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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-17 04:40:45 | 只看该作者 Only view this author
sirical 发表于 2020-11-16 20:12
sob老师你好,我想做NBO分析,需要用到这样一个关键词NRTTHR=5,我试过把它直接放在#p这一行,但是会出错, ...

NBO分析问题应发到波函数分析板块

自带的NBO 3.1根本都不支持NRT,写这个毫无意义

都写了genecp还写pseudo=read干嘛
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-11-30 08:48:04 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,在用Multiwfn做拓扑分析时,为什么相邻原子之间的键上会出现两个键临界点?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-30 09:58:44 | 只看该作者 Only view this author
wwen 发表于 2020-11-30 08:48
老师您好,在用Multiwfn做拓扑分析时,为什么相邻原子之间的键上会出现两个键临界点?

提供截图我看看,并且把键径显示出来
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发表于 Post on 2020-11-30 10:06:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-30 09:58
提供截图我看看,并且把键径显示出来

老师,截图如下,红色圈出的部分是有疑问的地方。

微信图片_20201130100309.png (43.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

微信图片_20201130100309.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-30 12:11:07 | 只看该作者 Only view this author
wwen 发表于 2020-11-30 10:06
老师,截图如下,红色圈出的部分是有疑问的地方。

可能中间有赝原子。把(3,-3)理解点也显示出来
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发表于 Post on 2020-11-30 21:07:19 | 只看该作者 Only view this author
sob老师打扰了,如何用multiwfn计算出配合物中某个原子的碱性和另一个原子的酸性大小?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-1 16:14:34 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2020-11-30 21:07
sob老师打扰了,如何用multiwfn计算出配合物中某个原子的碱性和另一个原子的酸性大小?

酸性、碱性没有唯一定义和衡量方式。
如果你是指脱质子、结合质子能量的那种衡量方式,严格来说需要用pKa、pKb说事。预测胺类物质的pkb的公式看


用原子电荷、原子局部范德华表面静电势平均值、原子核位置静电势等方式也都可以讨论

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发表于 Post on 2020-12-2 10:00:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-1 16:14
酸性、碱性没有唯一定义和衡量方式。
如果你是指脱质子、结合质子能量的那种衡量方式,严格来说需要用pK ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2020-12-2 14:26:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-30 12:11
可能中间有赝原子。把(3,-3)理解点也显示出来

老师,这是带(3,-3)和(3,-1)理解点的截图。

111.png (57.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

111.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-3 17:16:42 | 只看该作者 Only view this author
wwen 发表于 2020-12-2 14:26
老师,这是带(3,-3)和(3,-1)理解点的截图。

明显就是赝原子


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发表于 Post on 2020-12-4 09:06:46 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2020-12-7 09:49:45 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 498746012 于 2020-12-7 09:57 编辑

sob老师您好,用multiwfn做laplcian的二维等值面图,能不能旋转分子使得二维等值面图旋转一个角度呀?如何使得二维等值面图旋转一个角度呀?

问题2.JPG (179.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

问题2.JPG

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-7 14:47:48 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2020-12-7 09:49
sob老师您好,用multiwfn做laplcian的二维等值面图,能不能旋转分子使得二维等值面图旋转一个角度呀?如何 ...

http://bbs.keinsci.com/thread-11037-1-1.html

强烈建议把此文4.2节仔细看一遍
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
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发表于 Post on 2020-12-7 15:18:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-7 14:47
http://bbs.keinsci.com/thread-11037-1-1.html

强烈建议把此文4.2节仔细看一遍

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2020-12-24 22:16:58 | 只看该作者 Only view this author
我最近在做pbcl2的变形密度图,看了老师相关的博文之后(http://sobereva.com/113)还是不太清楚怎么把铅原子做球对称化,特来请教一下老师和大家。

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