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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-23 01:13:18 | 只看该作者 Only view this author
美泽虎 发表于 2023-6-22 12:14
老师们好!读了sob老师的《使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量》博文后获益匪浅 ...

是否考虑隐式溶剂模型对结果可能有巨大影响,特别是计算IP、EA的时候,因为溶剂环境对带电状态的稳定化作用远大于中性的
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发表于 Post on 2023-6-23 07:16:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-23 01:13
是否考虑隐式溶剂模型对结果可能有巨大影响,特别是计算IP、EA的时候,因为溶剂环境对带电状态的稳定化作 ...

谢谢sob老师!那我把SMD加上

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发表于 Post on 2023-6-23 14:12:05 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,计算简缩福井函数用的N.gjf, N-1.gjf, 和N+1.gjf这几个用于生成wfn文件的高斯输入文件一般可以加弥散函数吗?我的体系是含有卤键的有机物,所以优化的时候带了弥散,之后在N.gjf, N-1.gjf, 和N+1.gjf里也带了弥散。但是最后得到的简缩福井函数和简缩双描述符预测的位点感觉都有点不太对。所以想和老师请教一下,计算简缩福井函数的时候,在生成wfn的高斯输入文件里面带弥散函数一般是否会导致计算结果不可靠。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-23 15:57:33 | 只看该作者 Only view this author
美泽虎 发表于 2023-6-23 14:12
请问老师,计算简缩福井函数用的N.gjf, N-1.gjf, 和N+1.gjf这几个用于生成wfn文件的高斯输入文件一般可以加 ...

“含卤键的有机物”和计算这些量、优化结构的时候带弥散函数毫无直接联系
此种体系仅当计算弱相互作用能、计算极化率等问题时才必须需要带弥散函数,仔细看
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

带弥散函数不会导致必然性的不可靠。虽然如果你怀疑的话也可以去掉弥散函数做对比。


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发表于 Post on 2023-6-23 22:24:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-23 15:57
“含卤键的有机物”和计算这些量、优化结构的时候带弥散函数毫无直接联系
此种体系仅当计算弱相互作用能 ...

谢谢Sob老师!我之前以为带卤键的时候卤原子算带显著负电荷的情况,所以就加了弥散,看来是多此一举了。我把弥散去掉再算算试试

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发表于 Post on 2023-6-27 17:47:35 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好
按照正确方式解压Win版的Multiwfn在D盘,但是无法使用out2gjf脚本(用Git bash跑的,脚本中的out也改成log 但是依旧显示Multiwfn:command not found)
请问此种方式该如何解决,请指教 多谢

202306271746005242..png (42.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

202306271746005242..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-27 23:25:04 | 只看该作者 Only view this author
M107 发表于 2023-6-27 17:47
Sob老师您好
按照正确方式解压Win版的Multiwfn在D盘,但是无法使用out2gjf脚本(用Git bash跑的,脚本中的 ...

提示写得很清楚,Multiwfn命令没法直接用,显然应当把Multiwfn所在目录加到PATH环境变量里,要么写绝对路径。
并且记得设Multiwfnpath环境变量,下文1.1节都说了
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html
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发表于 Post on 2023-7-6 10:45:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 MercuryLamp 于 2023-7-6 10:48 编辑

老师好,我在研究一个有机体系(只含C、H、O、N)时,先使用Gaussian在B3LYP-D3(BJ)/6-31G*进行结构优化和频率计算,再使用ORCA在PWPB95-D3(BJ)/def2-QZVPP结合SMD隐式溶剂模型计算单点能,现在我想用Multiwfn进行一些分析(前线轨道,福井函数,弱相互作用分析,自旋密度等)。
输入文件应该使用结构优化和频率计算产生的fchk文件(用chk转化)还是单点能计算产生的molden文件(用gbw转化)呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-6 10:49:30 | 只看该作者 Only view this author
MercuryLamp 发表于 2023-7-6 10:45
老师好,我在研究一个有机体系(只含C、H、O、N)时,先使用Gaussian在B3LYP-D3(BJ)/6-31G*进行结构优化和 ...

前者

双杂化泛函级别没有分子轨道的概念,也因此没法讨论前线轨道

双杂化级别做其它波函数分析原理上可以,但需要产生自然轨道,需要额外步骤,而且用那么大基组对一些分析耗时也高。B3LYP-D3(BJ)/6-31G*级别的波函数对于这些分析目的够用了

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发表于 Post on 2023-7-6 10:52:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-6 10:49
前者

双杂化泛函级别没有分子轨道的概念,也因此没法讨论前线轨道

谢谢老师的解答

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发表于 Post on 2023-7-18 21:30:58 | 只看该作者 Only view this author
老师,关于计算福井函数时,赝势基组的单点能在Multiwfn该怎么书写呢?

LIMLO_9AVH]52GU~55N7T(U.png (9.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

LIMLO_9AVH]52GU~55N7T(U.png

1PXO_6F)P_5RC_10~8(7)$1.png (2.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-19 13:51:00 | 只看该作者 Only view this author
恒轩小朋友 发表于 2023-7-18 21:30
老师,关于计算福井函数时,赝势基组的单点能在Multiwfn该怎么书写呢?

直接用的def2系列基组就完了,都省得你去定义赝势和基组,直接就能描述那些元素
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发表于 Post on 2023-7-27 10:35:29 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我在做的体系是氮气,氢气分子在一个具有C,F元素的分子容器中的反应,想看过渡态的能量分解情况(预期并想说明色散作用很重要),不知道哪种方法最便宜适合?(已经学习了EDA-FF,但对于过渡态没有完全成键和断键的情况不知道是否可用,且算出的结合能与Gaussian基于BSSE算出的差距较大)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-27 18:01:10 | 只看该作者 Only view this author
15670538028 发表于 2023-7-27 10:35
老师好,我在做的体系是氮气,氢气分子在一个具有C,F元素的分子容器中的反应,想看过渡态的能量分解情况( ...

用sobEDA
ChemRxiv (2023) DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-n79rz

教程:http://sobereva.com/soft/sobEDA_tutorial.zip
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发表于 Post on 2023-7-27 21:03:46 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,请教下老师 多中心键级如何应用于非平面的带取代基的苯环上研究芳香性,谢谢卢老师。
Lure Over Love

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