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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2023-11-30 21:31:12 | 只看该作者 Only view this author
请问我想计算电荷转移距离和电子空穴重叠程度,http://sobereva.com/434这篇帖子中的D和Sm,Sr指数是用质量中心进行计算的?我想计算的体系不是纯有机体系,包含重金属原子,那使用质心是不是不太准确存在较大误差?是否该使用几何中心来进行计算?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-1 05:05:44 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2023-11-30 21:31
请问我想计算电荷转移距离和电子空穴重叠程度,http://sobereva.com/434这篇帖子中的D和Sm,Sr指数是用质量 ...

质心是指的空穴、电子分布的质心,不是体系的质心,跟原子的质量完全是两码事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-1 05:07:03 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2023-11-30 13:12
谢谢老师!!!请问老师
Shermo程序输出的
Principal moments of inertia (amu*Bohr^2):

不一定,取决于原子质量的设置,和ini文件里的defmass有关。默认情况下会是相同的(但由于坐标记录位数、单位转换系数等因素,会带来可忽略程度的差异)
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发表于 Post on 2023-12-5 10:01:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-1 05:05
质心是指的空穴、电子分布的质心,不是体系的质心,跟原子的质量完全是两码事

感谢sob老师的指导!

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发表于 Post on 2023-12-5 10:04:04 | 只看该作者 Only view this author
我想计算分子的NICS值 这是我在高斯中设置的关键词,已经按照sob老师的计算nics的帖子,用multiwfn找到了Bq的做表并粘贴在了末尾,但计算时报了如下错误,请问该如何解决?

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发表于 Post on 2023-12-5 14:26:45 | 只看该作者 Only view this author
老师您好。我使用PBE0/def2-tzvp分别计算了Dy(H2O)9和Yb(H2O)9配合物的npa电荷,分别设置了6和2的自旋多重度,都是+3价。结果发现价电子排布为: Dy 6S(0.54)4f(8.52)5d(0.78)6p(0.43)7S( 0.14)5f( 0.01)6d( 0.04); Yb 6S(0.13)4f(13.05)5d( 0.82)6p( 0.43)6d( 0.04)。为什么Dy离子的4f电子会减少,而6s轨道的电子增加很多?

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发表于 Post on 2023-12-5 20:24:00 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,请教下老师这篇文献的表面电荷分布图使用multiwfn可以做吗?谢谢老师

1701778970820.png (224.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 48)

1701778970820.png
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-6 07:31:27 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2023-12-5 20:24
卢老师您好,请教下老师这篇文献的表面电荷分布图使用multiwfn可以做吗?谢谢老师

这图明显就是Multiwfn作的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-6 07:32:16 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2023-12-5 10:04
我想计算分子的NICS值这是我在高斯中设置的关键词,已经按照sob老师的计算nics的帖子,用multiwfn找到了Bq ...

去掉D3设置
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sobereva 发表于 2023-12-6 07:31
这图明显就是Multiwfn作的

谢谢卢老师,请问老师有博文指个路吗?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-7 02:28:45 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2023-12-6 10:01
谢谢卢老师,请问老师有博文指个路吗?

这不算什么表面电荷分布,只不过用Multiwfn对体系特定截面作填色等值线图而已

看Multiwfn手册4.4节绘制各种平面图的巨量例子
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发表于 Post on 2023-12-7 09:54:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-7 02:28
这不算什么表面电荷分布,只不过用Multiwfn对体系特定截面作填色等值线图而已

看Multiwfn手册4.4节绘 ...

谢谢卢老师
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发表于 Post on 2023-12-13 09:32:03 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,MCI index是多中心键级吗?它和芳香性什么关系呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-15 21:58:32 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-12-13 09:32
sob老师您好,MCI index是多中心键级吗?它和芳香性什么关系呀?


看此文的介绍
衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算
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发表于 Post on 2023-12-18 15:21:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-15 21:58

看此文的介绍
衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算

谢谢sob老师

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