简单量子化学问题答疑专帖

xyz0101 · 发表于 Post on 2023-6-2 21:54:23

Gaussian用LS-CCSD(T)方法计算的输入文件该怎么写，之间输入LR-CCSD(T)的话，会出现这样的报错。

cokie · 发表于 Post on 2023-6-2 22:30:03

想请教各位老师，是否可以用RMSD值+基态/激发态的重组能来定性分析同一个分子在不同溶剂中量子产率不同的问题？这样是否合理呢

shiqingduo · 发表于 Post on 2023-6-2 22:37:02

请问有讲荧光量子产率计算的相关文献吗只想大概比较一下高低了解到有MOMA软件

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-3 00:03:56

xyz0101 发表于 2023-6-2 21:54
Gaussian用LS-CCSD(T)方法计算的输入文件该怎么写，之间输入LR-CCSD(T)的话，会出现这样的报错。

别胡编乱造关键词，支持什么方法、支持的方法怎么写好好看手册

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-3 00:11:02

shiqingduo 发表于 2023-6-2 22:37
请问有讲荧光量子产率计算的相关文献吗只想大概比较一下高低了解到有MOMA软件

老生常谈的问题，论坛里讨论过无数遍，去论坛首页全文搜索框搜

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-3 00:11:37

cokie 发表于 2023-6-2 22:30
想请教各位老师，是否可以用RMSD值+基态/激发态的重组能来定性分析同一个分子在不同溶剂中量子产率不同的问 ...

光靠这个说明不了

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-3 00:14:21

liustone 发表于 2023-6-2 17:00
请教一下，在过渡态搜索和反应动力学计算时计算反应能垒的活化能时，同样的A+B->TST的计算，我们是使用过渡 ...

“A-B双分子系统的最低自由能”指代不明
如果你就当双分子反应计算，减去A和B各自自由能之和，计算A和B的时候一般情况使用A和B各自自由能最低构象的自由能（如果有明显竞争的构象，计算权重平均值，其中也考虑构象熵）

cokie · 发表于 Post on 2023-6-3 00:32:09

sobereva 发表于 2023-6-3 00:11
光靠这个说明不了

谢谢老师，我是想说RMSD值和基态/激发态的重组能，可以作为解释量子产率不同的其中两个佐证吗？（并非只靠这两点来解释），还是说对于量子产率来说，这两点完全无法当作论据呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-3 00:50:28

liustone 发表于 2023-6-2 10:00
请教一下，在过渡态搜索和反应动力学计算时计算反应能垒的活化能时，同样的A+B->TST的计算，我们是使用过渡 ...

不一定，参见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 4&fromuid=21811

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-3 00:51:27

xyz0101 发表于 2023-6-2 14:54
Gaussian用LS-CCSD(T)方法计算的输入文件该怎么写，之间输入LR-CCSD(T)的话，会出现这样的报错。

到底是想问LS还是LR？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-3 01:21:33

本帖最后由 wzkchem5 于 2023-6-2 18:24 编辑

cokie 发表于 2023-6-2 17:32
谢谢老师，我是想说RMSD值和基态/激发态的重组能，可以作为解释量子产率不同的其中两个佐证吗？（并非只 ...

影响量子产率的因素太多了。
荧光量子产率（为叙述方便起见，假设从S1发荧光）等于辐射跃迁速率/(辐射跃迁速率+非辐射跃迁速率)；
辐射跃迁速率正比于S1-S0跃迁偶极矩的模平方（对于偶极禁阻或接近禁阻的跃迁，还需要考虑H-T效应，这个就比较复杂了）；
非辐射跃迁速率里面，IC速率和S1-S0 NACME的模平方正相关，和S1激发能负相关，和S1-(S0/S1 CI)的RMSD负相关，和S1-S0重组能、RMSD有一定关系但比较复杂（由Marcus理论易知，视反应总deltaG大小而定，重组能、RMSD越小，反应速率既有可能变小，也有可能变大，因为Marcus理论的活化自由能(lambda+deltaG)^2/(4lambda)不是重组能lambda的单调函数）；
ISC速率（为方便叙述起见假设只ISC到T1，实际上这一点很多时候不成立，T2等态经常有贡献）正比于S1-T1 SOCME的模平方，和S1-T1 gap负相关，和S1-(S1/T1 MECP)的RMSD负相关，和S1-T1重组能、RMSD有一定关系但比较复杂（原因同上）。
由此可知，你要用单一因素解释量子产率的差别，必须得举出证据说其他的那一大堆因素的差别都可以忽略不计。何况你选的RMSD、重组能，跟量子产率之间还不是单调关系，即使把其他变量都控制了，也不能确切地知道RMSD、重组能大是会让量子产率高还是低（不要拿个别体系的非普适结论说事，查足够多的文献总能查到跟你想的规律相反的例子，因为f(x)=(x+a)^2/x本来就不是单调函数，有的课题组一辈子只在这个函数的一个单调分支上做研究，得到所谓的构效关系，并不适用于这个函数的另一个单调分支。好比电子转移速率，Marcus正常区里的结论不适用于反转区；做催化体系的构效关系，火山图的一个斜坡上的结论不适用于另一侧的斜坡）。
所以我个人的建议是，老老实实把以上所有因素分析一遍，弄清楚轻重主次，计算发现主要影响因素是哪个，就用哪个来解释。不要随便挑一个因素然后假设它是主要因素，把其他因素都忽略。

liustone · 发表于 Post on 2023-6-3 09:17:53

sobereva 发表于 2023-6-3 00:14
“A-B双分子系统的最低自由能”指代不明
如果你就当双分子反应计算，减去A和B各自自由能之和，计算A和B ...

好的，谢谢老师，我所说的A-B双分子系统的最低自由能是指双分子系统经构型搜索和结构优化后的能量，即当成了复合反应物，如果我是计算一般的双分子合成反应A+B->C，是否不应该使用过渡态活化能-复合反应物活化能的方式计算。

xyz0101 · 发表于 Post on 2023-6-3 09:29:00

wzkchem5 发表于 2023-6-3 00:51
到底是想问LS还是LR？

LR-CCSD(T)

liustone · 发表于 Post on 2023-6-3 09:32:01

wzkchem5 发表于 2023-6-3 00:50
不一定，参见http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=redirect&goto=findpost&ptid=37555&pid=249614&from ...

好的，谢谢您，我先按照双分子反应去计算看看能垒情况。

snljty2 · 发表于 Post on 2023-6-3 11:07:33

shiqingduo 发表于 2023-6-2 22:37
请问有讲荧光量子产率计算的相关文献吗只想大概比较一下高低了解到有MOMA软件

软件名拼错了。

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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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