简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

loovfnd · 发表于 Post on 2023-5-12 18:18:39

在配合VMD计算静电势时，出现如下错误。怎么解决啊，困扰很久了。

天月风见 · 发表于 Post on 2023-5-13 15:55:58

老师，想反馈一下Multiwfn目前有一点做的不足。用Multiwfn 做电荷密度差分时，如果是第四周期以后的元素，就要手动做球对称化。而且我发现没有单独的轨道复制的功能，比如说有一个3dz2轨道，我想把它往另外两个方向复制一份，但做不到这一点。手动调节其他轨道占据数又很麻烦，有时候遇到相同的轨道完全没法通过转坐标来调节。所以恳求老师能在后续版本修复这一点。或者能单独出一个包也行

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-13 16:19:36

天月风见发表于 2023-5-13 15:55
老师，想反馈一下Multiwfn目前有一点做的不足。用Multiwfn 做电荷密度差分时，如果是第四周期以后的元素， ...

这属于额外的功能，不是不足也不是修复

自动产生球对称密度用于绘制变形密度早有打算，一直没时间弄

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-13 16:21:15

loovfnd 发表于 2023-5-12 18:18
在配合VMD计算静电势时，出现如下错误。怎么解决啊，困扰很久了。

如果是绘制表面静电势，别调用cubegen
如果就是要计算静电势的格点数据，诸如用于静电势的盆分析、显示静电势等值面等目的，把Multiwfn挪到其它目录下再试

498746012 · 发表于 Post on 2023-5-17 08:47:46

sobereva 发表于 2023-5-10 22:01
把体系截图贴出来，并且体现原子序号，说明用的理论方法和基组

对不起sob老师，这几天被事情耽搁了。我用的方法和基组是B3LYP/6-31G**

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-17 10:55:33

498746012 发表于 2023-5-17 08:47
对不起sob老师，这几天被事情耽搁了。我用的方法和基组是B3LYP/6-31G**

画个LOL-pi图，如果三个原子上pi区域被LOL-pi等值面连通，就说明有这种作用
在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征
http://sobereva.com/432（http://bbs.keinsci.com/thread-10610-1-1.html）

498746012 · 发表于 Post on 2023-5-17 11:15:49

sobereva 发表于 2023-5-17 10:55
画个LOL-pi图，如果三个原子上pi区域被LOL-pi等值面连通，就说明有这种作用
在Multiwfn中单独考察pi电子 ...

谢谢sob老师

WuQs · 发表于 Post on 2023-5-29 16:52:47

本帖最后由 WuQs 于 2023-5-29 16:52 编辑

今天心血来潮，整理一下D盘，然后把D盘的VMD换成1.9,3版本了；绘制分子表面静电势出现如下问题

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-30 04:57:57

WuQs 发表于 2023-5-29 16:52
今天心血来潮，整理一下D盘，然后把D盘的VMD换成1.9,3版本了；绘制分子表面静电势出现如下问题

严格照着操作，该说的都说了，没有可补充的
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

WuQs · 发表于 Post on 2023-5-30 10:25:15

WuQs 发表于 2023-5-29 16:52
今天心血来潮，整理一下D盘，然后把D盘的VMD换成1.9,3版本了；绘制分子表面静电势出现如下问题

已解决，貌似是因为我在vmd.rc里定义了一些其它快捷指令，对MEPS过程造成影响，重装获取新的vmd.rc文件再按照sob老师的帖子操作就可以了。

329678001 · 发表于 Post on 2023-6-8 11:41:16

本帖最后由 329678001 于 2023-6-8 11:44 编辑

各位老师，为何原子着色表示电荷这里没有NPA电荷呢。我文章中统一用的NPA电荷，不知道这里怎么选取NPA电荷呀？

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-8 13:40:05

329678001 发表于 2023-6-8 11:41
各位老师，为何原子着色表示电荷这里没有NPA电荷呢。我文章中统一用的NPA电荷，不知道这里怎么选取NPA电荷 ...

Multiwfn目前版本不支持计算NPA电荷，<=2024年会支持

cokie · 发表于 Post on 2023-6-14 15:27:19

老师，在使用multiwfn3.8（dev）版本做IFCT时遇到了一个问题，载入fchk文件后，我先做了电子/空穴分析，道出了electron.cub和hole.cub文件，然后回到“Electronic excitation analyses”界面，选择“8”“IFCT分析”，然后界面里就只剩下两个选项了，原来的选项3“用当前folder下的electron.cub和hole.cub文件进行分析”的选项就没了。重启软件也依旧如此，只有重启电脑，按上述步骤（不做电子/空穴分析步骤），选项3才能加载出来。这是什么原因呢？

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-16 11:07:20

cokie 发表于 2023-6-14 15:27
老师，在使用multiwfn3.8（dev）版本做IFCT时遇到了一个问题，载入fchk文件后，我先做了电子/空穴分析，道 ...

至少对于目前Multiwfn官网上最新版我没发现有此问题

输出信息都在此文件里：

out.txt (15.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

美泽虎 · 发表于 Post on 2023-6-22 12:14:43

老师们好！读了sob老师的《使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量》博文后获益匪浅，不过有一个小疑问希望可以得到指导。比如说我想得到水相下的简缩福井函数等量时，在N.gjf、N+1.gjf和N-1.gjf等用于产生.wfn文件的单点任务的Gaussian输入文件里面一般推荐加入scrf = SMD吗？还是加不加SMD最终计算得到的各种量都不会有明显变化？

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