85 · 发表于 Post on 2020-7-4 12:58:13

sobereva 发表于 2020-7-4 05:31
下文的做法中，Multiwfn会给你两个Bq，取恰当的就完了
利用Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ
http:// ...

谢谢大神

乐嘻嘻嘻 · 发表于 Post on 2020-7-9 20:37:32

老师好，打扰一下，想问一下如图的电子和空穴密度分布图在Multiwfn中哪个版块可以做到呀？

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-10 05:14:47

乐嘻嘻嘻发表于 2020-7-9 20:37
老师好，打扰一下，想问一下如图的电子和空穴密度分布图在Multiwfn中哪个版块可以做到呀？

我不知道图中distance具体是怎么定义的，指的是谁和谁之间的

乐嘻嘻嘻 · 发表于 Post on 2020-7-10 21:08:35

sobereva 发表于 2020-7-10 05:14
我不知道图中distance具体是怎么定义的，指的是谁和谁之间的

谢谢老师，是指分子链尾端到始端的长度，我在尝试是否可以用3.16.14节的介绍和4.13.6节的做出来。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-11 12:13:53

乐嘻嘻嘻发表于 2020-7-10 21:08
谢谢老师，是指分子链尾端到始端的长度，我在尝试是否可以用3.16.14节的介绍和4.13.6节的做出来。

你尝试的做法是正确的

jasonyangmx · 发表于 Post on 2020-7-14 21:27:01

sobereva 发表于 2020-6-21 02:41
确切来说得到的是布居数（带的电子数）
TDDFT只能表现单电子激发，即只有一个电子被激发，显然根据激发 ...

明白了，谢谢sob老师！

wangxiaotong · 发表于 Post on 2020-7-15 00:30:17

大神，求助，我在模仿您的帖子Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ，文章中使用的例子是C36，我在multiwfn的例子中没有找到C36的结构，能麻烦您给个坐标吗，我想重复一下您的计算结果，测试看看是不是学会了。麻烦了，多谢！多谢!

snljty · 发表于 Post on 2020-7-15 01:56:43

wangxiaotong 发表于 2020-7-15 00:30
大神，求助，我在模仿您的帖子Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ，文章中使用的例子是C36，我在multiwfn的 ...

去官网下载最新版安装包。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-15 09:02:13

wangxiaotong 发表于 2020-7-15 00:30
大神，求助，我在模仿您的帖子Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ，文章中使用的例子是C36，我在multiwfn的 ...

我已更新了此文，给了pdb文件
利用Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ
http://sobereva.com/261（http://bbs.keinsci.com/thread-297-1-1.html）

wangxiaotong · 发表于 Post on 2020-7-15 12:35:14

snljty 发表于 2020-7-15 01:56
去官网下载最新版安装包。

谢谢

wangxiaotong · 发表于 Post on 2020-7-15 12:35:38

sobereva 发表于 2020-7-15 09:02
我已更新了此文，给了pdb文件
利用Multiwfn计算倾斜、扭曲环的NICS_ZZ
http://sobereva.com/261（http: ...

谢谢大神

wangxiaotong · 发表于 Post on 2020-7-16 16:36:12

大神，求助。我重复了您的C36，我发现C36里的环NICS值好像都是正的，而我做的环只有两个环是正值，其余都是负值。那我想问一下，对于一个笼型结构，是不是所有环都是正值才能使用芳香性去说明它的稳定性呢？还是说只要在一个笼型结构中，有NICS是正值的环就说明它存在一定的芳香性，是稳定的呢？

Freeman · 发表于 Post on 2020-7-29 19:23:26

老师您好。
如果fchk文件里的轨道信息是自然轨道而非分子轨道，那么用Multiwfn的“0 Show molecular structure and view orbitals”功能，轨道能量部分显示出的数字是不是占据数？我看那一列都是1.99998 0.00012 这样的接近于2和0的数，不像是能量。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-30 03:03:46

Freeman 发表于 2020-7-29 19:23
老师您好。
如果fchk文件里的轨道信息是自然轨道而非分子轨道，那么用Multiwfn的“0 Show molecular struc ...

是

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