简单量子化学问题答疑专帖

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-1 21:16:53

liustone 发表于 2023-6-1 14:14
各位老师好，请问在做过渡态搜索和反应计算时，是溶剂体系，使用了水作为隐式溶剂，援引sob老师的动力学计 ...

对，此处的液相就是指的溶液相。但是假如反应涉及水的话，需要注意水的标准态问题

cokie · 发表于 Post on 2023-6-1 21:46:08

本帖最后由 cokie 于 2023-6-1 22:30 编辑

老师好，想请问一下，考察两个电子态之间的重组能（比如S0和S1），

1.用“四点法”是不是可以直接用“E激发-E发射”来得到重组能？
2.还是说依然是S0/S1中性的单点能，以及和S0-/S1-电荷的单点能这么来算呢？如果是这种方法，电子态的多一个负电荷这种状态该怎么理解呢？并没有从外部得到/失去电子，分子一直整体是电中性的呀。

P.S.修改：在拜读（http://bbs.keinsci.com/thread-35003-2-1.html）中的讨论后，我大致明白了，还是应该用法2来得到，而电子态多一个负电荷的理解，应该是理解为在“单分子构筑的凝聚态里的电荷转移”。这样的理解是否正确呢

吴双 · 发表于 Post on 2023-6-1 21:48:27

想跟大家请教一下，我用高斯计算了催化剂对于氢气和环己酮的吸附能，对于环己酮的吸附能为-1.81eV，对于氢气的吸附能为-1.34 eV，想解释一下催化剂对于这两种物质吸附强度的差异，可以从哪些方面描述呢。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-1 21:59:50

本帖最后由 wzkchem5 于 2023-6-1 15:05 编辑

吴双发表于 2023-6-1 14:48
想跟大家请教一下，我用高斯计算了催化剂对于氢气和环己酮的吸附能，对于环己酮的吸附能为-1.81eV，对于氢 ...

没法解释。这两个分子差异太大了，如果把吸附能拆成很多项（静电，色散，极化，电荷转移，配位键，反馈键，共价键，位阻……）的贡献，会发现两个分子的每一项都差很多，提炼不出来主要原因。
比如你要解释为什么100+10 > 101+5，可以说因为10>5；但是要解释100+10+2 > 101+9+1，怎么解释？主要原因是10>9还是2>1？没法讲。如果说是10>9和2>1两个因素决定的，那别人又问了，如何解释100+10+2并不大于102+9+1？等于你解释的时候还得说：10比9大出来的量，加上2比1大出来的量，和100比101小的量相比要大。但是这是一句正确的废话，等于把结果复述了一遍，不叫解释。
再举个例子，你这个月拿了3000的奖学金，校门口饭馆服务员一个月挣2950，如何解释你挣得比服务员多？没法解释，影响因素太多，有的是正影响有的是负影响，正负抵消出来的一个结果，没法解释为什么是正的或者负的。你要是解释说因为你学历高，下个月服务员涨工资到3050，你奖学金没变，就打脸了。

liustone · 发表于 Post on 2023-6-1 22:22:32

wzkchem5 发表于 2023-6-1 21:16
对，此处的液相就是指的溶液相。但是假如反应涉及水的话，需要注意水的标准态问题

好的，谢谢您

liustone · 发表于 Post on 2023-6-1 22:24:30

请问如果通过高斯计算A+B=C合成反应的标准吉布斯自由能，应该用物质C的吉布斯自由能减去A和B的自由能，还是应该减去最低能量的A-B双分子系统的吉布斯自由能？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-1 23:53:34

本帖最后由 wzkchem5 于 2023-6-1 16:54 编辑

liustone 发表于 2023-6-1 15:24
请问如果通过高斯计算A+B=C合成反应的标准吉布斯自由能，应该用物质C的吉布斯自由能减去A和B的自由能，还是 ...

按照定义，吉布斯自由能变指的是产物减去反应物。所以如果反应式写作A+B -> C，就按G(C)-G(A)-G(B)算；如果反应式写作A-B -> C，按G(C)-G(A-B)算

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-2 01:28:00

吴双发表于 2023-6-1 21:48
想跟大家请教一下，我用高斯计算了催化剂对于氢气和环己酮的吸附能，对于环己酮的吸附能为-1.81eV，对于氢 ...

这种事起码把优化过的吸附后的结构图贴出来、元素都体现清楚，并且完整交代所有计算细节，并且描述清楚到没有歧义的程度，比如吸附能是对应电子能量还是什么热力学量的变化。没人愿意猜着回答，否则花半天时间打字，最后没有一条真正对应实际情况的，白浪费双方的时间

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

qinyuanyuan · 发表于 Post on 2023-6-2 10:59:34

wzkchem5 发表于 2023-6-1 21:02
esu是一系列单位的统称（https://en.wikipedia.org/wiki/Centimetre%E2%80%93gram%E2%80%93second_system ...

太抱歉了，我打错字了，我想问esu cm和esu之间需要转换吗？谢谢您百忙之中的回复，期待~

qinyuanyuan · 发表于 Post on 2023-6-2 11:05:19

wzkchem5 发表于 2023-6-1 21:02
esu是一系列单位的统称（https://en.wikipedia.org/wiki/Centimetre%E2%80%93gram%E2%80%93second_system ...

很抱歉，我打错字了，我想问esu cm和esu之间需要转换吗？怎么转换？感谢您百忙之中的回复，期待~万分感谢

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-2 11:20:19

cokie 发表于 2023-6-1 21:46
老师好，想请问一下，考察两个电子态之间的重组能（比如S0和S1），

1.用“四点法”是不是可以直接用“E ...

把博文里带电荷态改成S1态就完了。带电荷态是UKS计算的相应状态的基态，而S1态是TDDFT计算的激发态，差异仅此而已。写文章的时候为避免任何可能的混淆或歧义，把计算公式在文中给明。

liustone · 发表于 Post on 2023-6-2 14:00:09

wzkchem5 发表于 2023-6-1 23:53
按照定义，吉布斯自由能变指的是产物减去反应物。所以如果反应式写作A+B -> C，就按G(C)-G(A)-G(B)算；如 ...

谢谢您，应该按照物化定义减去反应物单独的能量。
另外请教一下，在过渡态搜索和反应动力学计算时计算反应能垒的活化能时，同样的A+B->TST的计算，我们是使用过渡态的自由能减去了A-B双分子系统的最低自由能作为活化能是否合理？我们认为溶液环境中两个待反应分子相互靠近至稳定状态的过程不属于反应至能垒的过程。

cokie · 发表于 Post on 2023-6-2 14:18:03

sobereva 发表于 2023-6-2 11:20
把博文里带电荷态改成S1态就完了。带电荷态是UKS计算的相应状态的基态，而S1态是TDDFT计算的激发态，差异 ...

明白了，谢谢老师

liustone · 发表于 Post on 2023-6-2 17:00:30

请教一下，在过渡态搜索和反应动力学计算时计算反应能垒的活化能时，同样的A+B->TST的计算，我们是使用过渡态的自由能减去了A-B双分子系统的最低自由能作为活化能是否合理？我们认为溶液环境中两个待反应分子相互靠近至稳定状态的过程不属于反应至能垒的过程。

qinyuanyuan · 发表于 Post on 2023-6-2 18:29:21

wzkchem5 发表于 2023-6-1 21:02
esu是一系列单位的统称（https://en.wikipedia.org/wiki/Centimetre%E2%80%93gram%E2%80%93second_system ...

您好，很抱歉，是我写错了，我想问esu cm和esu之间需要转换吗？目前确定的是1a.u.=2.54175*10-18esu那是不是1a.u.=2.54175*10-18esu cm?

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