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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-9-24 12:42:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-24 03:42
Gaussian不支持wB97M-V

如果涉及到C-Cl和Fe-N的BDE对比的话,为了权衡考虑,建议Gaussian用户用MN15, ...

感谢老师
道友请留步

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2207#
发表于 Post on 2023-9-25 15:00:51 | 只看该作者 Only view this author

Error termination request processed by link 9999.

我在过渡态搜索时总是出现  Error termination request processed by link 9999.请问我要怎么解决这个问题。还是我结构有问题,这个就是次碘酸被过硫酸氢钾氧化

opt_T1-1.gjf

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opt_T1-1.zip

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发表于 Post on 2023-9-25 15:04:31 | 只看该作者 Only view this author
-- Number of steps exceeded,  NStep=  42

link 9999要在前面找原因

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发表于 Post on 2023-9-25 15:07:31 | 只看该作者 Only view this author
Deepast 发表于 2023-9-25 15:04
link 9999要在前面找原因

那请问我这个该怎么办

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发表于 Post on 2023-9-25 15:41:51 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2023-9-25 16:09:14 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-9-23 01:59
请教各位老师,集群上安装的ORCA不能不能跑多核任务,输入命令ompi_info后显示出图片问题,在环境变量里面 ...

可以在orca论坛的Installation板块搜类似报错
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-9-25 16:52:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-25 16:09
可以在orca论坛的Installation板块搜类似报错

好的,谢谢王老师~

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发表于 Post on 2023-9-25 16:52:29 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,怎么看出来自旋相反呢?

202309251652083771..png (92.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

202309251652083771..png

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发表于 Post on 2023-9-25 18:29:22 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-9-25 09:52
请教各位老师,怎么看出来自旋相反呢?

等值面的两种颜色,一个代表正值,一个代表负值。因为这是自旋密度图,所以两个碳原子的等值面颜色不同就代表这两个碳原子上的自旋方向相反,一正一负
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2023-9-25 19:12:11 | 只看该作者 Only view this author
老师,我当前想讨论不同溶液两个分子A,B[这两个分子是同分异构体,唯一区别是在于A内含有一个分子内氢键;而B含有两个分子内氢键]内的氢键
当前按照计算分子内氢键键能的几种方法 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)所提及的第二种方式[使用Molecular Tailoring Approach方法估计内氢键键能]来计算。
但是在计算过程中有一些疑惑:
1.当前这个方法[Molecular Tailoring Approach]能否用于比较不同溶液下的氢键键能?
2.对于B分子中的两个氢键键能Eh1,Eh2能直接加和视为整体的氢键能?
3.是否还有其他方式能够用于比较溶液环境下不同氢键键能强度?(能量分解等方式适合分子内氢键么?)

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发表于 Post on 2023-9-25 20:24:13 | 只看该作者 Only view this author
@CHQ啦 发表于 2023-9-25 15:07
那请问我这个该怎么办

谢谢

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发表于 Post on 2023-9-25 23:00:46 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,有机共轭双自由基,π桥桥连两个自由基中心,UDFT计算表明alpha-SOMO和beta-SOMO分别分布在两个自由基中心上,请问产生这种现象是因为electron correlation (Coulombic repulsion)吗,有点不太理解,恳请各位老师赐教

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发表于 Post on 2023-9-26 12:09:43 | 只看该作者 Only view this author
急求自由能计算数值异常问题

使用B3LYP/SDD/6-31G*优化与B3LYP-D3BJ/SDD/6-311+G**/SMD(toluene)进行溶剂化计算出的单点能相差不大,但是在溶剂化条件校正后的自由能与在初始优化条件下的自由能相差巨大(20kcal)。(热力学校正是用Shermo读的,T=373.15K),不知道问题出在哪里

附上出现异常的log文件,急 感谢各位老师🙏(注:MTS13为M13与Alk反应的过渡态)

logfile.zip

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-26 13:44:13 | 只看该作者 Only view this author
M107 发表于 2023-9-26 12:09
急求自由能计算数值异常问题

使用B3LYP/SDD/6-31G*优化与B3LYP-D3BJ/SDD/6-311+G**/SMD(toluene)进行溶 ...

都看不懂你要问什么
光是第一句话就很莫名其妙。B3LYP/SDD/6-31G*和B3LYP-D3BJ/SDD/6-311+G**/SMD(toluene)算的单点能根本没有任何可比性,比较能量的时候计算级别必须严格相同。不同级别算的自由能也同样没有任何可比性。
分清楚kcal和kcal/mol
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2023-9-26 14:23:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-26 13:44
都看不懂你要问什么
光是第一句话就很莫名其妙。B3LYP/SDD/6-31G*和B3LYP-D3BJ/SDD/6-311+G**/SMD(tolue ...

抱歉表达的有些问题。

对比的均为TS13-M13的Free Energy,但是溶剂化的数据出现了虚高,不知道是什么原因。给您添麻烦了实在抱歉……

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