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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-12-27 15:39:03 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-12-27 15:24
您好,构造初猜波函数的时候使用了stable=opt,得到的双自由基结构= 0.9968,这样应该就可以说明是自旋极 ...

是的。
我建议你可以尝试用你优化出的双自由基结构为起点,然后进行C-C键键长逐渐缩短的扫描

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发表于 Post on 2023-12-27 16:04:16 | 只看该作者 Only view this author
ionexchangeC 发表于 2023-12-27 15:39
是的。
我建议你可以尝试用你优化出的双自由基结构为起点,然后进行C-C键键长逐渐缩短的扫描

您好,您说的方法我也尝试了,扫描结果在附件里,仍然没有出现拐点。随着扫描键长的缩短,反而还得到了其他不想要的结构

scan-C3.zip

5.78 MB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2023-12-27 18:37:33 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-12-27 16:04
您好,您说的方法我也尝试了,扫描结果在附件里,仍然没有出现拐点。随着扫描键长的缩短,反而还得到了其 ...

优化的结果能上传吗

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发表于 Post on 2023-12-28 09:00:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 糖糖糖豆9988 于 2023-12-28 09:11 编辑
ionexchangeC 发表于 2023-12-27 18:37
优化的结果能上传吗

您好,您指的是双自由基优化的结果吗?

roC3.zip

320.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-28 10:24:34 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2023-12-26 15:37
老师好,我想计算图中标绿色的键的键能。优化好了该 中性 复合物的结构。从复合物中提取了片段的结构,计算 ...

M06-2X/def2-TZVP
0 2
那叫自旋多重度
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-12-28 12:17:31 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-12-28 09:00
您好,您指的是双自由基优化的结果吗?

减小扫描的步长(比如0.01埃,0.005埃)再试

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发表于 Post on 2023-12-28 13:19:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 糖糖糖豆9988 于 2023-12-28 13:29 编辑

请问各位老师,高斯计算任务正常结束,但是.out文件在gaussview打开时候显示图片内容,这如何解决呢?.out文件可以在编辑器打开,从out文件检索Standard orientation或Input orientation,最后就可以找到优化后的坐标了吧?谢谢

202312281319247504..png (14.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

202312281319247504..png

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发表于 Post on 2023-12-28 13:20:07 | 只看该作者 Only view this author
ionexchangeC 发表于 2023-12-28 12:17
减小扫描的步长(比如0.01埃,0.005埃)再试

我扫描的步长是0.05埃米,我再试试您说的步长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-29 04:18:52 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-12-28 13:19
请问各位老师,高斯计算任务正常结束,但是.out文件在gaussview打开时候显示图片内容,这如何解决呢?.out ...

如果GaussView版本太老,可能是和Gaussian版本兼容性原因,或者GaussView的bug
如果只需要坐标,自行提取即可
也可以尝试用gview打开fch文件,或许不会有这个问题
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发表于 Post on 2023-12-30 00:01:19 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我在计算了分子振动光谱以后,得到了如下数据
  1. Energy =      0.0000 cm^-1: |0> -> |0>
  2.    -> Intensity = 0.6878E+05 (DipStr =  1.593    )

  3. Energy =     23.1485 cm^-1: |0> -> |6^1>
  4.    -> Intensity =  5797.     (DipStr = 0.1343    )

  5. Energy =     29.7413 cm^-1: |0> -> |8^1>
  6.    -> Intensity =  7099.     (DipStr = 0.1643    )

  7. Energy =     45.7239 cm^-1: |0> -> |13^1>
  8.    -> Intensity = 0.1430E+05 (DipStr = 0.3308    )

  9. Energy =    217.1448 cm^-1: |0> -> |39^1>
  10.    -> Intensity = 0.1255E+05 (DipStr = 0.2872    )

  11. Energy =   1556.0355 cm^-1: |0> -> |236^1>
  12.    -> Intensity = 0.1406E+05 (DipStr = 0.2994    )
复制代码


每个能量后面都是^1,这代表这五个模式都是属于0-1跃迁吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-30 05:35:54 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2023-12-30 00:01
老师您好,我在计算了分子振动光谱以后,得到了如下数据

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发表于 Post on 2023-12-30 22:04:46 | 只看该作者 Only view this author
Orca和g16联用的计算速度比纯g16慢,也比纯orca慢,有哪些可能的原因?

我用的是超算,一个节点上2个CPU,每个CPU有20个核。按照orca和gaussian联用的帖子上说的,为了保证串行计算,我设置一个任务的核数是20核。会不会是20核这个核数设置不对的原因,所以联用速度慢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-31 10:25:58 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2023-12-30 22:04
Orca和g16联用的计算速度比纯g16慢,也比纯orca慢,有哪些可能的原因?

我用的是超算,一个节点上2个CPU ...

读懂联用脚本的执行原理,根据实际情况判断可能原因。我不用超算,也不知道具体运行环境,没法判断。
将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/422http://bbs.keinsci.com/thread-10141-1-1.html
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发表于 Post on 2023-12-31 14:44:24 | 只看该作者 Only view this author

gaussian结构优化一半出现错误,求问怎么回事?


使用的是DFT,B3lyp/6-31g(d,p) 加上色散矫正。

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发表于 Post on 2023-12-31 20:14:16 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian 常见报错及解决方法
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

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