简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

sobereva

wangxiaotong 发表于 2020-7-16 16:36
大神，求助。我重复了您的C36，我发现C36里的环NICS值好像都是正的，而我做的环只有两个环是正值，其余都是 ...

NICS为负才说明有芳香性。注意NICS是相应位置磁屏蔽值的负值

芳香性本来是对于特定环来说的，笼形结构的芳香性很大程度上是说法问题，不能光因为一个环的NICS是负值就说笼是芳香性的，除非选取的环极具特殊性、对笼整体的离域特征具有代表性。

michaelm

借楼问一下，Multiwfn的图形界面，现在是通过按钮来旋转。有没有计划更新成流行的方式，像vmd或者gaussview那样，直接鼠标拖动？

sobereva

michaelm 发表于 2020-8-7 03:14
借楼问一下，Multiwfn的图形界面，现在是通过按钮来旋转。有没有计划更新成流行的方式，像vmd或者gaussview ...

暂时没有，这在当前框架下很不容易实现
但如果有朝一日出到Multiwfn 4.0的话，也不是没有这个可能

sirical

sob老师，我用Multiwfn+VMD做静电势的图没有颜色，在VMD中输入pt得到的图是可以的没问题，进行第二步的时候就得到没颜色的图了。我是第一次接触这方面的东西不是很懂。

sobereva

sirical 发表于 2020-8-8 10:35
sob老师，我用Multiwfn+VMD做静电势的图没有颜色，在VMD中输入pt得到的图是可以的没问题，进行第二步的时候 ...

可能是GPU驱动和VMD有兼容性问题，导致VMD里GLSL打不开。建议你换个机子再试
也不排除记录静电势的cub文件本身有问题的可能。

wrtgcn

Sob老师，我学习了您的《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》后想请教一个小问题：

由于我的体系是比较大的平面分子团簇，用ext命令后显示出的代表极大点和极小点的圆球看起来非常多/密集，如果全标注上数字则更加拥挤，而我实际关注的可能只是平面中的一小部分区域。因此想请教您，能否通过设置，只显示某一区域的级值点？

谢谢社长。

sobereva

wrtgcn 发表于 2020-8-11 06:57
Sob老师，我学习了您的《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》后想请 ...

一个办法是ps后处理。即把显示临界点和不显示临界点的图都弄到Photoshop，前者叠加到后者图层上方，把白色背景用色彩范围选择工具去掉。然后直接用橡皮工具抹除不想看到的极值点。我倾向于这样，最直观。

另一种方式是使用VMD的选择语句。在Graphics - Representation里，切换到surfanalysis，恰当设置selected atoms内容，通过序号、几何范围方式排除掉不想要的表面极值点，语法参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

hzfish

社长，Multiwfn载入高对称性分子的gjf文件，出现如下报错：
Loaded F:\Multiwfn37dev\c32.gjf successfully!
Formula: C32
Molecule weight:       384.34355
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.
ERROR: Too many symmetry operations. Try a lower tolerance.

此时键盘不起作用。
已经使用最新版本。
该怎么处理？文件见附件。
谢谢。

sobereva

hzfish 发表于 2020-8-13 09:02
社长，Multiwfn载入高对称性分子的gjf文件，出现如下报错：
Loaded F:\Multiwfn37dev\c32.gjf successful ...

判断点群失败导致的。
这两天会发布Multiwfn 3.7正式版，一并解决此问题

hzfish

sobereva 发表于 2020-8-13 11:13
判断点群失败导致的。
这两天会发布Multiwfn 3.7正式版，一并解决此问题

谢谢社长！
我又试了c34、36及更大的环，不是出现相同报错，就是直接退。

dingniu2

读过老师写的“使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图”帖子，有个问题请教。请问老师，帖子中说的计算金属配合物时如果有赝势，6-31G*与lanl2DZ混合，要写上5d 7f关键词。请问如果计算金属铂的配合物，做电荷分解分析，采用的是def2系列基组还用写5d 7f关键词吗？

zjxitcc

dingniu2 发表于 2020-8-25 16:08
读过老师写的“使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图”帖子，有个问题请教。请问老师，帖 ...

def2系列在Gaussian里默认就是5D 7F，不用特意写

wwen

老师您好，我想用Multiwfn做AdNDP分析但是使用的CASSCF得到的输出文件没有轨道能量使用Multiwfn就会闪退，有老师说可以使用B3LYP计算然后将得到的轨道能量复制到CASSCF得到的输出文件中这种方法确实可行了，想问一下还有没有别的解决办法？

sobereva

dingniu2 发表于 2020-8-25 16:08
读过老师写的“使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图”帖子，有个问题请教。请问老师，帖 ...

当你拿不准的时候，看输出文件这部分就知道有没有必要写了

(Enter D:\study\G16W\l301.exe)
Standard basis: TZVP (5D, 7F)
Ernie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.

如果懒得特意看，索性一律都写5d 7f

更多信息看
谈谈5d、6d型d壳层基函数与它们在Gaussian中的标识
http://sobereva.com/51

sobereva

wwen 发表于 2020-8-26 14:56
老师您好，我想用Multiwfn做AdNDP分析但是使用的CASSCF得到的输出文件没有轨道能量使用Multiwfn就会闪退， ...

我不清楚你说的“CASSCF得到的输出文件”具体指什么、哪步给Multiwfn用