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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2023-3-26 01:04:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-26 00:30
你贴的图明明就是Multiwfn直接画出来的,步骤在手册4.12.6节都写明了

老师不好意思,可能是我描述得不够准确。我参照老师的方法(4.12.6节)做出的图如下,与上一个贴图区别还是有的,比如上一个贴图有显示颜色强度的色卡,背景为黑色等。但是我在操作过程中找不到相关可以修改参数的设置,所以特来请教老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-26 02:45:18 | 只看该作者 Only view this author
Landyooo 发表于 2023-3-26 01:04
老师不好意思,可能是我描述得不够准确。我参照老师的方法(4.12.6节)做出的图如下,与上一个贴图区别还 ...

老版本的Multiwfn默认的图才是黑色背景的
目前版本默认的这种效果远比之前的好得多,别试图刻意把效果调差。倘若非要用烂的效果,去看Multiwfn 3.7的手册用3.7版程序

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发表于 Post on 2023-4-1 13:17:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 orangesea 于 2023-4-1 13:21 编辑

老师您好,对于Mulliken population有些疑问。
对于 (1)
在Multiwfn手册的描述是:
The population number of atom A is simply the sum of population numbers of all basis functions attributed to atom A in all orbitals.

在老师《原子电荷计算方法的对比》一文中的描述是:
将所有轨道中属 于相同原子的基函数的占据数加和就得到了原子占据数。

对于 (2)

在Multiwfn手册的描述是

pA is the electron population number of atom A

请问老师
Q1 η i,A之和是否就是pA?
Q2 “Population number of atom A”翻译为“A原子布居数”正确吗? 它和原子占据数有什么区别?
Q3 “population number of atom A”和“electron population number of atom A”一样吗?





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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-2 04:50:39 | 只看该作者 Only view this author
orangesea 发表于 2023-4-1 13:17
老师您好,对于Mulliken population有些疑问。
对于(1)
在Multiwfn手册的描述是:

1 是
2 正确。就是原子上带的电子数
3 一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-4-11 09:52:32 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我用3月30号发布的multiwfn把fch文件转化为47文件之后,用GenNBO把47文件转化为其他NBO plot文件时遇到了报错,但是我此前用3月1号发布的multiwfn把同一个fch文件转化为47文件之后,再转化为其他NBO plot文件时并没有遇到这个报错,我发现这次转化的47文件比之前转化的47文件小了很多,请问可能是什么原因导致的呢?以下是我的fch文件和之前转化出的47文件以及现在转化出的47文件,链接:https://pan.baidu.com/s/1XTrl24wBptCiG4fAmH6S9Q
提取码:6666

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-11 10:52:49 | 只看该作者 Only view this author
NGC626 发表于 2023-4-11 09:52
各位老师好,我用3月30号发布的multiwfn把fch文件转化为47文件之后,用GenNBO把47文件转化为其他NBO plot文 ...

你的计算用了球谐型f基函数,此时Multiwfn没法产生带有Fock矩阵的.47文件

如果不需要让Multiwfn在.47里写入Fock矩阵,把settings.ini里iloadasCart设为1,从而把球谐型基函数在读取时转换为笛卡尔型,重启Multiwfn后再处理。
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发表于 Post on 2023-4-11 11:48:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-11 10:52
你的计算用了球谐型f基函数,此时Multiwfn没法产生带有Fock矩阵的.47文件

如果不需要让Multiwfn在.47 ...

谢谢sob老师,忘记修改了
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发表于 Post on 2023-4-13 11:11:10 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,我想通过Multiwfn研究 不同的取代基 对整体主环骨架 平面性 的影响。然后产生了2条研究思路,想请教下您觉得以下哪个研究思路比较好?  单位Angstrom用A表示

思路1:带着不同的取代基和主环骨架一起算平面性,MPP和SDP的数值分别在1A和4A数量级进行对比。

思路2:只选取主环骨架上原子来计算平面性数据,MPP和SDP的数值分别在0.0001A和0.001A数量级进行对比。

麻烦卢老师帮忙看下,我个人感觉思路1可能不是很严谨,思路2的话在数量级上应该是太低了,想问下您思路2这个数量级还有没有可比性。谢谢卢老师。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-13 22:10:22 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2023-4-13 11:11
卢老师您好,我想通过Multiwfn研究 不同的取代基 对整体主环骨架 平面性 的影响。然后产生了2条研究思路, ...

思路2
先实际算出来看看。倘若真的只有这种数量级,则不算是有差异
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发表于 Post on 2023-4-14 08:37:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-13 22:10
思路2
先实际算出来看看。倘若真的只有这种数量级,则不算是有差异

谢谢卢老师,我再多算一些。之前是已经试算过一些得到的数量级。
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发表于 Post on 2023-4-14 10:52:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 joke122 于 2023-4-14 10:53 编辑


老师你好,我用multiwfn生成的dimer计算过渡态虚频的输入文件,如果在计算结束并没有.mol文件出现,是不是就是说明过渡态不合理

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发表于 Post on 2023-4-14 19:42:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 MercuryLamp 于 2023-4-14 19:49 编辑

老师好,在使用Multiwfn计算RESP2电荷时,如果我想使用的溶剂在gaussian中没有关键词,应该如何解决?
我模拟的是一个环烷烃凝聚相体系,我查了一下gaussian官网中支持的solvent keywords,其中烷烃类的介电常数ε基本都在2左右,考虑到可能这些烷烃类的物质介电常数都比较接近,我能否直接用一个gaussian支持的烷烃作为溶剂来进行RESP2电荷的计算?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-15 00:28:04 | 只看该作者 Only view this author
joke122 发表于 2023-4-14 10:52
老师你好,我用multiwfn生成的dimer计算过渡态虚频的输入文件,如果在计算结束并没有.mol文件出现,是不 ...

你是指CP2K的dimer任务的输入文件?
dimer任务和振动分析任务是两码事,前者不会产生mol文件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-15 00:28:29 | 只看该作者 Only view this author
MercuryLamp 发表于 2023-4-14 19:42
老师好,在使用Multiwfn计算RESP2电荷时,如果我想使用的溶剂在gaussian中没有关键词,应该如何解决?
我 ...

可以
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发表于 Post on 2023-4-15 01:10:09 | 只看该作者 Only view this author

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