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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2023-4-15 10:13:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-15 00:28
你是指CP2K的dimer任务的输入文件?
dimer任务和振动分析任务是两码事,前者不会产生mol文件

老师,是我用dimer算完的过渡态,再通过multiwfn生成振动分析任务,但是跑完并没有mol文件生成,我也加上了生成mol文件的关键词了,请问这是什么原因?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-15 20:08:24 | 只看该作者 Only view this author
joke122 发表于 2023-4-15 10:13
老师,是我用dimer算完的过渡态,再通过multiwfn生成振动分析任务,但是跑完并没有mol文件生成,我也加上 ...

要么输入文件没写对,要么任务没跑完,要么用的是什么上古版本不支持输出mol文件,没什么其它可能的原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-4-17 21:59:35 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,请问用Multiwfn研究分子激发态的弱相互作用该如何进行?ORCA缺少Gaussian中的density关键词,如果将激发态TDDFT计算产生的gbw/molden文件直接载入Multiwfn得到的是参考态基态的弱相互作用信息,请问该如何操作才能达到目的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-18 00:24:50 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2023-4-17 21:59
老师您好,请问用Multiwfn研究分子激发态的弱相互作用该如何进行?ORCA缺少Gaussian中的density关键词,如 ...

说具体用什么方法研究
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发表于 Post on 2023-4-18 08:52:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-18 00:24
说具体用什么方法研究

老师您好,我想用IRI的方法图形化分子激发态中可能存在的金属-金属之间的相互作用,另外还想要通过ADCH电荷来分析激发态的原子电荷。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-19 04:25:00 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2023-4-18 08:52
老师您好,我想用IRI的方法图形化分子激发态中可能存在的金属-金属之间的相互作用,另外还想要通过ADCH电 ...

建议用Gaussian算激发态密度
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-4-19 21:12:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-19 04:25
建议用Gaussian算激发态密度

好的,谢谢老师指点,不过我们单位没有Gaussian的版权所以只能试着用ORCA了。

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争取学好计算化学!

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发表于 Post on 2023-5-4 20:16:59 | 只看该作者 Only view this author
老师,想请教一下!我算了三种键级,分别是Mayer键级、Wiberg键级、Fuzzy键级。怎么通过算的键级大小判断出它们成什么键呢?我主要是分析出sigma共价键,配位键。这种有没有一个评判的标准呢?我算出来的键级有<0.5的,接近1的(比如0.803、0.791),也有大于1的(比如:1.271、1.347)。非常感谢老师!!
始终相信生活美好,万物可爱!

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发表于 Post on 2023-5-5 10:16:21 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我用http://sobereva.com/131中6.1的方法分析分子轨道组成, ,我照着这篇文章中显示原子轨道壳层的操作方法进行操作(如上图所示)从all命令输出的列表中无法得知具体是哪个亚层的轨道,例如我想查看Pt原子的Pz轨道是5Pz还是6Pz,我用的基组是6-31g(d)和lanl2dz,请问该如何查看轨道具体的亚层呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-5 22:27:02 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2023-5-4 20:16
老师,想请教一下!我算了三种键级,分别是Mayer键级、Wiberg键级、Fuzzy键级。怎么通过算的键级大小判断出 ...

必须结合具体体系讨论,没体系具体信息没法说
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-5 22:28:24 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2023-5-5 10:16
请问各位老师,我用http://sobereva.com/131中6.1的方法分析分子轨道组成,,我照着这篇文章中显示原子轨道 ...

利用布居分析判断基函数与原子轨道的对应关系
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发表于 Post on 2023-5-10 05:48:23 | 只看该作者 Only view this author

小白不懂 电荷密度差异图

本帖最后由 zht2000. 于 2023-5-10 06:01 编辑

电荷密度差异图 红色是得电子蓝色是失电子吗?为什么电负性要小反而得到电子?




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 09:52:23 | 只看该作者 Only view this author
zht2000. 发表于 2023-5-10 05:48
电荷密度差异图 红色是得电子蓝色是失电子吗?为什么电负性要小反而得到电子?

仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

自觉完整清楚全面交代图是怎么作的
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发表于 Post on 2023-5-10 17:22:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,烯丙基自由基有没有三中心三电子键呀?我用multiwfn 9-2,算出来负值绝对值最大的不是三个碳而是H-C-H,感觉很奇怪

烯丙基.PNG (21.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

烯丙基.PNG

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 22:01:21 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-5-10 17:22
sob老师您好,烯丙基自由基有没有三中心三电子键呀?我用multiwfn 9-2,算出来负值绝对值最大的不是三个碳 ...

把体系截图贴出来,并且体现原子序号,说明用的理论方法和基组
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